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  • 發布時間:2014-07-11 15:55 原文鏈接: 上海交大與IBM合作結碩果:醫藥大數據助力個體化醫療

    上海交大等機構合作構建的藥物相互作用搜索引擎界面截圖

      經過多年的努力,上海交通大學Bio-X研究院聯合美國IBM沃森研究院、哈佛大學、加州大學伯克利分校等醫藥大數據前沿機構的研究人員通力協作,共同構建了基于醫藥大數據的藥物互相作用搜索引擎,進而在個體化用藥研究方面取得重要進展。部分研究成果已發表在近期的《核酸研究》(影響因子8.3)上。

      在此項研究中,研究人員利用化合物-蛋白互作組(Chemical-ProteinInteractome, CPI)的海量數據在超級計算機上模擬藥物相互作用。工作首先模擬FDA所批藥物已知的相互作用指紋圖譜,通過改進了的大數據挖掘算法,比較用戶提交分子的指紋圖譜來預測潛在藥物互作,從而及時預測用藥風險。和同類預測比較后,研究人員發現該引擎的計算精度處于領先地位,因此可為規避基于藥物互作的藥物不良反應提供了重要信息,從而有助于實現個性化用藥。

      該項研究得到了研究院相關領導的支持,繼而由前美國FDA訪問學者、楊侖博士構思和領導。主要參與單位還包括了醫藥大數據研究前沿的諸多知名機構,如美國IBM沃森研究院、哈佛大學Dana-Farber腫瘤研究所、加州大學伯克利分校和復旦大學等。上海交通大學Bio-X研究院為第一單位,羅衡為論文的首要第一作者,美國IBM沃森研究院的Ping Zhang博士為論文的并列第一作者, Hui Huang為第二作者。

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