第四屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP2016)
一、CNCP會議簡介 隨著蛋白質組學的興起,特別是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究中產生的數據規模越來越大,必須通過先進的計算機算法、高效的軟件與硬件來自動處理大批量的蛋白質組數據,這已經成為蛋白質組學研究的一個重要分 支,即"計算蛋白質組學"(Computational Proteomics)。"計算蛋白質組學"是以計算技術為主要手段,通過開發高效的算法和實用的軟件工具來處理大規模的蛋白質實驗或模擬數據,解決蛋白 質組學研究中的蛋白質鑒定、翻譯后修飾分析、蛋白質定量、蛋白質相互作用、蛋白質定位、蛋白質結構或蛋白質動力學等領域中的問題。我國的計算蛋白質組學與 國際目前基本處于同步的發展態勢,特別是最近十年內在中國蛋白質組學項目的推動下,計算蛋白質組學的研究發展迅速。在此背景下,由中國科學院計算技術研究 所pFind團隊發起并在北京組織召開了首屆中國計算蛋白質組學研討會(......閱讀全文
CNCP2018在京開幕-計算蛋白質組學——小人物的學術盛會
分析測試百科網訊 2018年08月22日,“第五屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP-2018)”在中國科學院計算技術研究所舉行。CNCP-2018由中國科學院計算技術研究所、中國人類蛋白質組學會(CNHUPO)、北京蛋白質組研究中心徐平實驗室、北京生命科學研究所董夢秋實驗室、中國科學院大連化學
第四屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP2016)
一、CNCP會議簡介 隨著蛋白質組學的興起,特別是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究中產生的數據規模越來越大,必須通過先進的計算機算法、高效的軟件與硬件來自動處理大批量的蛋白質組數據,這已經成為蛋白質組學研究的一個重要分 支,即"計算蛋白質組學"(Co
2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)學術報告(一)
2014年11月12日, “2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)”在中國科學院計算技術研究所
2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)學術報告(二)
2014年11月12日, “2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)”在中國科學院計算技術研究所舉行。CN
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
什么是蛋白質組學
(Marc Wilkins(1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
蛋白質組學研究技術
可以說,蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否,很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基(20/ 4), 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾,如磷酸化和糖基化等,給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外,
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候,頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動,它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目,就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小,但它影響到五臟六腑。數據顯示,每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中,約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的,
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
CNCP蛋白質組學生物質譜技術評測揭榜-這家中心獲第一!
由賀思敏老師,劉超老師率領中國科學院計算技術研究所 pFind 團隊聯合CNCP組織單位,進行的CNCP-2020蛋白質組學生物質譜技術評測近日終于揭榜。共有來自15家單位的20個實驗室采集到的26套數據參與此次測評,參與者針對Thermo公司提供的HeLa細胞標準品,利用各自實驗室認為最合適的
楊芃原教授宣布第三屆中國計算蛋白質組學研討會圓滿閉幕
2014年11月13日,“第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP-2014)”在中國科學院計算技術研究所落下帷幕,
蛋白質組學的研究內容
主要有兩方面,一是結構蛋白質組學,二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面: ①針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞,建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群,即組成性蛋白質組學。 ②以重要生命過程或人類重大疾病為對象,進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學
蛋白質組學入門問題集錦
1 . HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法 樣品量不足:解決辦法為增加樣品量 樣品未從柱子中流出:可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子 樣品與檢測器不匹配:根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器 檢測器衰減太多:調整衰減即可。 檢測器時間常數太大:解決
蛋白質組學入門問題FAQ
常見問題———?HPLC 篇?1 . HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法?樣品量不足:解決辦法為增加樣品量?樣品未從柱子中流出:可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子?樣品與檢測器不匹配:根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器?檢測器衰減太多:調整衰減即可。?檢測器時間常數太大:解決辦法為降低時間
蛋白質組學質譜分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
定量蛋白質組學的誕生
在現代研究技術,如熒光顯微鏡,流式細胞儀和蛋白質芯片技術中,抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點,其中最大的限制就是,抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目,比如人類蛋白質圖譜(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美國NIH
蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新,蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多,但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前,先看看這篇技術簡介吧。一?蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中,例如DNA復制、mRNA轉錄與
蛋白質組學鑒定技術流程
蛋白質組(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一個基因組(Genome),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。蛋白質組學(Proteomics)以細胞、組織或生物體全體蛋白質為研究對象,通過高通量的色譜質譜聯用技術
定量蛋白質組學方法分類
1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質,首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質,因此,蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中,存在一些差異,要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單,減少蛋白損失;盡量避免蛋白的降解;盡可能提高樣品蛋白的
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質(isforms)等現象在基因水平無從表現
【網絡研討會】蛋白質組學/脂質組學研究進展
自從精準醫學概念提出以來,組學研究一直都是全球最熱的研究領域,其技術在臨床醫學、生物醫藥和食品安全等領域都占據十分重要的作用。2016年初,中國發起了精準醫學研究專項課題,目標在2017年至2019年構建重大疾病的預防診斷和治療大數據平臺,推動一批精準治療藥物和分子檢測產品進入國家醫保目錄。同時
Nature年度技術:定向蛋白質組學
時近歲末,各大雜志接連進行了年終盤點,此前出版的《Nature》雜志也對2012年進行了回顧,評點了2012年的科技進展,科技政策以及重要人物,中國科學家王俊入選了人物篇。同時《Nature Methods》也盤點了今年與明年的技術熱點,選出了2012年度技術成果:定向蛋白質組學(targe
中國蛋白質組學世界領先
2003年12月15日,由中國科學院院士賀福初牽頭的“人類肝臟蛋白質計劃”(HLPP)啟動,這是我國領導的第一項重大國際合作計劃,也是第一個人類組織/器官的蛋白質組計劃。 北京蛋白質組研究中心主任、蛋白質組學國家重點實驗室副主任秦鈞告訴《中國科學報》記者,十余年來,HLPP經歷了三代更迭,從第