金黃色葡萄球菌，也稱“金葡菌”，細胞壁含90%的肽聚糖和10%的磷壁酸。其肽聚糖的網狀結構比革蘭氏陰性菌致密，染色時結晶紫附著后不被酒精脫色故而呈現紫色，相反，陰性菌的細胞壁肽聚糖層薄、交聯度差，脂類含量高，所以紫色復合物被酒精沖掉然后附著了沙黃的紅色。金黃色葡萄球菌與青霉素的發現有很大的淵源。當年弗萊明就是在他的金黃色葡萄球菌的培養皿中發現有些球菌被殺死了，于是發現了青霉素。而研究也表明青霉素只對以金黃色葡萄球菌為代表的革蘭氏陽性菌作用明顯。這也是由肽聚糖層的厚度和結構造成的。
新出現的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌，被稱作超級細菌，幾乎能抵抗人類所有的藥物，但是萬古霉素可以對付它。典型的金黃色葡萄球菌為球型，直徑0.8μm左右，顯微鏡下排列成葡萄串狀。金黃色葡萄球菌無芽胞、鞭毛，大多數無莢膜，革蘭氏染色陽性。金黃色葡萄球菌營養要求不高，在普通培養基上生長良好，需氧或兼性厭氧，最適生長溫度37°C，最適生長pH7.4，干燥環境下可存活數周。平板上菌落厚、有光澤、圓形凸起，直徑0.5~1.0mm。血平板菌落周圍形成透明的溶血環。金黃色葡萄球菌有高度的耐鹽性，可在10~15%NaCl肉湯中生長。可分解葡萄糖、麥芽糖、乳糖、蔗糖，產酸不產氣。甲基紅反應陽性，VP反應弱陽性。許多菌株可分解精氨酸，水解尿素，還原硝酸鹽，液化明膠。金黃色葡萄球菌具有較強的抵抗力，對磺胺類藥物、青霉素、紅霉素、土霉素、新霉素等抗生素敏感，但易產生耐藥性，原因是由于這些菌株產生青霉素酶等。對堿性染料敏感，十萬分之一的龍膽紫液即可抑制生長。