北京基因組所生命組學數據資源建設獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表。該研究成果的發表是國內首次以數據中心為模式，整體發布我國生命組學數據資源建設情況，標志著生命與健康大數據中心建設取得實質性重要進展，也標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。 生命與健康大數據中心建成面向國家大數據發展戰略的多層次生物組學數據資源系統，包括基于高通量測序的原始組學數據歸檔庫（Genome Sequence Archive，GSA），圍繞國家重要戰略生物資源的基因組數據庫（Genome Warehouse，GWH）、基于測序數據的基因表達數據庫（Gene Expression Nebulas，GEN）、基于中國人群......閱讀全文
北京基因組所生命組學數據資源建設獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表。該研究成
北京基因組所數據資源建設取得進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊研究論文在線發表于《核酸研究》期刊。該研究成果的發表是國內首次以數據中心為模式，整體發布我國生命組學數據資源建設情況，標志著生命與健康大數據中心建設取得實質性重要進展，也標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。 生命與健
基因組學推動生命科學大步向前
2010年下旬，河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布，向全國征集曹姓男性DNA樣本，擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子，基因組科學成為熱門，這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上，伴隨著2
國家基因組科學數據中心公布數據資源整合挖掘體系
近日，國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表題為Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建設
北京基因組所生命與健康大數據研究獲進展
與健康大數據研究成果，包括生命組學數據資源建設成果（D14-20）、實時定量PCR內參基因知識庫——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化數據庫Methbank升級版（D288-295）以及基因組序列變異庫——GVM（Genome Variation M
打破“數據孤島”，推動組學資源管理自立自強
今年1月，依托中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）（以下簡稱基因組所）的國家基因組科學數據中心（NGDC）有10篇論文集中亮相國際生物數據庫期刊《核酸研究》。對于這樣一本頂級期刊來說，這種情況并不多見。一個剛6歲的數據中心何以取得這樣的成績？近日，《中國科學報》走進基因組所了解NGDC成長
－ORFeome：基因組規模的人類ORF資源
一個國際合作組織，包括Dana-Farber癌癥研究所，已經在創造人類細胞中不同蛋白質的成千上萬的完整基因圖譜庫的工作上達到了一個里程碑。開放閱讀框ORF（編碼蛋白全長的基因）的集合，是科學家研究人類細胞基礎機制和疾病中的過程的重要資源。 在2月25日發表在Nature Method上的文章，
國家基因組科學數據中心發布2019新型冠狀病毒資源庫
1月22日，國家基因組科學數據中心正式發布2019新型冠狀病毒資源庫。該庫整合了世界衛生組織（WHO）、中國疾病預防控制中心（CDC）、美國國家生物技術信息中心（NCBI）、全球流感序列數據庫（GISAID）等機構公開發布的冠狀病毒基因組序列數據、元信息、學術文獻、新聞動態、科普文章。同時，對不
利用植物表型組學挖掘基因組學的成果
到2050年，全球人口將達到97億，預計作物產量翻一番才能滿足全球人口的糧食需求。為了達到這一目標，作物產量需每年增長2.4%，但目前作物產量平均增長率僅為1.3%。作物生產性能的遺傳改良仍然是提高作物生產力的關鍵因素，但當前的改善速度無法滿足可持續性和糧食安全的需要。為了確保糧食安全、生態系統的可
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
宏基因組測序揭示神秘的生命領域
生物通報道：美國國家能源部Lawrence Berkeley實驗室和加州大學伯克利分校的研究人員采用科羅拉多蓄水層的沉積物和地下水樣本，通過宏基因組測序重建了二千五百多個微生物的基因組。這項研究發表在十月二十四日的Nature Communications雜志上，為人們揭示了地下世界驚人的生物學
宏基因組測序揭示神秘的生命領域
美國國家能源部Lawrence Berkeley實驗室和加州大學伯克利分校的研究人員采用科羅拉多蓄水層的沉積物和地下水樣本，通過宏基因組測序重建了二千五百多個微生物的基因組。這項研究發表在十月二十四日的Nature Communications雜志上，為人們揭示了地下世界驚人的生物學多樣性，給生
解碼基因組“暗物質”，拓寬生命認知疆域
