酶免疫測定法檢測患者泌尿生殖道標本中的衣原體抗原，判斷結果比較客觀。本試驗的敏感性為60%一90%，特異性為92%一97%。
衣原體培養衣原體是專性細胞內寄生物，只有在活細胞中才能生長和增殖。目前實驗室常用的細胞為McCoy細胞及Heh229細胞。所取標本中必須含有活細胞。因此，取材的棉拭子一定要插在柱狀上皮部位，旋轉且放置20s,以便拭子吸附更多的細胞。細胞培養是診斷和鑒定沙眼衣原體的金標準方法，敏感性和特異性均高。但需一定的條件，且操作比較復雜、較費時。
