近期,來自多倫多大學Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一組研究人員,開發出一種新技術,可以將細胞內的DNA條形碼拼接在一起,以同時搜尋數百萬個蛋白質配對,用以分析蛋白質相互作用。相關研究結果發表在4月22日的《Molecular Systems Biology》雜志上。延伸閱讀:蛋白質相互作用分析的新策略;研究蛋白質-RNA相互作用的新工具[新品推薦]。 近年來,DNA條碼技術使得科學家們能夠進行高度并行的實驗,在實驗中,許多不同類型的細胞可以在同一試管中進行測試。新一代DNA測序進一步使得這一切成為可能,其可以有效地計算條形碼,并“讀出”結果。然而,可以組合在同一試管內的實驗的數量,往往因編碼細胞的類型而受到限制。能夠讓條形碼在細胞內融合在一起,意味著科學家現在可以打破這個障礙。這一新技術,可以相同的價格,使研究人員探索發現的速度提高10倍。......閱讀全文
隨著越來越多的物種基因組測序完成,對全蛋白質組與相互作用組的解釋已經成為近期研究的熱點。雖然蛋白質組研究闡述了表達蛋白質的所有組成成分,但是相互作用組包括了生物體內存在或者可能存在的成對蛋白質-蛋白質相互作用,因此,形成了龐大且稀疏的網狀結構。倫敦帝國理工學院生物信息學中心的WP Ke
摘 要:隨著生物分子光學標記技術的不斷進步,光學技術在揭示生命活動基本規律的研究中正發揮越來越重要的作用,也為醫學診斷與治療提供了更多、更有效的手段。本報告首先簡要介紹光學技術在生物醫學應用中的發展概況,然后從基因表達及蛋白質—蛋白質相互作用研究方面,討論生物分子光學技術的特點與優勢,闡明基于分
摘 要:隨著生物分子光學標記技術的不斷進步,光學技術在揭示生命活動基本規律的研究中正發揮越來越重要的作用,也為醫學診斷與治療提供了更多、更有效的手段。本報告首先簡要介紹光學技術在生物醫學應用中的發展概況,然后從基因表達及蛋白質—蛋白質相互作用研究方面,討論生物分子光學技術的特點與優勢,闡明基于分
作為后基因組時代出現的新興研究領域之一, 蛋白質組學(proteomics)正受到越來越多的關注。 蛋白質組學的研究目標是對機體或細胞的所有蛋白質進行鑒定和結構功能分析。 蛋白質組學的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白質分離技術如二維凝膠電泳和高效液相
摘要 蛋白質組學是在后基因組時代出現的一個新興的研究領域, 它的主要任務是識別鑒定細胞、組織或機體的全部蛋白質, 并分析蛋白質的功能及其模式。 因此, 揭示蛋白質組中蛋白質間的相互作用關系也是蛋白質組學的重要內容之一。 酵母雙雜交技術是用來檢測蛋白質間是否相互作用的一
作為后基因組時代出現的新興研究領域之一, 蛋白質組學(proteomics)正受到越來越多的關注。 蛋白質組學的研究目標是對機體或細胞的所有蛋白質進行鑒定和結構功能分析。 蛋白質組學的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白質分離技術如二維凝膠電泳和高效液相層析, 經典的蛋白質鑒定方法如氨
1987年,瑞士的研究人員報道了2例來自同一家庭的兩姐妹,攜帶類似的出生缺陷:小腦少一綹組織,且心臟有孔和裂痕(Ritscher–Schinzel綜合征)。一位在接受心臟手術后沒活過3歲,另一位在4歲接受了類似的心臟手術,存活了下來。 她們的父母并沒有攜帶這些異常,當時的研究人員認為,兩位患者
來源:生命科學 關 薇, 王 建, 賀福初*(軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所,北京 100850) 摘 要:隨著2000 年酵母大規模蛋白質相互作用網絡圖譜的成功描繪,蛋白質相互作用特別是大規模蛋白質相互作用研究成為生命科學領域的又一個研究熱點。酵母、果
表1 蛋白質相互作用分析相關數據庫及網站 網站 資源類型 網址 DIP 蛋白質相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu INTERACT 蛋白質相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interact
近日出版的《分子系統生物學》雜志發表了軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所、蛋白質組學國家重點實驗室楊曉明研究員和賀福初院士領導的科研團隊聯合復旦大學、湖北大學等單位完成的研究論文。論文闡釋了目前世界上最大的人類器官蛋白質相互作用網絡連鎖圖框架,標志著我國在人類蛋白質相互作用網絡研究
細胞通過成千上萬控制其生長和分化的蛋白相互協作而發揮功能,關鍵蛋白功能失常常會導致疾病。目前已經有許多關于探索所有人類蛋白功能的大規模研究項目。最近,de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率領的研究小組新發展了一套
出色的重復性和超高分辨率 CE-WCID(全柱成像毛細管等電聚焦電泳儀)具有超高的蛋白質pI點的分辨率(△pI<0.01),這個指標無人能比。 蛋白質pl點的測定舉例:△pI<0.01,7分鐘完成實驗 蛋白質藥物主要成分和降解產物的pl點測定和重復性的考
摘 要:隨著生物分子光學標記技術的不斷進步,光學技術在揭示生命活動基本規律的研究中正發揮越來越重要的作用,也為醫學診斷與治療提供了更多、更有效的手段。本報告首先簡要介紹光學技術在生物醫學應用中的發展概況,然后從基因表達及蛋白質—蛋白質相互作用研究方面,討論生物分子光學技術的特點與優勢
蛋白質-蛋白質相互作用和識別在生物學過程中有著非常重要的作用。盡管結構生物學已經取得了較大的進展,但直接采用實驗方法確定蛋白質-蛋白質復合物結構仍然非常困難。分子對接技術是預測蛋白質-蛋白質復合物結構的有效方法。蛋白質-小分子之間的相互作用一般蛋白質受體有結合口袋,相互作用區域比較明確,而蛋白質
