（1）原子：原子序數大的排在前面，同位素質量數大的優先。
幾種常見原子的優先次序為：I>Br>Cl>S>P>O>N>C>H
（2）雜原子上孤電子對當作最小的取代基，如圖1所示：
圖1 雜原子上孤電子對當作最小的取代基
取代基優先次序為：c>b>a>孤電子對
（3）若取代基中心原子相同者，則逐輪依次比較與中心原子相連的原子的原子序數大小；如仍相同，再依次逐輪外推，直至比較出較優基團為止。
順序規則
且在逐輪依次比較時，還有優先方向原則，即遇到不同點時，優先比較各自較優基團上的取代基。
順序規則
C5與C3連的原子相同，接著依次比較下一層的取代基，如從O上取代基來比較，C5的O上連C，C3的O上連 H，則C5取代基優于C3取代基；如從C上取代基來比較，C6連（C,H,H），C2 連（C,C,H），則C3 取代基優于 C5取代基，此時優先從較優的O取代基進行比較。因此C5取代基優于C3取代基，C4手性構型為R。
（4）若為同位素，質量數大者為較優基團，如：D
；對于可以通過逐輪依次比較原子序數而排列出優先次序的取代基，則這條規則不使用；
（5）若取代基上含有雙鍵、三鍵或芳環，可以認為雙鍵中心碳原子連有兩個相同原子，三鍵中心碳原子連有三個相同原子，芳環中心碳原子連有兩個或三個相同原子，其中一個為實原子（real atom），其他為虛原子（phantom atom，括弧內原子），如
順序規則
其中，規定虛碳原子上不再連任何原子，或認為連的原子為零，甚至小于雜原子所含有的孤電子對。以乙炔基和苯基為例進行分析，C1上連（C、C、C）Ci上連（C、C、C），此時未能比較出結果，接著進行下一輪比較；C2為實碳，連有（C、C、H），C3 和C4為虛碳，不再連有任何原子，或認為連的原子為零。Cii和Ciii為實碳，均連有（C、C、H）；而Civ為虛碳，不再連有任何原子，Cii與C2相同，Ciii優于C3，Civ 與C4相同。因此苯基優先于乙炔基。由此可以比較出下列取代基的優先次序：
取代基的優先次序
（6）飽和基團：如果第一個原子序數相同，則比較第二個原子的原子序數，依次類推。
常見的烴基優先次序為：叔碳>仲碳>伯碳>甲基。
（7）不飽和基團：可看作是與兩個或三個相同的原子相連。
不飽和烴基的優先次序為：-C≡CH>-CH=CH2>(CH3)2CH-
（8）若與雙鍵碳原子相連的基團互為順反異構時，Z型先于E型。
Z型先于E型
R構型優于S構型。
R構型優于S構型
次序規則主要應用于烷烴的系統命名和烯烴中幾何異構體的命名。
烷烴的系統命名：如果在主鏈上連有幾個不同的取代基，則取代基按照“次序規則”依次列出，優先基團后列出。
按照次序規則，烷基的優先次序為：叔丁基>仲丁基>異丙基>異丁基>丁基>丙基>乙基>甲基。