昆明動物所生物多樣性快速監測法研究獲進展
生物多樣性測量在解決我國環境問題的工作中受到了越來越多的關注，例如對具有豐富及特有生物多樣性的地區進行調查和監測、病害蟲及環境污染的監控、生態保護項目(如人工橡膠林種植)的管理與監督等。然而，傳統的生物多樣性測量既耗時又費錢，尤其需要很多分類學家的加入。不同于普通的管理問題， “分類學障礙”已成為了人們對生物多樣性研究的絆腳石。 近期，中科院昆明動物研究所生態學與環境保護中心(ECEC)的研究人員結合metabarcoding、生態學、生物信息學和統計學方法，建立了一套環境科學研究的“生態-信息學(eco-informatic)”全新模式。Douglas研究員及其團隊利用馬氏網誘捕節肢動物，對整個混合樣本DNA的COI基因擴增后進行高通量測序，并結合生物信息學手段進行分析，整個過程被稱為metabarcoding。該團隊人為建立了7個節肢動物的群落(主要為昆蟲)，并證明了metabarcoding方法對群落組成成分......閱讀全文
生態學專家共話亞洲生物多樣性保護
2010年是聯合國國際生物多樣性年，在日前的“國際生物多樣性日”，300余名來自中、日、韓的專家、官員和居民齊聚麗江，共同探討生物多樣性的未來發展方向，加強亞洲生物多樣性保護的合作交流。 各國生態學家們展開了熱烈的討論與交流。中科院昆明植物研究所研究員裴盛基談了民族文化傳承與生物多樣性保
“聽”來的生物多樣性－音景生態學大起底
今年早些時候，音景生態學家Bryan Pijanowski在婆羅洲的一個研究塔上安裝絨毛狀的麥克風。圖片來源：KRISTOFFER AHLM Michael Scherer-Lorenzen是向德國科學基金會申請資金的80多位科學家中的一員。去年11月，他在波茨坦市召開的一次評審會議上
生物信息學教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
分子生態學詞匯基因多樣性指數
中文名稱：基因多樣性指數英文名稱：gene diversity index定 義：一個種群中每個位點上平均期望雜合度。一般用符號“H”表示。應用學科：生態學（一級學科），分子生態學（二級學科）
分子生態學詞匯遺傳多樣性指數
中文名稱：遺傳多樣性指數英文名稱：genetic diversity index定 義：度量遺傳多樣性水平的一種測度。應用學科：生態學（一級學科），分子生態學（二級學科）
水生所揭示中國淡水生物多樣性保護的生態學機制
近日，中國科學院水生生物研究所關于中國淡水生物多樣性保護的生態學機制的論文“Challenges to saving China’s freshwater biodiversity: fishery exploitation and landscape pressures”在環境生態類綜合期刊A
生物芯片用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
生物信息學技術的原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物信息學新進展
計算機技術和人類基因組計劃的發展，應運而生了一門新興的學科——生物信息學，該學科包含了兩個交叉領域的工作：用于建立現代生物學所需信息系統框架（支持生物學的信息管理系統、分析工具和通訊網絡）的研究開發工作，即傳統意義上的生物信息學（bioinformatics）；旨在理解基本生物學問題的基于計算的研究
昆明動物所生物多樣性快速監測法研究獲進展
生物多樣性測量在解決我國環境問題的工作中受到了越來越多的關注，例如對具有豐富及特有生物多樣性的地區進行調查和監測、病害蟲及環境污染的監控、生態保護項目(如人工橡膠林種植)的管理與監督等。然而，傳統的生物多樣性測量既耗時又費錢，尤其需要很多分類學家的加入。不同于普通的管理問題， “分類學障礙”
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
成都生物所開發新型生物信息學軟件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm????? ?近年來，隨著測序技術的快速發展，動物（尤其是非模式動物）全基因組數據（WGS）獲取變得簡單、便宜，這使得數據庫中全基因組數據量呈指數態勢增長。全基因組測序數據往往同時包含
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
生物信息學—促動BT與IT雙贏
? 無論是與結構基因組學對應的“基因時代”，還是與功能基因組學、蛋白質組學相應的“后基因時代”；無論你稱呼21世紀是“信息時代”、“后信息時代”，還是“生物時代”，所有這一切，都將BT(生物技術)與IT(信息技術)緊密結合起來。而這其中，無疑“生物信息學”占據了天時地利、出盡了風頭，雖然它自身及其相
生物信息學技術的技術原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物芯片技術應用與生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
國際生物多樣性日：保護生物多樣性全球在行動
５月２２日，是國際生物多樣性日，而今年又是聯合國確定的國際生物多樣性年。 ?????? 生物多樣性與人類息息相關。如果沒有生物多樣性，人類難以感受到樹林的綠意，還可能失去空氣、食物和水。如果沒有多姿多彩的其他生命形式，不僅生活會變得索然無味，而且人類可能
