正常的活細胞，胞膜結構完整，能夠排斥臺盼藍，使之不能夠進入胞內；而喪失活性或細胞膜不完整的細胞，胞膜的通透性增加，可被臺盼藍染成藍色。通常認為細胞膜完整性喪失，即可認為細胞已經死亡，這與中性紅作用相反。因此，借助臺盼藍染色可以非常簡便、快速地區分活細胞和死細胞。臺盼藍是組織和細胞培養中最常用的死細胞鑒定染色方法之一。注意凋亡小體也有臺盼藍拒染現象。
臺盼藍染色后，通過顯微鏡下直接計數或顯微鏡下拍照后計數，就可以對細胞存活率進行比較精確的定量。
臺盼藍染色只需3-5分鐘即可完成，并且操作非常簡單。