據此前報道,浙江大學27歲的陸盈盈獲評教授引起輿論紛爭,最后浙江大學網站將她的頭銜從教授改為“特聘研究員”。對于網絡上的紛爭,華中科技大學教授薛宇在自己的博客上發表了一篇文章,歷數了那些年輕的教授們,表示這一事件并不應該大驚小怪。觀察者網編輯查詢發現,薛宇教授出生于1980年,2007年成為中國科學技術大學生命科學學院系統生物學系副教授,可謂年輕有為。
華中科技大學生命科學與技術學院教授、博士生導師薛宇,入選教育部“新世紀人才支持計劃”
以下為薛宇教授博客文章:
前段時間網上熱炒一陣浙大27歲的美女教授(據說現在改成特聘研究員了)。咱圍觀了半天愣是沒有看懂究竟要吵什么東西。首先,人的年齡不能拿來說事兒,陶哲軒24歲的時候都UCLA的正教授了,27歲的時候估計已經天天在想菲爾茨了。
24歲就成為正教授的華人數學家陶哲軒
咱生信領域年輕一代的代表性人物李英睿,1986年出生,2008年以共同第一作者身份在Nature上發表炎黃基因組測序和組裝的時候才22歲。講到華大,我估計一幫噴子又要跳出來噴華大買人家國外的儀器沒科學。哥們兒對這類吐槽就一個字:滾粗。二代測序儀是人家搞的,這個沒錯,可全世界都不知道拿這玩意兒能干啥,對吧?所以華大這篇Nature就是告訴大家,二代測序可以拿來做基因組。咱說這話有根有據,不服你去找找文獻,看看這篇Nature之前誰拿二代測序做過啥有意義的事情?小睿睿的貢獻很多,包括2010年NBT上泛基因組序列圖譜的構建,2010年Nature上古愛斯基摩人基因組的測序,2010年NG上利用外顯子組測序發現低頻變異,等等。
華大基因CEO李英睿,年紀輕輕就在學術上建樹不凡
很多,總之華大的系列工作,迅速洗牌了基因組領域的研究現狀,解決或者初步解決了各種傳統實驗不可能解決的問題,也給生物信息學領域提供了很好地研究方向。此外,小睿睿2012年成為華大科技的CEO,還不滿27歲。所以拿年齡來說事兒沒有道理。
其次,27歲的教授也不算什么新聞,十幾年前就有了。以生命科學領域為例,最早于27歲上教授的可能是清華大學隋院士的兩個學生武一教授和吉尚戎教授,前者1976年4月出生,后者1976年3月出生,兩人都是2003年9月被聘為蘭州大學的正教授,并工作至今。兩人都入選“新世紀優秀人才”,并且前者2012年獲優青資助。有意思的是,兩人是科研上的好搭檔,從2002年第一篇JBC開始,重要的論文幾乎都是合作完成。這個挺不容易,一起合作十幾年,那戰斗友誼是相當的牢固。
27歲就成為教授的武一
與武一教授搭檔做研究的吉尚戎,也是27歲就成為教授
到06年底我博士畢業的時候,生命科學領域至少有四位在國內一流大學或研究所獲得教授/研究員職位的學者,其中一位是生物物理所的孫飛研究員,1979年5月出生,2006年博士畢業即獲得研究員職位。冷凍電鏡的方向,去年有一篇Developmental Cell和一篇Nature Communications,做的都是膜蛋白。
年輕有為的孫飛研究員
生物物理這方向咱搞不懂,不過咱學院搞生物物理的,比如老馬,對其工作是相當的推崇。另外,27歲教授也不單單是生命科學領域的現象,比如咱科大的校友周濤教授,1982年4月出生,2010年1月獲聘電子科大的教授,是當時四川省最年輕的教授,譯作《大數據時代》一書傳遍大江南北。
當時四川省最年輕的教授,27歲就成為教授的周濤
第三,當然按慣例以上說的都不是重點,并且這些27歲的教授在獲聘的時候也似乎沒有引起什么爭議。真正引起廣泛爭議的,是王MM,生物信息學家。王MM在2004年入選“百人計劃”、研究員,當時是27歲。這事兒在當時不是有爭議,而是吵翻了天。各種BBS、論壇上都是吵的一塌糊涂。反對的說,27歲評教授就是笑話。支持的說,你丫沒本事就以為全世界都跟你一樣是窩囊廢?那次爭吵可能是當時生物信息學版塊的帖子頭一回上十大。以至于后來大家都納悶,學術版上非學術的帖子咋有這么大的爭議?當然爭議歸爭議,王MM做的可相當的好。咱生信要認2級的工作是吧(《如何成為頂級生物信息學家》)?
