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  • 發布時間:2020-08-10 21:43 原文鏈接: 隨機引物法標記DNA

    實驗方法原理 利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿單鏈模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它們就可在模板的多位點上與模板雜交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互補物將以同樣的頻率摻入產物。


    實驗材料 大腸桿菌 DNA 聚合酶Ⅰ Klenow 片段隨機脫氧核苷酸引物模板 DNA


    試劑、試劑盒 醋酸氨乙醇NA 終止 貯存緩沖液隨機引物緩沖液dNTP 溶液


    儀器、耗材 堿性瓊脂糖凝膠或變性聚丙烯酰胺凝膠沸水浴或加熱板微量離心管SephadexG-50 離心柱


    實驗步驟


    一、材料


    1. 緩沖液和溶液


    醋酸氨(10 mol/L)


    乙醇


    NA 終止/貯存緩沖液(50 mmol/L Tris-Cl (pH 7.5),50 mmol/L NaCl,5 mmol/L EDTA (pH 8.0),0.5% (m/V) SDS)


    5X 隨機引物緩沖液(250 mmol/L Tris (pH 8.0),25 mmol/L MgCl2,100 mmol/L NaCl,10 mmol/L 二琉蘇糖醇(DTT),1 mol/L HEPES ( 用 4 mol/L NaOH 調至 pH 6.6),1 mol/L DTT 貯存于 -20℃,臨用前用水稀釋,使用后棄去稀釋的 DTT。)


    2. 酶和緩沖液


    大腸桿菌 DNA 聚合酶Ⅰ Klenow 片段


    3. 凝膠


    堿性瓊脂糖凝膠或變性聚丙烯酰胺凝膠


    4. 核酸和寡核苷酸


    含三種未標記的 dNTP 溶液(各 5 mmol/L)


    長度為六或七個堿基的隨機脫氧核苷酸引物(125 ng/μl TE,pH 7.6)


    模板 DNA ( 5~25 ng/μl TE,pH 7.6)


    5. 放射性復合物


    [α-32P] dNTP ( 10 mCi/ml,比活性 >3000 Ci/mmol)


    6. 專用設備


    預熱至 95℃ 的沸水浴或加熱板


    微量離心管(0.5 ml )


    SephadexG-50 離心柱,用 TE ( pH 7.6) 平衡


    二、方法


    1. 在一個 0.5 ml 的微量離心管中加入溶于 30 μl 水的模板 DNA ( 25 ng ) 及 1 μl 隨機脫氧核苷酸引物(約 125 ng)。蓋緊微量離心管,置于沸水浴中 2 min。


    2. 將微量離心管移至冰上放置 1 min,4℃ 下離心 10s 使引物與模板的混合物沉降至管底,將微量離心管重新置于冰上。


    3. 在引物與模板的混合物中加入:


    5 mmol/L dNTP 溶液       1 μl


    5X 隨機引物緩沖液         10 μl 


    10 mCi/ml [α-32P] dNTP  5 μl


    ( 比活性 3000 Ci/mmol)


    水                                   加至 50 μl


    4. 加入 5 單位(約 1 μl)的 Klenow 片段,輕彈管壁以混合各組分。以最大速度離心 1~2s 使所有液體沉降到管底。反應混合物室溫下反應 60 min。


    5. 在反應液中加入 10 μl NA 終止/貯存緩沖液,可根據需要進行以下步驟。


    貯存放射性標記的探針于 -20℃ 以備雜交用。



    通過離心柱層析分離放射性標記的探針與未結合的 dNTP 或以乙酸銨和乙醇選擇性地沉淀放射性標記的 DNA。如果 >50% 的放射 性 dNTP 已在反應中摻入,可不進行該步驟。


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