需與良性淋巴上皮病，轉移性未分化癌、惡性淋巴瘤相鑒別。與良性淋巴上皮病鑒別，主要在上皮島的細胞學特點，惡性上皮細胞異形性更明顯，核分裂相更常見。良性則不然。與惡性淋巴瘤鑒別：惡性淋巴上皮病惡性部分是上皮病變細胞異形部分而不是淋巴組織。與轉移性未分化癌鑒別：應常規全面檢查上呼吸道，消化道、鼻咽部。與鼻咽癌鑒別：從組織病理表現應和鼻咽癌轉移區別，但僅從病理分析是極其困難的，臨床檢查必須仔細。
