空間蛋白質組學：一種強大的細胞生物學發現工具
真核細胞高度區室化，生物過程被分隔在不同的區室進行。蛋白質功能與亞細胞定位密切相關，不同的區室提供不同的化學環境（例如pH和氧化還原條件）、不同的潛在作用配體或底物。因此，對蛋白質亞細胞定位的嚴格控制是細胞生理學的重要調控內容。大多數細胞生物學過程涉及蛋白質亞細胞定位的變化，例如轉錄因子在細胞核-胞漿的穿梭、細胞凋亡過程中線粒體蛋白的重新定位，以及細胞表面信號傳導受體的內吞等。相反，蛋白質的錯誤定位通常與細胞功能障礙和疾病相關，包括神經變性、癌癥和代謝紊亂等。以蛋白質空間定位為研究方向的空間蛋白質組現在已經用于揭示人類蛋白質組的復雜結構，如單細胞變異、動態蛋白質易位，相互作用網絡改變，以及蛋白定位改變等。一些研究者也已成功運用空間蛋白質組學來研究疾病，包括急性病毒感染、肝病等。2019年5月，KTH 瑞典皇家理工學院的 Emma Lundberg 教授和德國馬克斯-普朗克研究所的 Georg H. H. Borner 教授，在國......閱讀全文
PNNL發表開源蛋白質組學軟件InformedProteomics
分析測試百科網訊 一則消息可能對蛋白組學研究者們最頭痛的事有一定的緩解。美國一機構介紹了一款用于分析鑒定完整蛋白質的新型開源軟件。 ProMex中的LS-MS特征查找，該功能是Informed-Proteomics軟件套件的第一個組件的特征檢測算法。 它被開發用于檢測完整蛋白質離子的同位素包膜
MRM－Proteomics同Biodesix合作開發蛋白質組肺癌精準診斷法
蛋白質組學領頭公司MRM Proteomics和分子診斷公司Biodesix于近期簽署了一項合作協議。根據協議條款，MRM Proteomics將授予Biodesix使用其專有iMALDI技術的權利，以進一步推進其基于血液的肺癌診斷。在此之前，Biodesix的測試菜單包括GeneStrat?基因組
Protocol－for－Protein－Extraction－for－proteomics
Protocol for Protein Extraction10 % w/v TCA/ acetone/ 0.07 % v/v -MercaptoethanolPlant cells are rich in compounds that interfere with the 2DE separat
10x－Genomics收購空間基因組學領先者Spatial－Transcriptomics
近日，10x Genomics公司宣布收購位于瑞典斯德哥爾摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空間基因組學(spatial genomics)領域的領先公司。空間基因組學是一個新興領域，它不但讓研究人員可以獲得單細胞內的基因
PROTEOMICS：OGalNAc糖基化修飾蛋白質的系統發現
近日，上海交通大學系統生物醫學研究院張延課題組在國際知名蛋白質組學研究期刊PROTEOMICS上發表題為《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos
PLATO：革命性的高分辨率空間質譜蛋白質組學平臺
空間蛋白質組學能夠在傳統蛋白質組學提供豐富分子信息的基礎上，進一步揭示分子在細胞或組織中的空間分布，對于系統性地理解生物功能、疾病機制和治療效果至關重要。《Nature Methods》選擇空間蛋白質組學作為2024年度方法[1]，也反映了行業對這項技術應用前景的關注和認可。現有質譜空間蛋白質組
蛋白質組和蛋白質組學分析
?隨著人類基因 組計劃研究成果的公布，人們對基因的認識逐漸清晰，但基因數量的有限性和基因結構的相對穩定性，與生命現象的復雜性和多樣性之間存在巨大反差。如何了解眾多的基因與危害人類身心健康的疾病之間的關系，對生命科學研究者來說仍是一項長期而艱巨的任務。因此，作為生命活動的直接承擔者――蛋白質，成為后基
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念：一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合，然后將DNA從被修飾的堿基處切割，電泳分離，結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾，不能切斷，可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
Bruker推出新一代ultrafleXtreme－MALDITOF/TOF質譜儀
2009年4月27日，布魯克道爾頓公司推出新一代ultrafleXtreme MALDI-TOF/TOF質譜儀，這是市場上唯一的，在TOF和TOF/TOF模式下都能獲得真正的1 kHz采樣速度的儀器，可用于廣泛的研究、臨床、和應用蛋白質組學。 布魯克的新型ultrafleXtreme質
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
科研人員建立人工智能驅動的空間蛋白質組學新技術
近年來，空間組學技術成為解析組織異質性和復雜細胞相互作用的重要工具。尤其是，空間轉錄組學在胚胎發育、神經科學和疾病機制研究中展現出潛力。作為直接執行生物功能的核心分子，蛋白質的空間分布研究在技術上面臨挑戰。現有空間蛋白質組學技術受限于質譜檢測通量和高昂成本，難以兼顧高分辨率與大面積組織分析需求，限制
蛋白質組服務介紹?
