象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展

中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華南植物園教授葛學軍和法國農業科學中心教授Mathieu Rouard參與該項工作。

象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產于中國云南和東南亞地區，具有重要的觀賞、飼用和藥用價值。研究人員采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結合染色體構像捕獲技術，發表了首個象腿蕉染色體級別的基因組序列，長度為481.5 Mbp，完整性較高（BUSCO 98.3%），注釋獲得36,836個編碼基因，重復序列約占基因組的55%。

象腿蕉與芭蕉屬代表物種的比較基因組學研究發現，象腿蕉的長末端重復序列的組成及其插入時間，與芭蕉科其他物種均有差異，芭蕉屬比象腿蕉屬有更多Copia，象腿蕉LTR插入時間（峰值3.5–5 Mya）比芭蕉屬物種（峰值2 Mya）更古老，還發現芭蕉科在9和11染色體基數進化過程中復雜多樣的染色體重組事件。該研究結果為蕉類作物保育和改良提供重要的基因組資源。

該研究工作得到了華南植物園海外知名學者項目、國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金的資助。