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George Church 及同事開發出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的單分子DNA方法的一個“單分子相互作用測序”(SMI-seq)技術。 SMI-seq的工作原理是，通過核糖體顯示或酶結合將蛋白耦合到DNA識別符或“條碼”上。 這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析，并在一個聚丙烯酰胺薄膜中被固定。 接下來，條碼RNA被放大，并通過DNA測序被分析。該方法可以實現精確的蛋白量化以及對分子結合親和力和特異性的同時測定。......閱讀全文
凝膠遷移或電泳遷移率實驗（EMSA）可以：（1）研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用；（2）可用于DNA定性和定量分析；（3）用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。實驗方法原理一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。這一技術最初
以下問題是以Promega公司試劑盒為例。凝膠遷移實驗1)什么是凝膠遷移或電泳遷移率實驗？凝膠遷移或電泳遷移率實驗（EMSA）是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白，目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互
真核生物基因組極具復雜性。如何將宏觀尺寸的基因組DNA包裝入微米級的細胞核中是生命科學的基本問題之一。在細胞周期中，基因組具有高度組織性。在細胞周期間期，基因組形成不同的區室（Compartment）和結構域（Domain），而在有絲分裂期，基因組被高度凝聚成X形染色體。一類高度保守的ATP酶多
本文中，小編盤點了多篇研究報告，共同解析科學家們在組蛋白研究上取得的新成就，與大家一起學習！圖片來源：Daniel N. Weinberg et al，doi:10.1038/s41586-019-1534-3 【1】Nature：揭示組蛋白標記H3K36me2招募DNMT3A并影響基因間DN
實驗方法原理 凝膠遷移或電泳遷移率實驗（EMSA-electrophoretic mobility shift assay）是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白，目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列
腺病毒載體的優點：1. 宿主范圍廣, 對人致病性低腺病毒載體系統可廣泛用于人類及非人類蛋白的表達。腺病毒可感染一系列哺乳動物細胞，因此在大多哺乳動物細胞和組織中均可用來表達重組蛋白。特別需要指出的是：腺病毒具有嗜上皮細胞性，而人類的大多數的腫瘤就是上皮細胞來源的。另外，腺病毒的復制基因和致病基因均已
隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域，要想提供蛋白因子直接調控的證據，需要直接檢測蛋白質-DNA的相互作用，而染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）就是一種研
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節，這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映，這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
實驗方法原理 一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白，目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊，主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文，評論性文章以及snapshots，涉及了同一領域的方方面面，更為重要的是這些文章由贊助商贊助，可以免費獲取。 蛋白與DNA之間
2012年9月27日，清華大學生命學院施一公教授研究組，醫學院顏寧教授研究組和北京大學席建忠教授合作在細胞子刊《細胞―報告》(Cell Reports)在線發表論文，報道轉錄激活因子樣效應蛋白(TALE)能夠特異識別DNA-RNA雜合鏈，并且能夠保護DNA-RNA雜合鏈不被核酸酶降解，這一發
凝膠遷移實驗有稱凝膠阻滯實驗或電泳遷移率實驗（EMSA，electrophoretic mobility shift assay），是一種用于蛋白與核算相互作用的技術。最初是用于轉錄因子與啟動子相互作用的驗證性實驗，也可應用與蛋白-DNA、蛋白-RNA互作研究。 一、實驗原理 EMSA主要基于蛋白
來自美國托馬斯杰斐遜大學的一個研究團隊獲得了關于組蛋白修飾作用相反的證據。在一項果蠅胚胎研究中，他們發現親代的甲基化組蛋白并沒有轉移給子代DNA。相反，在DNA復制后，由新合成的未修飾組蛋白組裝成了新的核小體。相關論文發布在8月23日的《細胞》(Cell)雜志上。 托馬斯杰斐遜大學生物化學
為了將大約兩米長的人DNA攜帶的遺傳信息包裝到細胞核中，人細胞所要完成的工作相當于將80公里長的線放入一個足球大小的球體中。早在1882年，德國生物學家Walther Flemming便通過顯微鏡進行了觀察，發現了有關這種包裝是如何實現的線索。他當時觀察到位于卵細胞細胞核內的DNA環，這讓他想起
