（1）糖蛋白攜帶某些蛋白質代謝去向的信息。糖蛋白寡糖鏈末端的唾液酸殘基，決定著某種蛋白質是否在血流中存在或被肝臟除去的信息。
A.脊椎動物血液中的銅藍蛋白。肝細胞能降解丟失了唾液酸的銅藍蛋白，唾液酸的消除可能是體內“老”蛋白的標記方式之一。
B.紅細胞。新生的紅細胞膜上唾液酸的含量遠高于成熟的紅細胞膜。用唾液酸酶處理新生的紅細胞，回注機體，幾小時后全部消失。而末用酶處理的紅細胞，回注幾天以后，仍能在體內正常存活。
（2）寡糖鏈在細胞識別、信號傳遞中起關鍵作用。淋巴細胞正常情況應歸巢到脾臟，而切去唾液酸后，結果競歸巢到了肝臟。在原核中表達的真核基因，無法糖基化。
糖蛋白可以是胞溶性的，也可以是膜結合型的，可以存在于細胞內在也可存在于細胞間質中。糖蛋白在動植物中較為典型，脊柱動物中糖蛋白尤為豐富，金屬轉運蛋白(轉鐵蛋白)、血銅藍蛋白，凝血因子、補體系統、一些激素，促卵泡素(Follicle-stimulating hormone, FSH，前腦下垂體分泌，促進卵子和精子的發育)、RNase、膜結合蛋白(如動物細胞膜的Na+-K+-ATPase)、主要組織相容性抗原(major histocompatibility antigen),細胞表面上介導供體器官與受體器官交叉匹配的標識)。絕大多數糖蛋白的寡糖是糖蛋白的功能中心。有些糖蛋白的糖對于糖蛋白自身成機體起著保護作用或潤滑作用，如牛的RNaseB(糖蛋白)對熱的抗性大于RNaseA，大量的唾液酸能增強唾液粘蛋白的粘性從而增強唾液的潤滑性。南極魚抗凍蛋白的糖組分能與水形氫鍵，阻止冰晶的形成從而提高了抗凍性。糖蛋白在細胞間信號傳遞方面著更為復雜的作用。Hiv的靶細胞結合蛋白GP120是一個糖蛋白，能與人類靶細胞表面的CD4受體結合從而附著在靶細胞表面，如果去掉GP120的糖部分則不能與CD4受體結合從而失去感染能力。細胞表面的糖蛋白形成細胞的糖萼(糖衣)、參與細胞的粘連，這在胚和組織的生長、發育以及分化中起著關鍵性作用。