生科院發布首個全球人群基因組多樣性和祖源信息數據庫
11月3日，中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）計算生物學研究所徐書華課題組的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations為題，在線發表在《核酸研究》上。該研究分析了涵蓋全球范圍107個國家的356個人類族群的基因組多樣性和祖源信息，并發布了開放獲取的專門數據庫——PGG.Population（群體基因組學·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因組水平專門解析人類族群遺傳關系和祖源信息的公開數據庫，也是目前收集族群數量最大的群體基因組數據庫，為研究人員、臨床醫生及學生和公眾理解不同人群的遺傳背景提供查詢和分析平臺。 人類族群多樣性的形成是遷移、隔離、分化、再接觸和交流的復雜演化過程。同時，長期對特定環境的適應或能影響特定的性狀以......閱讀全文
Nature：用單細胞基因組探索多樣性
宏基因組研究極大地提高了我們對于細菌以及古細菌多樣性的理解。然而，環境宏基因組數據往往不容許個別物種的基因組組裝，因此，大多數完整的基因組序列來自于培養的微生物。如今，兩個新的大規模研究利用單細胞基因組，直接從未培養的環境樣本中恢復了細菌和古細菌基因組。 Rinke等人利用熒光活化性細胞分
Cell：全基因組測序揭示人類遺傳多樣性
遺傳的歷史就書寫在現代非洲人的DNA中，但還需要一些調查工作來對其進行注釋。在即將出現在8月3號《細胞》(Cell)雜志封面上的一篇報道中，賓夕法尼亞大學的遺傳學家們和他們的同事對分屬三個不同狩獵者(hunter-gatherer)群體的15個非洲人的完全測序基因組進行了分析，并破解了一些必定涉
基因組多樣性和祖源信息數據庫
?? 11月3日，中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）計算生物學研究所徐書華課題組的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
我國專家首繪蝎子基因組圖譜－揭開多樣性面紗
由武漢大學領銜，與上海生物信息技術研究中心合作，近日完成了對馬氏正鉗蝎(Mesobuthus martensii)的基因組測序，預測了32016個蛋白質編碼基因，在國際上第一個揭示了蝎子(scorpion)這一種獨特的節肢動物適應模式。 專家表示，馬氏正鉗蝎基因組的解析揭開了蝎毒素多樣
多樣性增加281％，人類腸道菌群基因組圖譜公布！
近兩年來，以免疫檢查點為藥物靶點的免疫檢查點抑制劑治療癌癥受到越來越多科研工作者的青睞。但是臨床研究結果表明，許多癌癥患者因接受免疫藥物治療而出現不同程度的免疫相關不良反應，最終出現不得不提前終止治療的情況。 而寄居在人體內的腸道菌群可以影響免疫檢查點抑制劑治療癌癥，能夠極大地改善患者對該療法
質體基因組多樣性演化，提供土壤碳動態新視角
近日，中科院植物研究所研究員楊元合團隊以青藏高原高寒草原生態系統為研究對象，依托野外長期氮添加控制實驗平臺，結合18O-DNA標記、高通量測序等技術揭示了氮添加影響土壤微生物CUE的新機制。相關研究成果發表于《全球變化生物學》。工業革命以來，化石燃料燃燒和農業化肥使用等人類活動導致大氣氮沉降增加。持
大豆基因組重測序表明:野生大豆遺傳多樣性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，華夏始祖將野生大豆馴化，變成今天的“五谷”之一。而今，一項被稱為“大豆回家”的基因組研究計劃在其故鄉中國取得突破。 11月15日，由香港中文大學、華大基因研究院、農業部基因組重點實驗室、中國農業科學院等單位合作完成的《31個大豆基因組重測序揭示遺傳多樣性和
蝴蝶基因組大小進化進展－發現表型多樣性進化遺傳基礎
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其
Illumina與PacBio測序數據幫助質體基因組多樣性演化機制
