DNA的從頭合成是合成生物技術的基礎平臺之一。但是,由于大規模DNA合成過程中難以避免地產生錯誤,DNA糾錯環節的效率和經濟性已經成為限制DNA合成質量、通量與成本的關鍵問題之一。針對此瓶頸,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心研發出高耐久低成本的DNA合成糾錯系統,大幅度提高了DNA糾錯環節的效率和經濟性。該研究成果發表于《美國化學會合成生物學》。 據了解,寡核苷酸的化學合成、DNA聚合酶的延伸、基于寡核苷酸的基因片段組裝等大片段DNA合成的每一步驟均可能引入錯誤堿基。這些“錯誤”如果沒有被及時“糾正”,它們將隨著核酸鏈的復制而傳播和擴散,導致DNA合成產物中一般只有5%-60%具有完全正確的序列。 與其它的酶糾錯系統相比,DNA錯配修復蛋白(MutS)的糾錯效率較高,而且使用相對簡便。但在實際應用中,MutS酶活的持久性較差,在7天左右即開始顯著下降,導致在一個完整的基因組合成流程中需要多次表達與純化。這不......閱讀全文
DNA的從頭合成是合成生物技術的基礎平臺之一。但是,由于大規模DNA合成過程中難以避免地產生錯誤,DNA糾錯環節的效率和經濟性已經成為限制DNA合成質量、通量與成本的關鍵問題之一。針對此瓶頸,青島能源所單細胞中心研發出高耐久低成本的DNA合成糾錯系統,大幅度提高了DNA糾錯環節的效率和經濟性。該
DNA的從頭合成是合成生物技術的基礎平臺之一。但是,由于大規模DNA合成過程中難以避免地產生錯誤,DNA糾錯環節的效率和經濟性已經成為限制DNA合成質量、通量與成本的關鍵問題之一。針對此問題,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心研發出高耐久低成本的DNA合成糾錯系統,大幅度提高了DNA糾
在課堂內外,美國麻省理工學院(MIT)的Joseph Jacobson教授,已經成為合成生物學新興領域的一位倡導者和杰出人物。 作為麻省理工學院媒體實驗室分子機器研究組的負責人,Jacobson的工作主要集中在開發快速合成DNA分子的技術。在2009年,他成立了Gen9公司,旨在通過為科學家提供
麻省沃爾瑟姆市(Waltham, Massachusetts)的一座鋼筋混泥土建筑的二樓,一個實驗室冰箱里的塑料盒中,包含著無數種化學分子。這些分子是葛蘭素史克制藥公司(GlaxoSmithKline,GSK)合成的帶DNA標簽的分子,數目達到萬億種——這是銀河系恒星數目的10倍。 各大制藥公
DNA如何存儲下整個世界的數據 對于英國欣克斯頓歐洲生物信息研究所(EBI)組長Nick Goldman來說,在DNA中編碼數據的想法是從一個玩笑開始的。 2011年2月16號星期三,Goldman正在德國漢堡的一家酒店中,與他的一些生物信息學家同事談論如何將大量現有的基因組序列和其他被世界
試驗的注意事項1、信號肽識別位點的設計以質粒pPICZαA為例。在利用PCR反應在外源基因兩端引入酶切位點的試驗中。如果質粒pPICZαA雙酶切中丟失了KEX2蛋白酶的酶切位點 Lys-Arg,應該在上游中,增加了編碼Lys、Arg的密碼子AAA、AGA 。酵母細胞膜中中的KEX2蛋白酶是α
3.5 Pichia酵母表達直接PCR鑒定重組子的方法3.5.1 模板的處理:1. 平板上的菌落長到肉眼可見時(約12小時);2. 將除了模板之外的其它PCR反應液的組分準備好,并分裝。引物最好使用Kit中已有的檢測專用的引物,或者或者一條使用載體上的引物,一條使用基因的特異性引物(這樣做可以鑒定非
對于Nick Goldman來說,在DNA中編碼數據的想法始于一個笑話。或許最多10年之后,沒有人會再相信磁帶儲存。圖片來源:Wes Fernandes 那是2011年2月16日,Glodman和一些生物信息學領域的朋友在德國漢堡聊天,話題是他們如何才能儲存全世界涌來的基因組序列和其他數據洪流