人類約有2萬個基因，僅占DNA的2%，剩下的98%是什么？這些區域如同基因組中的“暗物質”，有待科學家去發現。非編碼RNA（核糖核酸）是基因組“暗物質”中的一類重要分子，最近十幾年才被發現。它們不僅在生命活動中發揮功能，還與許多疾病息息相關。 作為國際上較早從事長非編碼RNA研究的科學家之一，
整合基因組和組織學信息－基因組學公司聯手開拓新前沿
10x Genomics公司宣布收購位于瑞典斯德哥爾摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空間基因組學（spatial genomics）領域的領先公司。空間基因組學是一個新興領域，它不但讓研究人員可以獲得單細胞內的基因組數據
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
德國基因組研究資源中心將關閉
德國基因組研究資源中心（RZPD）日前宣布，將在7月底終止服務，并且ImaGenes和Atlas生物實驗室（Biolabs）將會結果它的大部分服務內容。關閉的原因尚未公布。 這個以柏林和海德爾堡為大本營的非營利性機構通過Affy公司的歐洲代理商NimbleGen提供Affy公司芯片服務。該中心宣布
上海市資源植物功能基因組學重點實驗室通過驗收
2016年12月13日，上海市資源植物功能基因組學重點實驗室驗收會于上海辰山植物園（中國科學院上海辰山植物科學研究中心）舉行。會議由上海市科委基地處周婧主持，上海市科委基地處處長過浩敏處長、7名驗收評審專家及重點實驗室相關領導和人員出席了本次驗收會。 會上，辰山科研中心副主任馬金雙研究員對科委
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium，簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥，加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
生命大數據──樣本數字化多組學層次的生命健康大數據
2015 年初，奧巴馬提出精準醫學計劃，意在大規模測定癌癥病人的全基因組，獲得大數據，挖掘癌癥驅動基因，實現個性化精準用藥，解決癌癥對人類的威脅。2016 年初，拜登的癌癥登月計劃（Cancer Moonshot 2020）使精準醫學計劃正式落地。精準醫學很快紅遍全球，在世界各地、在國內也迅速催
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
缺乏數據使用指導原則，基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道，但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性，另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來，這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
Geneformics聯手明碼生物科技為全球基因組學大數據“瘦身”
美國加州森尼韋爾市，2017年2月14日——Geneformics數據系統有限公司（以下簡稱“Geneformics”）宣布攜手藥明康德集團企業明碼（上海）生物科技有限公司（以下簡稱“明碼生物科技”），正式將Geneformics世界領先的基因測序數據技術融入到明碼生物科技的工作流程。Genef
利用真實世界數據，驗證癌基因組學特征與臨床結果聯系
近日，在一項發表在《美國醫學會雜志》（JAMA）上的最新研究中，來自美國Flatiron Health和Foundation Medicine公司的研究人員利用大型臨床基因組學數據庫，證實了以前已知的非小細胞肺癌（NSCLC）患者基因組學特征與臨床結果的聯系，并證明了利用病人日常護理過程中獲得的
基因組數據分析的“金標準”
五月十八日，美國安大略癌癥研究所、俄勒岡健康與科學大學、賽智生物網絡（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 團體(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大學圣克魯茲分校的癌癥研究人員，在《Nature M
全新角度探索生命奧秘：脂質組學
血漿中約70%的代謝物是脂類，脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用，大大加速了脂質組學的發展，脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證，盡管我們對高血脂深惡痛絕，心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成，少了它，生命將一團亂麻以至
脂質組學：全新角度探索生命奧秘
血漿中約70%的代謝物是脂類，脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用，大大加速了脂質組學的發展，脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證，盡管我們對高血脂深惡痛絕，心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成，少了它，生命將一團亂麻以至