近日，中科院植物研究所研究員張憲春、副研究員向巧萍等揭示了自養維管植物中目前已知最特異的質體基因組。相關研究成果發表于《植物學報》。近年來質體基因組研究揭示了復雜多樣的結構和序列變異，對教科書上經典的四分體結構提出了挑戰。質體基因組多樣性演化的機制常被籠統地訴諸于DNA修復系統可能存在缺陷。科研人員
2012國際熱帶生物多樣性及基因組學研討會開幕
6月4日，“2012國際熱帶生物多樣性及基因組學專題研討會”（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics at Xishuangbanna Tropical Botanical Garden）在中國科學院西雙版納熱帶植物園舉行。會議
上海生科院發布基因組多樣性和祖源信息數據庫
?? 該研究分析了涵蓋全球范圍107個國家的356個人類族群的基因組多樣性和祖源信息，并發布了開放獲取的專門數據庫——PGG.Population（群體基因組學·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因組水平專門解析人類族群遺傳關系和祖源信息的公開數據庫，也是目前收集族群數量最大的群體基
植物多樣性能預測昆蟲多樣性
日前，應用宏條形碼技術，中科院昆明動物研究所研究員俞維理課題組對“植物多樣性精確預測昆蟲多樣性”的重要結論進行了驗證和擴展。 昆蟲具有宿主特異性，因此植物多樣性應該能夠預測昆蟲多樣性，但是已有的研究并不支持該結論；直到Basset 等人在一個熱帶森林里進行前所未有的全面采樣，并結合復雜的統計模
水生所揭示鯉科魚類基因組加倍促進血氧系統表型多樣性
生物的生存、繁殖、以及分布或多或少都受到環境氧的影響。生物的正常有氧代謝有賴于保持氧的需求（代謝）和供應（儲存和傳遞）的平衡關系。而實現這一平衡關系主要依靠生物體內特異的血氧傳遞系統。血氧系統的多樣化不僅體現了物種在生理上的多樣性，也從側面反映了物種對環境的適應能力。在進化史上，基因組加倍是生物
生科院發布首個全球人群基因組多樣性和祖源信息數據庫
11月3日，中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）計算生物學研究所徐書華課題組的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popula
多種養殖哺乳動物攜帶的病毒基因組遺傳多樣性被解碼
復旦大學公共衛生學院教授粟碩團隊與中國科學院微生物研究所研究員畢玉海等合作者，揭示了多種哺乳動物宏基因組數據中的病毒基因組組成、生態學特征與潛在跨物種傳播風險，為構建“人-動物-環境”一體化、多維度新發傳染病預測預警體系奠定了重要數據基礎。9月4日，相關研究發表于《自然》。21世紀以來，人類多次經歷
遺傳多樣性缺失導致少量人種被忽略－基因組學應包容性
一個來自被忽略人種的研究 幾十年來，Néstor Ruiz Hernández一直在爭取認可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一個小鎮長大。在那里，他和其他許多人都是十六世紀被人販子從非洲販運到墨西哥的奴隸的后代。他們認為自己是Afromexican，但該組織并未被墨西哥政府正式承認為少數族裔群體。
國際熱帶生物多樣性及基因組學專題研討會在版納園召開
6月27日至7月1日， 國際熱帶生物多樣性及基因組學專題研討會（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics）在中科院西雙版納熱帶植物園召開，來自十多個不同國家的三十余名科研人員參加了研討會。 本次研討會歷時五天，
非洲首個大型人類基因組學研究揭示高水平遺傳多樣性
南非科技部資助的“南部非洲人類基因組計劃（SAHGP）”，順利完成了對24名來自不同民族語言個體的全基因組測序，證實非洲人群存在高水平的遺傳多樣性，研究結果發表在《自然-通訊》期刊上。 該計劃是非洲首個由政府資助開展的人類基因組學研究，旨在揭示南部非洲人群的獨特遺傳特征，全方位發掘各類人群
非洲首個大型人類基因組學研究揭示高水平遺傳多樣性
