1、以船型滅菌鍋一定要夠大，燒煤以正方型鍋底為好，燒些以長方型鍋為好。鍋內加足水，尤其是第一鍋，冷鍋冷灶費水費燃料，防止燒干鍋，并且燒下一鍋的時候不用燒很長時間，就容易上蒸氣，袋上的冷凝水落入鍋內不足以導致降溫。
2、簡易鍋、土蒸鍋、鐵皮鍋，無論哪種鍋，滅菌倉擺放密度不要過大，最好第個周轉筐中都保留一定的空隙，便于熱空氣流通。
3、四角底層擺放空筐，容易出現滅菌死角的位置往往是四角的最下層，冷空氣集中的點就是邊邊角角。
4、根據滅菌量決定放氣孔的大小和多少。5千袋的菌鍋可以留兩個1.5寸排氣孔，依此類推。排氣孔的位置最下層菌筐的下面。
5、帶探頭的壓力溫度表將探頭插入最下層筐中的菌袋內部。直到這個溫度表顯示溫度達到100度時再開始計時（恒溫100度保持8－10小時），實際生產中，3千袋以下的鍋保持8小時，3000袋－5000袋的需要保持10小時，5000－10000袋的鍋保持12小時。
6、溫度表需要校準，無論是電子數顯的還是壓力指針的溫度表都需要校準，校準方法常用的方法將探頭插入到滾開的開水中（根據不同海拔，開水溫度也不同，例如：海拔高度0米沸水溫度100度，海拔高度500米沸水溫度98度，海拔高度1000米沸水溫度97度。）
7、常壓蒸氣鍋爐，為了防止加水降溫可以用兩個鍋爐，同時給滅菌倉內通蒸氣，如果是一個鍋爐加水時最好加開水，少加、勤加。
8、悶制，達到滅菌溫度以后不要急于打開鍋門降溫。最好悶制6－10小時再出鍋。
9、關于降溫，有些地方由于開鍋晚采用軸流風機向鍋內吹風降溫，這種方法容易導致雜菌感染隱患。