在高效液相分析過程中，樣品和色譜系統會對液相色譜柱造成污染，導致液相色譜柱耐久性差，壽命縮短。
色譜系統的污染主要是指HPLC儀器系統中各組分的磨損產生的固體顆粒，以及流動相系統過濾出的不完全殘留的固體顆粒。樣品污染主要是由于樣品溶劑和流動相溶劑的溶解性不同，使樣品或完全溶解的樣品在色譜系統中不完全溶解，從而造成沉淀污染體系。特別是在中藥、天然產物、合成中間體和生物藥物的檢測中，由于基質的復雜性，高效液相色譜柱的污染將更加嚴重。污染會導致色譜系統壓力升高、高效液相色譜柱倒塌、填料變色等，導致檢測成本高、檢測結果不準確等問題。
保護柱是液相色譜中一種重要的色譜消耗品。保護柱的使用大大降低了分析塔的污染程度，延長了分析塔的使用壽命。
保護柱位于進樣器和分析柱之間。
（1）截留不溶性顆粒
（2）雜質在樣品基質中的吸附
液相色譜柱以下幾種情況建議使用保護柱：
（1）復雜樣品，如中藥、天然產物和合成中間體，由于溶解度的不同而對分析柱造成污染，尤其是在梯度洗脫過程中，這些復雜樣品的分析更為嚴重。
（2）生物樣品分析-由于樣品的不可逆吸附所造成的污染，保護柱可以在分析柱之前承受污染，從而延長了分析柱的使用壽命。
保護柱是重要的，但更重要的是選擇正確的保護柱，而不恰當的選擇或使用可能會產生相反的效果。