27歲獲評教授,一度引起廣泛爭議的王秀杰
這個我很負責任的評論:有。2004年王MM以第一作者身份在Genome Biology上提出植物miRNA以及miRNA靶基因的預測算法,并且還有實驗驗證,所以這是2級上的工作。這篇論文被引用240多次,相當的驚人。所以你迅速就可以理解,王MM的研究方向必然會是植物非編碼RNA的生物信息學研究。王MM算法和工具做的不算多,這是因為第一,她老板是非常正統的實驗學家,生信與實驗學的研究范式互不通約,所以實驗背景的學者可以將生信當成一種方法,但不大可能完全信任其研究理念;第二,其時國內生命科學領域逐漸形成的研究范式是希望做出重要的生物學發現,解決生物學的問題。因此有必要折衷。所以國內從事生物信息學研究的女科學家,一般水平都不錯的原因在于,男性對于不在自己知識框架里的東西會劇烈排斥,例如搞生信是否要做實驗這類問題,而女性相對來說性格更溫和,會先做起實驗然后等等再看。
然后就是本篇主要講的內容。3月5日最新一期的CellStem Cell雜志上,北京動物所的周琪研究員、基因組所的楊運桂研究員和王MM三個研究組合作,揭示RNA的轉錄后修飾(不是哥們兒我研究的翻譯后修飾哦,那是蛋白質的,這是RNA的)N6-甲基化區域顯著富集miRNA的結合位點,受到miRNA的調控,并且其修飾水平的升高能夠提高小鼠胚胎成纖維細胞向多能干細胞的重編程誘導。這篇論文有計算,有實驗。因為前兩位主要關心的是具體的科學問題,所以其中的生物信息學分析必須是王MM研究組做的。論文結果的第一部分首先比較多能與分化的細胞系,看看序列特征,泛泛比較一下功能,這是典型的比較基因組的工作,屬于生信的基本功之一。第二部分是比較N6-甲基化在兩類細胞中的不同,鑒定細胞類型特異性的N6-甲基化。這里面算細胞類型特異性的N6-甲基化基因用的是熵法,最早是2005年GenomeBiology上一篇論文提出用來算組織特異性表達的基因。第三部分是發現N6-甲基化區域富集miRNA的結合位點,這是王MM的本行,所以顯然不是問題。后面實驗咱就不說了。所以這篇論文,生物信息學的分析是必須的,并且最核心的就是第三部分的內容,不長但是關鍵,有畫龍點睛的效果。并且這一部分有區分度,不是做這一方向的生物信息學者,一般不會給你做這樣的分析,就算給你分析也難保不出岔子。所以按生信的觀點來看,這顯然是篇3級的論文。
此次引起爭議的陸盈盈,浙江大學后來把她頭銜改為特聘研究員
論文發表大家都挺高興,也紛紛祝賀王MM取得好的成果,畢竟搞生信想發高影響因子的論文不容易,與實驗學家密切合作是個很好的方法。另一個趣事是,王MM成名的工作是與周琪研究員合作發表在JBC上關于miRNA調控干細胞多能性的工作,可能是先投的Nature,正好當時國外一個研究組做的相同的工作也投了Nature,國內投文章你知道的,所以合理的結果是中國的工作被干掉然后老外的工作發表。后來這篇論文2010年4月8號轉投JBC,次日9號接收,這也夠快的。雖然雜志不一樣,但兩者的學術影響大致相當,例如當年11月老外寫綜述評論多能性與重編程的進展,這兩篇論文是同時引用的。一般來說,論文順利發表,報道報道就結了,后面的故事自然也就沒人關注了。但問題是這篇論文投稿悲劇了,并且所有人都知道這是悲劇,所以自然也就關注起背后的故事,這也就都知道生信幫助做數據分析,為實驗找到研究方向的事情。那幾年參加非生信的會議,各種主流學者們都教育我:生信不是你這么做的,得向王MM學習。
