1.感染
是引起角膜炎的最常見原因，病原微生物包括細菌（如肺炎雙球菌、金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、綠膿桿菌、淋球菌等）、病毒（單純皰疹病毒、腺病毒等）、真菌、棘阿米巴原蟲、支原體、衣原體、梅毒螺旋體等。通常是在合并角膜上皮細胞的損傷、脫落或機體抵抗力下降時才致病。角膜上皮遭受損傷后極容易發生感染性炎癥。因此角膜異物、角膜擦傷、不正確使用角膜接觸鏡、眼部接觸污染的藥物或水源等是感染性角膜炎的常見易感因素，糖尿病、營養不良、慢性消耗性疾病患者，也會因抵抗力下降而易患角膜炎。
2.內因
指來自全身的內因性疾患。如一些自身免疫性疾病，或其他一些全身疾病（如維生素A缺乏、三叉神經損害）波及角膜。
角膜沒有血管，所以急性傳染病不易侵及角膜。可是角膜組織卻參與全身的免疫反應，盡管其免疫反應的程度較其他組織的為低，但是正因為它沒有血管，新陳代謝較為遲緩，才使這種免疫反應變化持續經久，角膜在較長時間內處于一種敏感狀態，以致容易發生變態反應性疾患，如泡性角膜炎等。
內因性角膜炎常發生在角膜基質層，一般不引起角膜潰瘍。
3.鄰近組織蔓延
由于胚胎學上的同源關系以及解剖學上的連續性，蔓延到角膜上皮層。疾患多來自結膜，如嚴重的結膜炎多合并淺層角膜炎。