(一)實驗程序如不謹慎操作,外源性RNA酶可以通過下述途徑污染RNA制品:(1)玻璃制品、塑料制品和電泳槽 滅菌的一次性使用的塑料制品基本上無RNA〈, /SPAN〉酶,可以不經預處理直接用于制備和貯存RNA。實驗室用的普通玻璃器皿和塑料制品經常有RNA酶法染,使用前必須于180℃干烤8小時或更長時間(玻璃器皿)或用氯仿沖洗(塑料制品)。另一種方法是用0.1 %焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡用于制備RNA的燒杯,試管和其他用品。DEPC是RNA酶的強烈抑制劑,但其作用并不是絕對的。灌滿DEPC的玻璃或塑料器皿在37℃放置2小時,然后用滅菌水淋洗數次, 并于100℃干烤15分鐘。在 15 lbf/in2(1.034x105Pa)高壓蒸氯滅菌15分鐘。上述處理可以除去器甲上痕量的DEPC,以防DEPC通過羧甲基化作用對RNA的嘌呤堿基進行修飾。 羧甲基化的RNA在無細胞體系中翻譯效率很低,然而,除非其中......閱讀全文
RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單
包括Northern雜交在內的許多分子生物學實驗均是以RNA為材料,mRNA的制備也需要一定質量的總RNA樣品,RNA的數量、純度與完整性將直接影響這些實驗的結果。RNA中rRNA的數量最多,占總量的80%~85%;tRNA及核內小分子RNA占15%~20%;mRNA僅占1%~5%。由于各種rRNA
實驗方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解實驗是分析 RNA 蛋合復合物(RNP,核糖核蛋白顆粒)的方法,無論是對于粗提物還是提純后的樣品,對分析 RNP 的結構域的結構都非
實驗方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解實驗是分析 RNA 蛋合復合物(RNP,核糖核蛋白顆粒)的方法,無論是對于粗提物還是提純后的樣品,對分析 RNP 的結構域的結構都非常有效。實驗材料 蛋白酶 KAMV 反轉錄酶試劑、試劑盒 緩沖液DNase ⅠDNase Ⅰ 緩沖液酚氯仿溶液乙酸鈉R
寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解實驗是分析 RNA 蛋合復合物(RNP,核糖核蛋白顆粒)的方法,無論是對于粗提物還是提純后的樣品,對分析 RNP 的結構域的結構都非常有效。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解實驗是分析 RNA 蛋合復合
1、塑料制品、玻璃和金屬物品的處理(a)塑料制品:盡可能使用無菌,一次性塑料制品。已標明RNase-Free 的塑料制品,如沒有開封使用過,通常沒有必要再次處理。對于國產塑料制品,原則上都必須處理方可使用。處理方法如下:(1)在玻璃燒杯中注入去離子水,加入DEPC使DEPC的終濃度為0.1%。注意:
1.RNA的提取 RNA的提取其實原理很簡單:通過變性劑破碎細胞或者組織,然后經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉淀,洗滌,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。 1.1分離高質量RNA 成功的cDNA合成來
真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟
【原理】RNA的制備與分析對于了解基因表達在轉錄水平上的調節是必不可少的,也是最常使用的通過cDNA途徑分析細胞基因表達的前提。通常一個典型的哺乳動物細胞約含10-5μg RNA,但其中大部分為rRNA及由tRNA,而mRNA僅占1%~5%。雖然mRNA大小和序列各不相同,但在多數真核細胞m
【原理】RNA的制備與分析對于了解基因表達在轉錄水平上的調節是必不可少的,也是最常使用的通過cDNA途徑分析細胞基因表達的前提。通常一個典型的哺乳動物細胞約含10-5μg RNA,但其中大部分為rRNA及由tRNA,而mRNA僅占1%~5%。雖然mRNA大小和序列各不相同,但在多數真核細胞mRNA的
生物谷: RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存
生物谷: RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單改變
實驗方法原理 將同位素標記探針與固定于顯微鏡載玻片上的細胞進行雜交,然后通過放射自顯影將雜交位點顯影。 實驗材料
實驗方法原理 將同位素標記探針與固定于顯微鏡載玻片上的細胞進行雜交,然后通過放射自顯影將雜交位點顯影。 實驗材料
2、色缸中加入含2%過氧化氫的PBS,于室溫反應5min。用PBS洗兩次,每次5min。3、用濾紙小心吸去載玻片上組織周圍的多余液體,立即在切片上加2滴 TdT酶緩沖液,置室溫1~5min。4、用濾紙小心吸去切片周圍的多余液體,立即在切片上滴加 54μl TdT酶反應液,置濕盒中于37C反應 1hr
在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶廣泛存在而穩定,一般反應不需要輔助因子。因而RNA制劑中只要存在少量的RNA酶就會引起RNA在制備與分析過程中的降解,而所制備的RNA的純度和完整性又可直接影響RNA分析的結果,所
關于平臺期和線性期的問題,實際上線性期是指數期,只不過碰巧2的冥和2的倍數是相同的。看上去任何一個時期都可以,實際上是不對的,因為牽涉到酶促動力學的問題,這個我也不懂,有一些專門的文章,好像,涉及到很多化學的東西。我們學醫的,也沒必要知道那些,但是其中主要是因為模板引物酶原料和buffer之間的關系
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。 真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋
RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA
PCR的用途及使用方法真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉
在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶廣泛存在而穩定,一般反應不需要輔助因子。因而RNA制劑中只要存在少量的RNA酶就會引起RNA在制備與分析過程中的降解,而所制備的 R
PCR儀的用途及使用方法真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是
在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶廣泛存在而穩定,一般反應不需要輔助因子。因而RNA制劑中只要存在少量的RNA酶就會引起RNA在制備與分析過程中的降解,而所制備的RNA的純度和完整性又可直接影響RNA分析的結果,所
在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶廣泛存在而穩定,一般反應不需要輔助因子。因而RNA制劑中只要存在少量的RNA酶就會引起RNA在制備與分析過程中的降解,而所制備的RNA的純度和完整性又可直接影響RNA分析的結果,所
實驗方法原理將同位素標記探針與固定于顯微鏡載玻片上的細胞進行雜交,然后通過放射自顯影將雜交位點顯影。實驗材料糖原瓊脂糖二硫蘇糖醇二硫蘇糖醇試劑、試劑盒焦碳酸二乙酯DEPC-水酚-氯仿-異戊醇乙酸鈉無水乙醇層析柱流動相緩沖液苯酚氯仿-界戊醇閃爍液組織洗滌液NaCl-DEPCEDTA蛋白酶K緩沖液蛋白酶
來源于任何細胞的RNA都可以通過反轉錄酶的作用拷貝成雙鏈DNA并克隆化,獲得相應的于特定細胞來源的cDNA文庫。因此,RNA制備的意義有兩個方面* 獲得特定細胞來源的cDNA文庫,克隆目的基因* 分析基因的表達,闡明基因調控的特性,了解從基因轉錄產生RNA的結構,數量,水平及合成的速率抑制RNA酶活
這一實驗方案分為 6 個階段。第 1 階段:降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 階段:完整 RNA 去帽; 第 3 階段:RNA 寡核苷酸的制備; 第 4 階段:RNA 寡核苷酸與細胞 RNA 的連接; 第 5 階段:反轉錄; 第 6 階段:擴增。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康
Eva Graf 安捷倫科技有限公司 Waldbronn, Germany 摘要 RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評
摘要RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評估標準 RNA 測序的樣品完整性的可靠且可重現的指標。由于 RNA 降解以及樣品體積有限,從福爾馬