Science：生物信息學，神秘的新職業
今天的生物信息學家迎來了好時候。由于各個部門生成了幾乎無窮無盡的生物數據，因此形成了對于生物、統計學和計算機科學交叉領域中有經驗的專業人才的高度需求。科學家如果能夠分析大量信息并將其清晰地展示給決策制定者，就會發現自己的工作和職業生涯前途無量，尤其是在大型制藥和生物技術部門。 “在大數據時代，
Cystatin基因家族的生物信息學分析
實驗概要半胱氨酸蛋白酶抑制劑(cystatin)基因廣泛存在于植物物種中。該類基因能夠起到抑制某些病原微生物和昆蟲體內半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防衛體系中起到重要作用。我們利用已經分離出植物cystatin基因的cystatin結構域為檢索序列在基因組水平上對擬南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息學中的HSP的含義
熱休克蛋白（英文：heat shock protein ）又稱應激蛋白，是機體細胞在一些理化因素刺激后高效表達的一組蛋白質，因最先發現于果蠅唾液腺的熱應激反應中而得名，此后的研究表明，熱休克蛋白廣泛存在于人、動物、微生物和植物的細胞中，是一類在遺傳上高度保守的分子，能保護細胞并促進細胞對各種刺激所造
分子生態學詞匯根井正利基因多樣性指數
中文名稱：根井正利基因多樣性指數英文名稱：Nei's gene diversity index定 義：由根井正利(Masatoshi Nei)提出來的測度基因多樣性的指數。H=1-(∑Pi2)/N, 這里，Pi是等位基因的頻率，N是種群的基因座數。應用學科：生態學（一級學科），分子生態學
分子生態學詞匯轉基因生物
中文名稱：轉基因生物外文名稱：transgenic Organisms定? ? ? 義：“轉基因生物”一詞的最初來源是英語“Transgenic Organisms”，因為在上世紀70年代，重組脫氧核糖核酸技術（rDNA）剛開始應用于動植物育種的時候，常規的做法是將外源目的基因轉入生物體內，使其得到
生物專業最強“殺手锏”：如何自學生物信息學？
當下，在部分學習生物專業的學生面臨工作難找、科研難做的多重窘境之際，基因產業和個體化用藥卻在以前所未有的速度蓬勃發展，遺傳咨詢師行業亦初露頭角。傳統學習生物專業的學生，可謂是趕上了“最好的時代”，倘若你知道如何解開維系健康的生命密碼信息，你將變得無可替代。那么問題來了，如何自學生物信息學？本文是
生物多樣性的概念
生物多樣性（biodiversity）是雷蒙德在1968年提出的生態學術語。生物多樣性是生物（動物、植物、微生物）與環境形成的生態復合體以及與此相關的各種生態過程的總和，包括生態系統多樣性、物種多樣性和基因多樣性三個層次。生物多樣性使地球充滿生機，也是人類生存和發展的基礎，可通過就地保護和遷地保護等
生物多樣性的特點
全球特點從整個地球范圍來看，生物多樣性分布明顯與緯度有關，南北兩極是生物多樣性最少的區域。相反，在熱帶地區則集中了大部分的生物種類。處于這兩個典型地帶的中間區的溫帶，其生物多樣性少于熱帶而多于寒帶。例如，在國土面積大致相等的委內瑞拉和法國，其哺乳動物的種數相差3倍以上，前者有350種，而后者只有11
特征選擇在生物信息學中的應用
隨著生物信息學的發展，許多模式識別技術無法滿足處理大量不相關特征的需求，因此特征選擇技術（FS techniques）在生物信息學中的應用就變得越來越重要了。在過去的幾年里，應用特征選擇技術已經從僅僅作為一個說明性的例子發展到了建立模型所需要的先決條件了。特征選擇技術最重要的目的有3點：（1）避免過
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能 GeneSpring 現可實現通路水平的多組學及新一代測序數據分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)今日發布了其廣受歡迎的生物信息學軟件的重要擴展版本
第五屆全國生物信息學大會召開
第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會日前在哈爾濱召開，來自海內外的600余位生物信息學專家、學者出席會議。與會專家以“高通量時代的生物信息學與系統生物學”為主題，分別就利用基因組信息學分類細菌的新方法、細菌基因組組織形式、系統生物學在醫學發展中的應用和研究策略以及基因組非編碼
德國生物信息學家發現新冠病毒新弱點
??近日，德國的生物信息學家通過計算機模型識別出人體中一種對新冠病毒繁殖至關重要的酶，如果抑制這種酶，病毒就會停止繁殖而不影響宿主細胞。該研究有助于找到對抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗，尋找有效的治療新冠病毒感染的藥物也是戰勝疫情的重要手段之一。現在，來自德國感染研究中心和蒂賓根大學的德爾格
生物信息學應用：序列分析，電子克隆等初探
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛，從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看，生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來，蛋白質結構數據的快速增長，使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信