谷子單倍體型圖譜及全基因組關聯分析研究出爐

發布時間：2013-07-01 07:21 原文鏈接：谷子單倍體型圖譜及全基因組關聯分析研究出爐

　　由中國農科院作物所、中科院上海生科院植生生態所國家基因中心、中科院遺傳發育所等8家單位合作，在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和大量農藝性狀的全基因組關聯分析，該成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遺傳學)發表，標志著我國在谷子遺傳學研究領域取得了重要的突破。

　　谷子，又稱為粟，脫殼后為小米，是起源于我國的古老作物，在我國北方有超過萬年的栽培史。谷子基因組較小(~515Mb)，二倍體且自花授粉，具有突出的抗旱、耐瘠薄和高光效(C4)特性，是很有發展潛力的旱生禾谷類模式作物。盡管我國擁有占世界存量80%的谷子品種資源，但是長期以來，基于這些重要資源的遺傳學研究還較少，限制了人們對谷子基因資源的高效發掘和深度利用。

　　研究者利用在水稻基因組學研究中開發的技術和分析方法，對 916份谷子品種(包括農家品種和育成品種)開展了全基因組低倍重測序和序列分析，構建出一張精細的谷子單倍體型圖譜。該研究在5個不同緯度環境下(朝陽、北京、長治、安陽、三亞)考察了這些谷子品種的株型、產量、花期、抗病性等47個農藝性狀，并采用全基因組關聯分析方法鑒定到了512個控制這些性狀的遺傳位點。

　　同時，該研究還鑒定到谷子品種改良過程中受到選擇的基因組位點(selective sweep)，包括控制落粒性的已知基因qSH1。此外，該研究還對谷子的野生種青狗尾巴草作了全基因組序列組裝，并與谷子基因組作了比較，為將來的谷子馴化研究提供了基礎。這些成果為谷子的遺傳改良及基因發掘研究提供了海量的基礎數據信息，豐富了禾谷類作物比較遺傳學、功能基因組學的研究內容和體系架構，同時也將對未來禾谷類作物的品種改良、能源作物的遺傳解析產生影響。