21世紀，表觀遺傳學的研究得到了快速發展，同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西，當然了，這其中也存在一些大肆宣傳的成分，本文中，我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的，同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展；我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用，以及表觀
引人注目的是，活的細胞當準備分裂時，能夠將一堆雜亂的長達兩米的DNA包裝成整齊的微小染色體。然而，科學家們幾十年來一直對這個過程是如何發生的感到困惑。如今，在一項新的研究中，來自荷蘭代爾夫特理工大學卡夫利研究所和位于德國海德堡的歐洲分子生物學實驗室（EMBL）的研究人員分離出這個過程，拍攝它的影
本周又有一期新的Science期刊（2018年9月28日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。 1.Science：重大進展！鑒定出有害藻花產生強效神經毒素軟骨藻酸的基因簇 doi:10.1126/science.aau0382; doi:10.1126/science.aau9067
人細胞會產生蛋白致癌物。癌癥是一種突變疾病。在特定基因中積累了多種突變的正常細胞很可能變成癌細胞。導致癌癥的突變是DNA損傷的結果。香煙煙霧和陽光等外部因素能夠破壞DNA，但大多數DNA損傷似乎是由細胞內發生的事件引起的，并且是由細胞組分（包括蛋白）介導的。盡管這些事件很重要，但是它們并未得到廣
生物學的眾多奧秘之一是：細胞如何巧妙地分配它復制的DNA到兩個子細胞中？一個多世紀以來，我們已知道細胞中的DNA就好比一盤意大利面條：雜亂地混合在一起的面條。當細胞分裂時，它們必須將兩米長的DNA包裝成整潔的小包裹---染色體。這種包裝是由凝縮蛋白（condensin）誘導的，但是科學家們對它的
2013年2月15日美國《科學》雜志發表了題為“Probing Allostery through DNA”的研究報告，通過單分子生物物理等手段嚴謹地證實了DNA中確實存在別構效應。該研究揭示了DNA一個新的基本性質，不但在物理上非常有趣，而且有重要的生理意義。 該項工作是由美國科學院
7月，最新一期的冷泉港實驗手冊《Cold Spring Harbor Protocols》發布。按照慣例，有兩篇protocol是可以免費閱讀的，其中一篇介紹了如何驗證蛋白-DNA相互作用的功能重要性。這篇文章節選自《真核生物的轉錄調控：概念、策略與技術》一書，是由美國加州大學洛杉磯分校(U
（1）什么是凝膠遷移或電泳遷移率實驗？凝膠遷移或電泳遷移率實驗（EMSA）是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白，目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常將純化的蛋白和細胞粗提液和32P同位素標記
在基因之間的DNA片段，散布著重復序列，曾經被認為是“基因組垃圾”，但現在科學家們了解到，一些這樣的垃圾DNA并不是無害的。在《Cell Reports》發表的一項研究中，來自北卡羅來那大學（UNC）Lineberger綜合癌癥中心的研究人員報道稱，某些短的DNA重復序列，或“垃圾DNA”，在尤文肉
一項單分子研究揭示出了DNA修復蛋白：RecAll如何克服其它蛋白的競爭，結合到單鏈DNA上，又是如何在這個過程中取勝的。這項由加州大學戴維斯分校的研究人員完成的研究觀察到正準備接受修復時的單鏈DNA，這將有助于人們理解乳腺癌的起源。相關成果公布在Nature雜志上。 為了修復DNA雙螺旋
TFIIB與預啟動復合物結合后，致使RNA聚合酶II和TFIIF結合到轉錄啟始區。故TFIIB在預啟動復合物的形成中有重要作用。當用純化的 TFIID作凝膠遷移實驗時，poly dI-dC不用加入結合反應中。結合緩沖液含10%甘油，20mM Tris（pH8.0）， 10mM MgCl2,
對DNA與組蛋白的相互作用的認識是我們進一步了解其功能和探討生命現象的重要基礎。原子力顯微鏡(AFM)成像分辨率高、成像直觀,且樣品制備簡單,不需要經過脫水、抽真空、染色、包埋等 這些會使生物分子結構發生一定改變的復雜處理過程,并可對生物分子在近生理條件下檢測
生物大分子在自然進化中發展出一套獨特的“自下而上”自組裝方式進行各種復合結構的可控裝配，為多功能生物納米材料的加工制備提供了絕佳范例。其中，核酸-蛋白質納米復合體系的可控構筑，不僅將實現生物學上兩種基本組裝模式的有效結合，以提供愈加復雜的生物結構模板，還有助于體內生物大分子相互作用的深入理解，對
生物制品中殘留DNA檢測標準的變化2015年3月底，中國食品藥品檢定研究院網站的國家藥品標準物質目錄中新增加了一個編號為410001的產品：CHO宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒（PCR-熒光探針法）。這個由中檢院與中科院聯合研發，由生物制藥企業參與標定的試劑盒與現行美國藥典（USP）建議的檢測方法同步
來自北京大學生科院的研究人員發表了題為“Sap1 is a replication-initiation factor essential for the assembly of pre-replicative complex in the fission yeast Schizosacchar
序言隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學的研究逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域。研究某個蛋白因子的調控功能，可以通過對蛋白活性（激活或抑制其活性），蛋白數量（過表達Overexpression或基因缺陷型Knockout）, 以及蛋白功能（功能缺陷