[原理]
DNA是通過異羥基洋地黃毒苷(digoxigenin,Dig)配基標記的脫氧尿嘧啶核苷三磷酸(dUTP)隨機插入結合而被標記。dUTP通過間臂連結類固醇半抗原異羥基洋地黃毒苷酸基,形成Dig-dUTP,雜交反應后,雜交的靶DNA通過酶聯免疫法與一個抗體復合物[抗異羥基洋地黃毒苷配基堿性磷酸酶復合物(Dig)Ap]結合,接著在5-溴-4氯-3-吲哚磷酸鹽(X-磷酸鹽)和硝基四氮唑藍(NBT)存在下,由酶催化反應,在雜交部位形成藍紫色帶或顆粒。
[操作]
1.轉移
通過打點吸漬、噬菌斑或Sonthern印跡轉移等方法,把被測的DNA轉移到硝酸纖維膜或尼龍膜上。
2.標記探針
取微型離心管于冰上,依次加入:lμg新鮮變性的DNA;2μl六聚核苷酸混合物;2μl dNTP標記用混合物;加無菌雙蒸水至 19μL;加 lμl
DNA聚合酶大片段。37℃保溫 1小時至20小時,加入 2μl EDTA(0.2 mol/L),終止反應,加 2μL 4mol/L
LiCl,75μl預冷的乙醇沉淀DNA,- 70℃ 30分鐘或-20℃ 2小時、離心收集沉淀物,真空干燥后加 50μl TE溶解。
3.預雜交
膜放入袋內 68℃預雜交 1小時,每 100cm2膜至少用 20ml預雜交溶液。
4.雜交
每100cm2膜用2.5 ml雜交液(雜交溶液用預雜交溶液中加新鮮變性的探針組成),68℃至少雜交6小時。
5.洗膜
室溫下用50ml 2×SSC, 0.1%(W/V)SDS洗膜,5分鐘× 2次,68℃用0.1×SSC, 0.1%(W/V)SDS洗膜,15分鐘×2次,晾干。
6.檢測
(1)膜在緩沖液中洗滌1分鐘。
(2)緩沖液Ⅰ稀釋抗體結合物至150 mU/ml(l:5000),稀釋后的抗體結合物在4℃只能穩定12小時。
(3)膜在20ml稀釋的抗體結合物溶液中保溫30分鐘。
(4)用緩沖液Ⅰ洗膜15分鐘×2次。
(5)在緩沖液Ⅱ中平衡2分鐘。
(6)在黑暗條件下,膜與新鮮配制的顯色溶液放塑料袋內密封或放入合適的盒子內,幾分鐘開始顯色。
(7)用50ml緩沖液IV洗膜5分鐘,終止反應。
(8)攝影記錄結果。
試劑與器材]
1.試劑
DNA稀釋緩沖液:Tris.Cl(10mmol/L),EDTA(lmmol/L)pH 8.0,內含魚精 DNA 50μg/ml。
10×六聚核苷酸反應混合物。
dNTP標記用混合底物:lmmol/L dATP: 1mmol/L dCTP;lmmol/L dGTP;0.65 mmol/L dTTP;0.35mmol/L DigdUTP,pH6.5(20℃)。
DNA聚合酶 I大片段(標記級):2 U/μl。
(Dig)Ap結合物:多克隆抗異羥基洋地黃毒苷配基Fab片段,結合有堿性磷酸酶750 U/ml。
NBT:濃度為 75mg/ml,溶于 70%(V/V)二甲基甲酰胺硝基四氮唑藍鹽溶液。
X-磷酸鹽:50mg/ml,溶于二甲基甲酰胺的5-溴-4氯-3-吲哚磷酸鹽。
封阻試劑:粉劑
0.2 mol/L EDTA,pH 8.0(20℃)
4mol/L LiCl
70%乙醇
10%(V/V)N-十二烷基肌氨酸鈉鹽.
10% SDS
20 × SSC
雜交溶液:5×SSC;0.l%(W/V)封阻試劑;0.02%(W/V)SDS。 緩沖液Ⅰ:100 mmol/L Tris-CI;150mmol/L NaCl,PH7.5(20℃)。
緩沖液Ⅱ:0.5 %(W/V)封阻試劑溶于緩沖液中,封阻試劑不會快速溶解,因此應提前1小時配制此溶液,將試劑溶于50~70℃,此溶液保持混濁。
緩沖液Ⅲ:100 mmol/L Tris Cl;100mmol/L NaCl;50mmol/L NaCl;50mmol/L MgCl2,pH9.5(20℃)。
緩沖液IV:10mmol/L Tris Cl;1 mmol/L EDTA,pH 8.0(20℃)。
顯色溶液(新鮮配制):10ml緩沖液Ⅲ中,加 45μl NBT溶液和 35μl X-磷酸鹽溶液。
2. 器材
常規實驗室儀器設備