8位大牛暢談基因組學的未來
過去幾十年已經徹底改變了遺傳學和基因組學，那么，下一個十年呢？《PLOS Biology》請了不同領域的8位牛人科學家，談談他們的預測。無一例外，所有預測都指向更大規模和更多類型的數據。當然，這些大牛都很樂觀，許了遺傳學和基因組學一個光明的未來。 Wellcome Trust Sanger研究院的Chris Tyler-Smith在引言中談到，對于這樣一個快速發展的領域，盡管預測基本上都是錯的，但對作者和讀者而言仍然是不可抗拒的。無疑，我們將從所有的組學技術中獲得更多的序列和數據。這將讓科學認識受益，并對動植物的育種產生影響，帶來實際的進步。 華大基因主席楊煥明談論了基因組學的廣泛應用。他認為，數字化的“生命之樹”將建立，也就是對地球上幾乎每個物種的個體進行測序，這將改變我們對整個生命的看法。對于人類，各個種族至少將有一百萬人的全基因組被測序，包括正常人和各種疾病患者，這將為今后的醫學和保健打下基礎。此外，他認為癌癥及其......閱讀全文
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
細胞遺傳學——比較基因組雜交(CGH)
·?????????Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
遺傳學大牛Science發現基因組新奧秘
來自斯坦福大學，霍德華休斯醫學院的一組研究人員發現，當基因組中相似的基因不斷“彈出來”的時候，通常這些基因會丟失，但如果能被留下來（也就成為了多余基因），就會由于一個基因發生一次表達消減這一理論，而在哺乳動物中受到保護。 這一研究成果公布在5月20日的Science雜志上。文章的通訊作者是斯坦
浙大教授Nature子刊：水稻基因組重測序及群體遺傳學研究
浙江大學農業與生物技術學院作物科學研究所，中國水稻研究所的研究人員發表了題為“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以雜草稻群體為材料，通過基因組
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
北京基因組所實現對大樣本全基因組數據的群體遺傳學分析
計算基因組學旨在發展理論和方法學，對基因組數據進行數據挖掘、提取信息。其中對遺傳多態性，如基因頻譜、單倍型結構等進行建模，利用群體基因組水平的遺傳變異數據來推斷群體的歷史和變遷是群體遺傳學的核心內容。傳統的群體遺傳學分析方法通常基于小樣本數據，所推斷的多為相對古老的歷史事件，例如，被廣泛應用的L
遺傳學大牛Science重磅成果：改寫活體基因組
遺傳密碼通常包含64個密碼子， 但現在來自哈佛大學的研究人員和同事們設計出了只包含57個密碼子的大腸桿菌基因組。在發表于8月18日《科學》（Science）雜志上的一篇論文中，該研究小組描述了這一計算機生成的基因組，并報告了在實驗室中合成它的第一階段。 論文的共同作者、哈佛大學George C
最熱門基因組遺傳學新聞一覽
本周包括蘋果，IBM等在內的著名企業宣布了各自在生命科學領域研究的最新消息。 蘋果推出ResearchKit 首先蘋果Apple公司繼新的數據共享平臺 ResearchKit 首次亮相之后，將開始手機用戶的遺傳信息。據MIT Technology Review報道，“鼓勵iPhone用戶將其
草莓基因組研究取得成果－|《自然遺傳學》
《自然-遺傳學》本周在線發表的一篇論文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該基因組為了解這一廣受歡迎的水果的起源和演化歷史提供了新見解。八倍體草莓的演化史。Edger et al. 八
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日，《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成，研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組，發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
北京基因組所生命組學數據資源建設獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表。該研究成
《AJHG》：孤獨癥基因組計劃發表遺傳學發現
孤獨癥，又稱自閉癥，是兒童發育障礙中最為嚴重的疾病之一。據世界衛生組織估計，目前全世界“孤獨癥”兒童患者約3500萬，中國約有60至180萬患兒，也有學者認為目前中國可能有150萬至780萬患兒。 孤獨癥基因組計劃(Autism Genome Project，AGP)是世界上最大的研究
攻克基因組測序難題－探究茶樹生物學奧秘
我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載：“神農嘗百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地，在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里，與全球多元文化邂逅交融，發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎，除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
測序基因組勘探食品污染
上周，兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠（Blue Bell Creameries）已確認有少量食品原料已感染李斯特菌，目
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但