南非科技部資助的“南部非洲人類基因組計劃（SAHGP）”，順利完成了對24名來自不同民族語言個體的全基因組測序，證實非洲人群存在高水平的遺傳多樣性，研究結果發表在《自然-通訊》期刊上。 該計劃是非洲首個由政府資助開展的人類基因組學研究，旨在揭示南部非洲人群的獨特遺傳特征，全方位發掘各類人群
如何通過計算多樣性指數評估苔蘚物種多樣性
通過計算多樣性指數來評估苔蘚物種多樣性，通常可以按照以下步驟進行：數據收集首先，需要通過實地調查、標本采集等方法，確定研究區域內苔蘚的物種組成以及每個物種的個體數量。選擇多樣性指數常見的用于評估苔蘚物種多樣性的指數包括香農 - 威納指數（Shannon-Wiener Index）、辛普森指數（Sim
抗體的多樣性
人血清中的抗體多種多樣，B淋巴細胞可產生的抗體種類在108以上，可與眾多不同抗原發生特異性結合。抗體多樣性的原因主要有兩方面： 1．外源性因素環境中抗原種類甚多，每種大分子抗原又有多種抗原表位，每種抗原表位均可選擇激活體內一個B細胞克隆，產生一種特異性抗體。 2．內源性因素抗體多樣性的另一個
抗體的多樣性
人血清中的抗體多種多樣，B淋巴細胞可產生的抗體種類在108以上，可與眾多不同抗原發生特異性結合。抗體多樣性的原因主要有兩方面：1．外源性因素環境中抗原種類甚多，每種大分子抗原又有多種抗原表位，每種抗原表位均可選擇激活體內一個B細胞克隆，產生一種特異性抗體。2．內源性因素抗體多樣性的另一個原因是由基因
物種多樣性指數
物種多樣性指數類別名稱計算公式物種多樣性指數Simpson指數D=1-∑Ni2Shannon-Wiener指數H=-∑PilogPi備注：式中，N為群落中所有物種個體總數，Pi=ni/N，ni為物種i的重要值，Ni為物種i的個體數。
國際生物多樣性日：保護生物多樣性全球在行動
５月２２日，是國際生物多樣性日，而今年又是聯合國確定的國際生物多樣性年。 ?????? 生物多樣性與人類息息相關。如果沒有生物多樣性，人類難以感受到樹林的綠意，還可能失去空氣、食物和水。如果沒有多姿多彩的其他生命形式，不僅生活會變得索然無味，而且人類可能
RFLP（擴增片段長度多樣性）研究遺傳多樣性的介紹
基于RFLP（限制性酶切片段多樣性） 和PCR技術發展起來的一種用來研究分類的技術.原理是：不同物種的DNA序列不同，那么用同種限制性內切酶酶切會得到不同的片段，這些不同的片段中，有很多長度也會有不同.通過同樣兩種限制性內切酶消化后，根據酶切位點序列設計互補序列并額外添加一段特異性序列，用T4連
如何利用多樣性指數評估苔蘚物種多樣性的恢復速度？
以下是利用多樣性指數評估苔蘚物種多樣性恢復速度的一般步驟：選擇合適的多樣性指數常見的用于評估物種多樣性的指數包括香農 - 威納指數（Shannon-Wiener Index）、辛普森指數（Simpson Index）、皮盧均勻度指數（Pielou's Evenness Index）等。香農
如何利用多樣性指數評估苔蘚物種多樣性的恢復速度？
以下是利用多樣性指數評估苔蘚物種多樣性恢復速度的一般步驟：選擇合適的多樣性指數常見的用于評估物種多樣性的指數包括香農 - 威納指數（Shannon-Wiener Index）、辛普森指數（Simpson Index）、皮盧均勻度指數（Pielou's Evenness Index）等。香農
物種多樣性與遺傳多樣性關系研究取得新進展
11月22日，國際權威植物學期刊New Phytologist在線刊出了中科院武漢植物園在物種多樣性與遺傳多樣性關系研究領域的最新成果（Contrasting relationships between species diversity and genetic diversity
基因多樣性的功能
基因多樣性(Gene diversity)代表生物種群之內和種群之間的遺傳結構的變異。每一個物種包括由若干個體組成的若干種群。各個種群由于突變、自然選擇或其他原因,往往在遺傳上 不同。
遺傳多樣性的定義
廣義的遺傳多樣性是指地球上所有生物攜帶的遺傳信息的總和。遺傳多樣性通過物種演化過程中遺傳物質突變并累積而形成。物種具有的遺傳變異越豐富，它對生存環境的適應能力也就越強，進化潛力也越大。而生態系統的多樣性是基于物種的多樣性，也就離不開不同物種所具有的遺傳多樣性。可以說，遺傳多樣性既是生物多樣性的重要組