SARS-CoV-2 B.1.617譜系于2020年10月在印度出現,此后,它在印度的一些地區占據主導傳播,并進一步傳播到其他國家。該譜系包括三個主要亞型(B1.617.1、B.1617.2和B.1.617.3),并且在N端結構域(NTD)和受體結合域(RBD)存在不同的Spike蛋白突變,增加了逃逸的可能性。因此,B.1.617.2變種被認為比其他變種傳播得更迅速。
B.1.617.2的特點是Spike蛋白中存在9個突變,這些突變可能會改變病毒與受體的結合,并逃避免疫反應。SARS-CoV-2病毒變異(VOCs)的突變增加了個體間的傳播,已經取代了原始菌株。
ACE2受體主導了病毒融合和進入,成為中和抗體目標。第一個確定的變體包括D614G突變,它增強了病毒的傳染性。隨后VOCs出現在多個國家。B.1.1.7變體首次在英國被發現,B.1.351在南非,P.1系在巴西。它們攜帶增強Spike蛋白對ACE2親和力的突變體,如N501Y,在三個變異體K417N/T、B.1.351和P.1中發現。RBD中的抗體逃逸突變體包括在B.1.351和P.1中發現的E484K,另一個B.1.247/B.1.429變體最初是在加利福尼亞州發現的。
5月27日,法國巴斯德研究所的研究人員發表在預印本biorxiv上的研究顯示:輝瑞疫苗似乎可以預防印度病毒株,但是效果一般。
Delphine Planas et al, Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals,BioRxiv(2021).DOI:10.1101/2021.05.26.445838
研究人員從一名印度返回的旅行者身上分離到了B.1.617.2變種,并檢測了B.1.617.2變種對具有單克隆抗體(mabs)的人、新冠恢復期的患者、疫苗接種者血清中抗體的敏感性。單克隆抗體是由單一B細胞克隆產生的高度均一、僅針對某一特定抗原表位的抗體。B.1.617.2變種對某些單克隆抗體的中和有抵抗力,包括禮來單克隆抗體治療藥物bamlanivimab與B.1.617.2 Spike蛋白的結合容易受影響。
當癥狀出現后12個月內收集到康復期病人和輝瑞疫苗接種者的血清,結果發現:對B.1.617.2的有效力比B.1.1.7(英國發現的變異體)低3~6倍。接受了一劑阿斯利康疫苗人的血清中,幾乎沒有成功預防B.1.617.2變異體。
在此,研究人員評估了B.1.617.2分離株對NTD和Spike 受體結合區域的敏感性,包括4種已經臨床批準的疫苗,并檢測了恢復期個體和疫苗接種者血清中的中和力。結果發現變種在細胞外圍修改了ACE2結合區域,以逃避抗體識別,并與ACE2進行有效結合。初步實驗顯示,在B.1.617.2感染的細胞中存在著很大的合胞體。
研究人員研究了mAbs對已經存在的SARS-CoV-2病毒和疫苗接種者的B.1.617.2的交叉反應。報告顯示:一些單克隆抗體治療藥物,不能再中和B.1.617.2變體。
B.1.617.2對自然免疫的人的血清不太敏感。與B.1.1.7相比,在康復期第6個月(M6)取樣的血清對B.1.617.2的效力下降了4倍,這種下降的程度與另一種B.1.351觀察到的相似。在第二批康復者中(M12),B.1.617.2、B.1.1.7的半數有效劑量(ED50)下降了6倍。然而,對康復期個體的疫苗接種,使所有變體的體液免疫反應提高了130多倍。這些結果表明,對以前受感染的人進行疫苗接種很有可能對大量流行病毒株(包括B.1.617.2)具有預防作用。
在接種后的8周和16周取樣時,接種兩劑輝瑞疫苗對B.1.1.7、B.1.351和B.1.617.2產生了較高的血清中和水平,這些人以前沒有感染過新冠病毒。在接種單劑量阿斯利康疫苗10周后,75%的血清中和了B.1.1.7,而只有不到10%的血清中和了B.1.351和B.1.617.2。中和抗體水平可以高度預測對有癥狀的SARS-CoV-2感染的免疫保護。
SARS-CoV-2 D614G、B.1.1.7、B.1.351和B.1.617.2變異株對恢復期患者和疫苗接種者血清的敏感性
最近的一份報告分析了英格蘭無癥狀病例,并估計疫苗對B.1.617.2感染的影響,與B.1.1.7相比,在接種1劑阿斯利康疫苗后,對B.1.617.2的有效性(33.5%)明顯低于B.1.1.7(51%)。據估計,阿斯利康和輝瑞疫苗對B.1.617.2的兩劑量有效性分別為60%和88%。因此,阿斯利康疫苗誘導的抗體對B.1.351和B.1.617.2的效力低于輝瑞疫苗所誘導的抗體。
研究結果也表明了:B.617.2變種明顯逃脫了NTD、RBD區域的中和抗體、多克隆抗體(雞尾酒療法)。
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