基因是生物體的基本遺傳單位。然而，基因本身并不能直接行使功能，其功能的發揮最終需要通過表達出的蛋白質體現出來。蛋白質是細胞所有功能的主要執行者，其功能的發揮決定了人體健康與疾病的各種狀態。蛋白質組是在宏觀的角度全面、系統地解析蛋白質狀態與功能的科學，是“后基因組”時代的核心研究內容。蛋白質組是比基因
蛋白質組是什么
蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一個基因組(genOME)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(PROTein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，一個蛋白質組不是一個
蛋白質組鑒定技術
如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE，那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里，我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法，如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效，而是因為它們通常耗時
蛋白質組鑒定技術
?如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE，那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里，我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法，如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效，而是因為它們通常耗時、耗力，不
蛋白質組研究系統
4700 TOF/TOF蛋白質組分析系統4700TOF/TOF蛋白質組分析系統是全球第一臺TOF/TOF 串聯飛行質譜儀，它作為目前的最新質譜技術，它一問世即被世界各大蛋白組研究中心和著名蛋白質實驗室所爭相采用。它由兩級TOF和高能碰撞池組成，其工作原理是離子在MALDI源中產生并被加速和聚焦；對于
蛋白質組的概念
蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一個基因組(Genome)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(protein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。?在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，一個蛋白質組不是一個
蛋白質組的概念
蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一個基因組(Genome)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(protein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。?在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，一個蛋白質組不是一個
蛋白質組是什么
蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一個基因組(genOME)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(PROTein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，一個蛋白質組不是一個
蛋白質組鑒定技術
如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE，那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里，我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法，如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效，而是因為它們通常耗時、耗
Creative－Proteomics發布兩款質譜產品
分析測試百科網訊 2016年7月4日，Creative Proteomics，一家提供蛋白質組學相關領域，藥物開發服務和產品的供應商，發布了兩款質譜新產品——天然化合物MS Std和Sialic acids，這也標志著Creative Proteomics質譜產品的擴張。 質譜，在很
布魯克發布新型4DProteomics?－timsTOF技術
A. 基于人工智能的TIMSquant?軟件，實現CCS-enabled非標記定量，可擴展到成千上萬的樣本； B. midia-PASEF?采集模式，早期能夠用在超靈敏的 timsTOF Ultra 上進行免疫肽組學和蛋白質翻譯后修飾（PTMs）研究，實現在dia-PASEF中的類似DDA母離
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
轉錄組和蛋白質組有何異同之處
轉錄組是RNA轉錄后的全部產物,而轉錄后的產物經過加工修飾（例如甲基化、拼接、加尾等）后才變成蛋白質.相同之處就是他們的大部分結構相同.不同之處就是一個有加工過程,一個沒有.
Science－Advances：一種新的單細胞空間蛋白質組學成像技術
人體細胞表達的蛋白質種類超過幾萬種，而不同的蛋白質在細胞的定位也不一樣。蛋白質亞細胞定位還會涉及到細胞功能異常和疾病。而空間蛋白質組學正是研究蛋白質在亞細胞上的定位、表達及其在亞細胞水平上的動力學，屬于蛋白質組學的研究范疇。目前研究空間蛋白質組學分析的方法主要有兩種：基于細胞器分離的質譜法和基于
蛋白質組的研究內容
主要有兩方面，一是結構蛋白質組學，二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面：① 針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞，建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群，即組成性蛋白質組學。② 以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學。③
蛋白質組的鑒定方法
如蛋白質鑒定結果、蛋白質的亞細胞定位、蛋白質在不同條件下的表達水平等信息。目前應用最普遍的數據庫是NRDB和dbEST 數據庫。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等幾個數據庫組成，dbEST是由美國國家生物技術信息中心（NCBI）和歐洲生物信息學研究所(EBI)共同編輯的核酸數據庫；
蛋白質組的研究內容
主要有兩方面，一是結構蛋白質組學，二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面：① 針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞，建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群，即組成性蛋白質組學。② 以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學。③