酶標儀廣泛地應用在臨床檢驗、生物學研究、農業科學、食品和環境科學中，例如低紫外區的DNA、RNA定量及純度分析（A260/A280）和蛋白定量，酶活、酶動力學檢測，酶聯免疫測定（ELISAs），細胞增殖與毒性分析，細胞凋亡檢測（MTT），報告基因檢測及G蛋白偶聯受體分析（GPCR）等。特別在近幾年中，由于大量的酶聯免疫檢測試劑盒的應用，使得酶標儀在生殖保健領域中應用越來越廣泛，同時促進了生殖健康技術水平提高