問題說回來,為啥男性科學家們27歲上教授,毛爭議沒有,連個泡都不起的,而女性學者27歲上教授就必然會有爭議呢?第一從生物學角度來講,女性學者的出現會誘導男性體內雄性激素分泌水平的異常提高,表型就是:我得說兩句。第二,搞科學男性多,女性少,大家看著覺得稀奇。第三,有性別歧視吧?這是不對的。
第四,阿森納。(阿森納在英超屢次排名第四,這是一個球迷梗,觀察者網注)
附:薛宇教授簡歷
薛宇,男,1980 年6 月出生,分子細胞生物學博士,華中科技大學生命科學與技術學院教授、博士生導師,入選教育部“新世紀優秀人才支持計劃”。主要研究方向為蛋白質共價修飾的生物信息學分析,近年來緊密圍繞共價修飾底物和位點預測、修飾調控分析以及修飾組學數據處理等重要科學問題,采用由點及面、層層推進的研究策略,取得了階段性的研究成果。與合作者設計了新穎的GPS (Group-based Prediction System, 分組預測系統) 系列算法,構建了多種預測共價修飾底物和位點的計算工具、軟件和數據庫;采用比較基因組學和統計學等方法,從蛋白質組層面系統分析了共價修飾潛在調控機制和功能,初步提出了本領域的標準化設計和分析流程;結合磷酸化組學數據,初步揭示遺傳多樣性改變蛋白質共價修飾狀態,是其影響關鍵生物學過程和通路潛在分子機制;利用乙酰化組學數據,初步模擬人類乙酰化調控網絡,提出由乙酰轉移酶、底物和去乙酰酶組成的“三者關系”(Triplet relationship) 是構成人類乙酰化調控網絡的基本單元。以主要作者 (第一或通訊) 身份發表SCI 收錄論文近40篇,被他人引用~700次。應邀為InTech 出版社“Bioinformatics -Experimental Biology Systems”一書撰寫一個章節。獲國家自然科學基金、科技部和中國科學院等資助,獲計算軟件著作權登記證書四項。
主要學習與工作經歷
2002.7獲中國科學技術大學高分子科學與工程學士學位
2003.7獲中國科學技術大學計算機科學與技術雙學士學位
2007.1獲中國科學技術大學細胞生物學博士學位
2007.1-2007.7 中國科學技術大學,研究助理
2007.7-2009.7 中國科學技術大學生命科學學院系統生物學系,副教授
2009.7-現在,華中科技大學生命科學與技術學院
論文與獲獎情況
主持及參與研究多項國家自然科學基金項目、中科院項目和科技部重大研究計劃項目
發表SCI期刊重要論文近40篇,被他人引用~700次。
獲ZL1項,軟件著作權4項
2008獲“中國科學院優秀博士論文”獎
2006年獲香港"求是"研究生獎學金
2012年獲“青年科學之星”銅獎
研究領域
蛋白質共價修飾的生物信息學,蛋白質-蛋白質相互作用網絡的預測與重構,計算比較基因組學,以及功能位點的分子進化。一方面以共價修飾為主要研究對象,設計相應的計算方法,開發相關的計算軟件和數據庫,另一方面開展相應的實驗工作,以驗證計算結果的準確性。
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