自從Alpha Go成了圍棋界的No.1,“智能”的潛力被廣而周知,尤其對于大量的重復性工作,寫個“算法”讓電腦“跑”,得出的結果說不定比人強。 科學家不僅有足夠大的腦洞,還有著非凡的執行力。這次是生物學者,他們借鑒了信息學科的思維,發明了基因測序的新方法。日前,一篇名為《基于信息理論來修正
自從Alpha Go成了圍棋界的No.1,“智能”的潛力被廣而周知,尤其對于大量的重復性工作,寫個“算法”讓電腦“跑”,得出的結果說不定比人強。 科學家不僅有足夠大的腦洞,還有著非凡的執行力。這次是生物學者,他們借鑒了信息學科的思維,發明了基因測序的新方法。日前,一篇名為《基于信息理論來修正
RNA病毒包括多種人類和動物致病病原,對人類健康構成嚴重威脅。這類病毒的基因組復制過程不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身編碼的依賴RNA的RNA聚合酶(RdRP)來主導完成。病毒RdRP可準確而高效地實現多達數萬個核苷酸的合成,并將合成的出錯率水平維持在萬分之一上下。在其他生命形式中,長鏈核酸
PCR反應的準備PCR反應體系10×擴增緩沖液10μl4種dNTP混合物(終濃度)各100~250μmol/L引物(終濃度)各5~20μmol/L模板DNA0.1~2μgTaq DNA聚合酶5~10 UMg2+(終濃度)1~3mmol/L補加雙蒸水100 μl其中dNTP、引物、模板DNA、Taq
自從AlphaGo成了圍棋界的No.1,“智能”的潛力被廣而周知,尤其對于大量的重復性工作,寫個“算法”讓電腦“跑”,得出的結果說不定比人強。科學家不僅有足夠大的腦洞,還有著非凡的執行力。這次是生物學者,他們借鑒了信息學科的思維,發明了基因測序的新方法。日前,一篇名為《基于信息理論來修正錯誤的高準確
一種全新概念的測序方法 北京大學生物動態光學成像中心,北京未來基因診斷高精尖創新中心等處的研究人員發表了題為“Highly accurate fluorogenic DNA sequencing with information theory–based error correction”的文
氨酰tRNA合成酶(aaRSs)可以確保翻譯過 程中生成正確的氨酰tRNA,這對絕大多數物種是至關重要的。中科院上海生命科學研究院的研究團隊通過深入研究,向人們展示了多種ThrRS的翻譯質控, 揭示了N1結構域在翻譯保真中起到的作用。這一成果發表在八月十九日的Journal of Biologi
蛋白質合成是DNA信息通過信使依次傳遞的過程,其中任何一步都有可能出錯。正因如此,每一步都有專門的酶來進行校讀,確保DNA編碼的信息能夠正確地傳遞到蛋白。最近,冷泉港實驗室(CSHL)的科學家們揭示了一種全新的質控機制。他們驚訝的發現,校讀不再是酶的專利,tRNA本身就有內置
蛋白質合成是DNA信息通過信使依次傳遞的過程,其中任何一步都有可能出錯。正因如此,每一步都有專門的酶來進行校讀,確保DNA編碼的信息能夠正確地傳遞到蛋白。最近,冷泉港實驗室(CSHL)的科學家們揭示了一種全新的質控機制。他們驚訝的發現,校讀不再是酶的專利,tRNA本身就有內置的糾錯系統。這項研究
靶向藥物作用機理 現代腫瘤治療學已有百余年的歷史,但在20世紀40年代前最有效的治療手段只有手術和放療。由于殘留癌腫的微小轉移存在,約1/3的腫瘤細胞難以徹底殺死。后來,人們發現化學藥物可以殺死一些晚期腫瘤細胞并進一步發現物理療法聯合化療可以很好解決殘留癌腫的微小轉移問題,自此開啟了抗腫瘤
2018年,Anversa實驗室超過30篇文章由于造假而撤稿,這一事件對于心肌細胞治療領域帶來了非常負面的影響。在過去的18年間,許多醫生和科學家以此不實結論花費數年進行的科學研究變得毫無意義,不僅使病人蒙受了極大的損失,在該領域里投入的數百萬計資金也付之東流。然而,骨髓細胞或者是成體駐留的心肌
