因為ATOFMS可以鑒別組成顆粒物的特殊化合物，因此它可以提供了新視角來考察粒子與周圍氣體以及其他顆粒物之間的動態化學過程。實時化學組分分析可以消除傳統的濾膜或碰撞器氣溶膠采樣方法的固有問題，比如二次化學反應或者半揮發性化合物的損失。3800-ATOFMS的應用包括：
· 氣溶膠分析研究
· 大氣粒子表征、排放源識別
· 半導體加工過程
·室內空氣質量監測
· 氣溶膠－藥物釋放研究
·吸入毒理學研究
· 藥物強化樣品分析
· 化學和生物氣溶膠檢測
· 發動機排放測量
· 粉末生產質量以及過程控制等。