根據酶的來源及其在血清中發揮催化功能的情況，可將血清酶分為兩大類。
（一）血漿特異酶
在血漿中發揮特定催化作用的酶。如凝血酶、膽堿酯酶（CHE）、脂蛋白脂肪酶、銅氧化酶等。
它們大多數在肝內合成，在血漿中的濃度甚至超過器官細胞內濃度。有的可以作為肝功能試驗的一部分。
血漿特異酶活性的改變，除了反映血液功能外，還反映來源器官的功能。
（有少部分酶在細胞合成后分泌到血液中行使其功能，如凝血因醫學教育·網整理子及有關的纖溶因子。它們以酶原狀態分泌人血，在一定的條件下被激活，引起相應的生理或病理變化。）
（二）非血漿特異酶
在血漿中濃度很低，且無功能，分為兩種。
1.分泌酶：
來源于消化腺或其他外分泌腺的酶。如α～淀粉酶（AMY）、前列腺酸性磷酸酶（ACP）、脂肪酶（LPS）、胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、ALP等。
正常體液中外分泌酶活性低而穩定，不發生催化作用。
在血液中的濃度和其分泌腺體的功能活動和疾病有關，來源增醫學教育網整理加或排泄受阻時，血漿中此類酶活性增高。例如，急性胰腺炎時，血淀粉酶就會升高。
2.代謝酶：（細胞酶）
在細胞內發揮催化功能的酶。醫學教育|網搜集整理正常時這些酶存在于組織細胞中，血漿中酶活性很低。細胞內、外濃度差異懸殊。
當酶來源的組織細胞發生病變，細胞膜通透性增加或細胞壞死時，細胞內酶大量進入血漿，導致血漿酶活性顯著增高。其下降的臨床意義很少。
這一類酶臨床應用較多，如轉氨酶、乳酸脫氫酶、肌酸激酶等，它們在肝病、心臟疾病時都可能出現變化。