新冠肺炎病毒因其強大的感染和傳播能力,在全球掀起了一場緊急防控大戰。在這一過程中,一系列疑問在醫生、科學家,甚至普通人的心中浮現:是什么決定了冠狀病毒是否、何時、如何傳染給人類,以及達到怎樣的傳染程度?為什么不同冠狀病毒的致病性會有如此大的區別:有的只是讓人流鼻涕,而有的則會引發重癥肺炎?過去
生物探索網站報道 據外媒報道,有科學家稱,他們組合了一條更完整的基因鏈條,這個基因鏈條可以控制鸚鵡模仿主人和其他聲音的能力。 研究者用一種新技術分解了鸚鵡的基因組中的某個區域,進行了單分子測序,并用來自較早的DNA解碼設備的數據對其進行了糾錯。研究者還解碼了來自玉米和細菌的難以測序的基因物
據外媒報道,有科學家稱,他們組合了一條更完整的基因鏈條,這個基因鏈條可以控制鸚鵡模仿主人和其他聲音的能力。 研究者用一種新技術分解了鸚鵡的基因組中的某個區域,進行了單分子測序,并用來自較早的DNA解碼設備的數據對其進行了糾錯。研究者還解碼了來自玉米和細菌的難以測序的基因物質,以此來證明他們
在國家自然科學基金項目(項目編號:21327808,21525521)等資助下,北京大學黃巖誼課題組日前在DNA測序方法與技術上取得重要進展,發展一種全新概念的測序方法—糾錯編碼測序法(簡稱ECC),該方法采取一種獨特的邊合成邊測序(SBS)策略,利用多輪測序過程中產生的簡并序列間的信息冗余,大
一、導讀: 在大部分投資者對“二代測序”(NGS)還沒有搞清技術細節的情況下,“三代測序”(3GS)又火了。 6月17日,醫藥板塊中基因測序相關標的在“三代測序技術獲得重大突破”的新聞影響上出現明顯漲幅,我們也接到較多投資者對相關新聞的背景及觀點的詢問。為此,我們結合各方面資料歸納總結了三代
在“二代測序”(NGS)尚未迎來投資熱潮的情況下,技術突破捷報連連的“三代測序”(3GS)又進入到了投資人的視野中。1986年,第一臺商用基因測序設備正式出現,到第二代測序設備出現,期間間隔了19年時間。而第二代設備問世,到第三代設備的誕生,僅僅用了5年,基因測序設備的更新換代速度正在不斷加快。
測序技術在近兩三年中又有新的里程碑。以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies納米孔單分子測序技術,被稱之為第三代測序技術。與前兩代相比,他們最大的特點就是單分子測序,測序過程無需進行PCR擴增。其中PacBio SMRT技術其實也應用了邊合成邊測序的思想
美國的《Science》雜志由愛迪生投資創辦,是國際上著名的自然科學綜合類學術期刊,與英國的《Nature》雜志被譽為世界上兩大自然科學頂級雜志。Science雜志主要發表原始性科學成果、新聞和評論,許多世界上重要的科學報道都是首先出現在Science雜志上的,比如艾滋病與人類免疫缺陷病毒之間的
生命的延續是遺傳信息的傳遞,遺傳物質核酸(DNA/RNA)揭開了人類認識自我和生命奧秘的微觀世界。2015年的諾貝爾化學獎授予了瑞典、美國、土耳其三位科學家,以表彰其在“DNA修復的機制研究”做出的卓越貢獻。 人體細胞共約有40-60萬億個,而人類基因組卻是由23對染色體組成,其中包括22對體
生命的延續是遺傳信息的傳遞,遺傳物質核酸(DNA/RNA)揭開了人類認識自我和生命奧秘的微觀世界。 2015年的諾貝爾化學獎授予了瑞典、美國、土耳其三位科學家,以表彰其在“DNA修復的機制研究”做出的卓越貢獻。 人體細胞共約有40-60萬億個,而人類基因組卻是由23對染色體組成,其中包括22
江河日下,Pacific Biosciences連續虧損 自兩年前(2015年1月),美國總統奧巴馬在國情咨文中提出了“精準醫學計劃”(Precision Medicine Initiative)之后,“精準醫療”便成為全球健康領域的熱門話題,這直接推動了基因測序以及建立在其基礎上的分子診斷領