2025蛋白質組學大會之跨物種蛋白質組學研究

　　2025年10月14日下午，第12屆AOHUPO大會、第8屆AOAPO大會、π-HuB國際大科學計劃第三屆全球峰會暨第13屆CNHUPO大會“Cross-species Proteomics（跨物種蛋白質組學）”分會場于廣州白云國際會議中心國際會堂順利舉行。會議由中國科學院北京基因組研究所 （國家生物信息中心）張維綺研究員與楊平仿教授共同主持，匯聚了來自中國科學院、廣州實驗室、浙江大學、南方醫科大學南方醫院等國家頂尖高校與科研機構的杰出學者。演講嘉賓們圍繞不同物種間蛋白質組學的系統研究、物種進化適應機制解析及多組學融合分析等前沿方向展開深入交流。報告精彩紛呈，生動展示了蛋白質組學在解碼生命演化、疾病機制與衰老過程中的強大力量，為疾病診斷、藥物靶點發現和生物學基礎研究開辟了全新的視野。

分會報告

鄭萍 研究員

中國科學院昆明動物研究所

Na?ve Pluripotency and Genomic Stability are Coordinated in Mouse Embryonic Stem Cells by a Novel Pluripotency Regulator Zfp998

　　鄭萍研究員通過對小鼠胚胎干細胞多能性維持機制的系統解析，發現新型多能性調控因子Zfp998在維持基因組穩定性與干性狀態之間發揮了關鍵的橋梁作用。該研究揭示了Zfp998通過協調核心多能性網絡與DNA損傷修復通路，為干細胞治療的臨床安全轉化提供了關鍵的技術支持。

詹祥江 研究員

中國科學院動物研究所

Qinghai-Tibet Plateau Adaptation of a Top Predator-Saker Falcons

　　詹祥江研究員基于整合種群基因組學、三維基因組學及生態學方法，系統揭示了青藏高原獵隼在極端環境下的分子適應機制。研究整合轉錄組、代謝組和關鍵蛋白數據，發現其能量代謝和氧化應激相關通路的進化重塑，是高原物種適應低氧的重要分子基礎。這些工作闡釋了動物通過順式調控元件空間重構與代謝通路協同進化實現快速適應的新機制，為系統理解物種適應性進化提供了全新范式。

姚紅杰 研究員

廣州實驗室

Capturing R-loops at Base-Pair Resolution Reveals Clustered R-Loops Activating Gene Expression and YMCAG-Contained R-Loops Inducing DNA Damage

　　姚紅杰研究員開發了一種無需抗體、低成本、高分辨率的R-loop全基因組定位新技術，首次揭示了R-loop在基因組中成簇存在的組織規律，并鑒定出導致DNA損傷的特異性序列特征，為理解R-loop在基因表達調控和基因組穩定性維護中的雙重作用提供了全新視角。

郭國驥 教授

浙江大學

Mapping and Modeling Cell Landscapes at Single-Cell Level

　　郭國驥教授團隊利用單細胞組學與人工智能的交叉創新，系統構建了跨物種、多組織的細胞景觀圖譜以及多層次預測模型。其研究團隊構建了跨物種單細胞泛基因組AI模型“女媧”，實現了基于DNA序列的特異性染色質開放性預測。開發“神農”藥物虛擬篩選平臺，通過單細胞水平的藥物擾動模擬，為精準藥物組合設計和個體化治療提供了新的計算策略。郭國驥教授的系列工作推動了生命科學研究進入“虛擬細胞”（Virtual Cell）的新時代，展示了AI在揭示生命調控與創新藥物研發中的巨大潛力。

周麗麗 教授

南方醫科大學南方醫院

Proteomics and Metabolomics: Discovering the Eye of Storm in Kidney Diseases

周麗麗教授在腎臟疾病蛋白質組學與代謝組學領域取得系列進展，系統揭示了腎臟疾病關鍵致病機制并識別潛在干預靶點。該團隊發現外泌體來源OPN蛋白是腎臟纖維化過程的關鍵驅動因子，并證實線粒體蛋白FAM3A通過影響腎小管上皮細胞焦亡，參與急性腎損傷的發生發展。該系列工作為腎病早期診斷與精準干預提供了可轉化的分子工具和路徑。

張維綺 研究員

中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）

Deciphering Aging Mechanisms and Developing Interventions Based on Aging Clocks

　　張維綺研究員聚焦衰老的分子機制及干預策略，建立了從衰老評估到機制解析再到干預策略的完整科研體系，為衰老科學從基礎研究向臨床轉化提供了關鍵理論支持和技術平臺。其研究團隊構建了首個中國女性衰老時鐘，實現生物學年齡以及衰老干預評估的精準量化；通過跨越50年的人體多器官蛋白質組學研究，團隊繪制出人類器官衰老全景圖譜，并鑒定RNA結合蛋白 ARID5A 為驅動心臟炎癥性衰老的重要節點；結合人群組學與腸道菌群分析，鑒定出具有延緩衰老作用的益生菌及其代謝物5-AVAB，可在動物模型中顯著延長健康壽命。該系列研究系統揭示了衰老的分子驅動力與組織異步性，構建了可衡量、可干預的多維衰老評估體系，為精準衰老診斷與干預提供了理論依據與技術支撐。

本次“跨物種蛋白質組學”論壇的成功舉辦，不僅展現了蛋白質組學技術從微觀細胞到宏觀物種演化、從基礎研究到臨床轉化的廣泛應用，更凸顯了多學科交叉融合在破解復雜生命現象中的巨大潛力。六場報告層層遞進，為未來跨物種、多維度的生命科學研究注入了新的活力與靈感。