鑒別診斷
從影像方面考慮，須同骨巨細胞瘤鑒別診斷，但僅在成人期，因為如果生長軟骨仍存在時，骨巨細胞瘤不侵及骨骺，兩者之間一個重要的不同之處是軟骨母細胞瘤常有清楚的邊界，而骨巨細胞瘤的邊界模糊，第二個不同之處是軟骨母細胞瘤中可有云翳狀鈣化。在組織學上，即使在缺乏鈣化和軟骨樣分化、巨細胞豐富的區域，軟骨母細胞瘤也可清楚地與骨巨細胞瘤區分開，因為軟骨母細胞瘤的基底細胞有更明確的邊界，有些象嵌合體碎片，巨細胞分布不規則，主要集中于出血區，有絲分裂像少見。
影像上，軟骨母細胞瘤與透明細胞性軟骨肉瘤很相似，包括鈣化。這些軟骨肉瘤見于成人，在組織學上可清楚地與軟骨母細胞瘤區分開。
少見的位于骨骺的軟骨瘤或中心性軟骨肉瘤在影像方面可類似于軟骨母細胞瘤，但它們的大體病理和組織病理不同。
并發癥
浸潤周圍軟組織，內瘤組織侵犯血管和形成轉移。