a.參與復制水平的調節反向序列常存在于DNA復制起點區的附近。另外，許多反向重復序列是一些蛋白質（包括酶）和DNA的結合位點。
b.參與基因表達的調控DNA的重復順序可以轉錄到核內不均一RNA分子中，而有些反向重復順序可以形成發夾結構，這對穩定RNA分子，免遭分解有重要作用.
c.參與轉位作用幾乎所有轉位因子的末端都包括反向重復順序，長度由幾個bp到1400bp。由于這種順序可以形成回文結構，因此在轉位作用中即能連接非同源的基因，又可以被參與轉位的特異酶所識別。
d.與進化有關不同種屬的高度重復順序的核苷酸序列不同，具有種屬特異性，但相近種屬又有相似性。如人的α衛星DNA長度僅差1個堿基（前者為171bp，后者為172bp），而且堿基序列有65%是相同的，這表明它們來自共同的祖先。在進化中某些特殊區段保守的，而其他區域的堿基序列則累積著變化。
e.同一種屬中不同個體的高度重復順序的重復次數不一樣，這可以作為每一個體的特征，即DNA指紋。
f.α衛星DNA成簇的分布在染色體著絲粒附近，可能與染色體減數分裂時染色體配對有關，即同源染色體之間的聯會可能依賴于具有染色體專一性的特定衛星DNA順序。