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新,蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多,但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前,先看看這篇技術簡介吧。一 蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中,例如DNA復制、mR
北京大學的研究人員報告稱,他們開發出了一種遺傳編碼蛋白質光交聯劑,其帶有可轉移的、質譜可識別的標簽。這一研究成果發布在7月27日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。 北京大學化學與分子工程學院的陳鵬(Peng R. Chen)研究員與王初(Chu Wang)研究
食品成分與蛋白質的化學反應相互作用1 乳化性質蛋白質在許多乳膠體食品體系中起著重要的作用,如牛奶、冰淇淋、肉餡等。蛋白質對水/油體系的穩定性差,而對油/水體系的穩定性好。影響蛋白質乳化的因素:(1)鹽:0.5-1.0mol/L 的氯化鈉有利于肉餡中蛋白質的乳化;(2)蛋白質的溶解
簡介: BRET已經成功的應用于研究哺乳動物細胞中GPCR同源和異源二聚體以及涉及到受體脫敏作用和交易的受體/β-arrestin相互作用(綜述,1)。BRET的顯著優勢是可以在活細胞中,正確的的位置實時的監測蛋白質和蛋白質之間的相互作用。由于GPCR高度的疏水性和細胞本地化,測量蛋白質之間相互作用
方案1 用 FLAG抗原表位標記蛋白質進行蛋白質免疫共沉淀 方案2 細胞裂解液中相互作用蛋白的親和純化 方案3 多蛋白質復合體的非變性瓊脂糖凝膠電泳實驗 方案4 BN-PAGE 蛋白質分析法 方案5 采用交聯法和質譜法對蛋白質復合體進行拓撲
圖1 TAP親和層析純化原理[14] 注:A:標簽中的ProteinA 與固化的IgG 結合緩沖液淋洗去除不能結合的雜蛋白,TEV 酶切分離ProteinA &nbs
熒光關聯譜 FCS?—Fluorescence Correlation Spectroscopy FCS可用于分析小規模分子集合輻射行為所引起的微小的自發擾動,從而反映分子內與分子間的動力學過程。由于FCS可觀察納摩爾(nanomolar)范圍的熒光分子,因而可在大的空間與時間范圍內,非常近似地
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學(protein-metabolite interactomics)。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學,現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析,而蛋
現代分子生物學和免疫學的進展加深了我們對許多疾病的了解,并且導致了免疫新策略的產生,免疫學檢測方法可分為體液免疫和細胞免疫測定。本文盤點了與免疫學有關的分子生物學實驗技術匯總。 一、GST pull-down實驗 GST是指谷胱甘肽巰基轉移酶,GST pull-down實驗是一個行之有效的驗
蛋白質相互作用研究能夠從分子水平上揭示蛋白質的功能,幫助揭示生長發育、新陳代謝、分化和凋亡等細胞活動的規律。在全基因組范圍內識別蛋白質相互作用對是解釋細胞調控機制的重要一步。隨著蛋白質相互作用實驗技術的發展,人們能夠獲得大量的蛋白質相互作用數據,甚至能夠在全基因組范圍內對蛋白質相互作用進行分析。
蛋白質相互作用研究能夠從分子水平上揭示蛋白質的功能,幫助揭示生長發育、新陳代謝、分化和凋亡等細胞活動的規律。在全基因組范圍內識別蛋白質相互作用對是解釋細胞調控機制的重要一步。隨著蛋白質相互作用實驗技術的發展,人們能夠獲得大量的蛋白質相互作用數據,甚至能夠在全基因組范圍內對蛋白質相互作用進行分析。
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
來自中科院上海藥物研究所,美國萊斯大學的研究人員報道了最新研究成果,在可藥性蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)界面預測與識別計算方法發展方面取得重要進展。這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上,文章的通訊作者是上海藥物研究所蔣華良研究員,以及萊斯大學José N. Onuchic博
來自美國哥倫比亞大學,同濟大學等處的研究人員發表了題為“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一種基于三維結構信息的全基因組蛋白質相互作用計算預測方
Cell創刊于1974年,現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一,并陸續發行了十幾種姊妹刊,在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。Cell以發表具有重要意義的原創性科研報告為主,許多生命科學領域最重要的發現都發表在Cell上。本月《Cell》前十名下載論文為 Unveiling the
11月29日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)在線發表了中國科學院上海藥物研究所蔣華良課題組和美國萊斯大學(Rice University)José N. Onuchic 課題組合作的論文Elucidating the druggable interface of protein-protei