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  • 發布時間:2015-08-17 09:30 原文鏈接: 8月6日《自然》雜志內容精選

    封面故事:埃博拉病毒造成的新疫情

      本期封面照片是2014年9月在利比里亞邦縣的馬瓦拍攝的。當前由埃博拉病毒所造成的疫情正在西非蔓延。在7月22日之前的一個星期,國際衛生組織報告說,在幾內亞有22個已證實的病例,在塞拉利昂有4個,在利比里亞沒有——5月9日該疫情在利比里亞已宣告“結束”。本期Nature雜志的特寫文章總結了在應對本次疫情中獲得的經驗教訓,并對這種疾病和其他疾病在將來可以怎樣得到控制表達了意見。

      

    小細胞肺癌的遺傳原因

      對110個小細胞肺癌病例所做的全基因組測序,顯示了幾乎所有病例中腫瘤抑制因子基因TP53和RB1的一個典型的雙等位基因失活現象。在TP53 和RB1沒有發生改變的僅有的兩個樣本中,“染色體碎裂”將 “cyclin D1”激活,導致同樣的分子效應。另外,25%的腫瘤在NOTCH家族的基因中攜帶能造成失活的突變,同時作者也發現,一個臨床前小鼠模型中Notch信號作用的激活可以降低腫瘤數量和延長突變小鼠的生存時間。這項研究突顯了作為最具致命性的人類癌癥之一的這種肺癌的可能的藥物作用目標。

    外來體接觸RNA的靈活方式

      一個細胞中的RNA周轉的主要目標是外來體,它是由12個亞單元組成的一個復合物,含有兩個核糖核酸外切酶,即Rrp44和Rrp6。現在,Elena Conti及同事獲得了來自酵母的、與各種不同RNA基質相結合的這一復合物的晶體結構。這些結構有助于了解外來體是怎樣被用于一些3′端(如5.8S rRNA的3′端)的精確處理,而其他RNA則被完全降解的。這兩種核酸酶之間的協調被發現涉及Rrp6和其伙伴Rrp47的擺動。

    多藥物耐受性的結構基礎

      多藥物耐受性在細菌病原體中的傳播主要是由于所謂的“persisters”的存在,它們是表型變體,處于休眠狀態,因此不易受抗生素的影響,后者只對積極生長的細胞有效。Maria Schumacher等人在這項研究中發現,野生型HipA(一種絲氨酸蛋白激酶,抑制蛋白合成并促使細胞進入休眠狀態)在大腸桿菌中幫助persister形成,“hipA7 high-persister突變體”存在于尿道感染患者體內。作者確定了由啟動子DNA和 “HipA-HipB”復合物組成的“轉錄自抑制復合物”的結構。這些結構顯示,高持久性突變通過干擾HipA-HipA相互作用,將HipA從higher-order復合物中釋放出來和觸發多藥物耐受性來發揮功能。

    識別復雜網絡中有影響的節點

      在復雜網絡中,一些節點比其他節點更重要。最重要的節點是那些沒有它們就會誘發網絡癱瘓的節點,識別它們在很多情況下都至關重要,例如在尋找阻止一種疾病傳播的最有效方法時。但這是一項艱難的任務,可用于這一目的的大部分方法基本上都是基于試錯法。在這項研究中,Flaviano Morone和Hernán Makse設計了一個嚴格的方法來確定隨機網絡中最有影響的節點,辦法是將這個問題映射到“最佳滲透”上,再通過作者稱之為 “集體影響”的一個算法來解決這一優化問題。他們發現, “最佳影響節點”的數量比以前所認為的要小得多,低度節點在網絡中可以扮演的角色也要比以前所認為的重要得多。

    被鎳催化激活的酰胺C-N鍵

      雖然酶在自然界中能夠斷開酰胺鍵,但難以利用合成化學方法選擇性地斷開一種酰胺的碳—氮鍵。在這篇論文中,作者顯示,酰胺C-N鍵可以利用鎳催化劑被激活和斷開。他們采用這一方法將酰胺轉化成了酯類,這是一個有挑戰性的,還不是很成熟的轉化反應。

    鎖定在海洋沉積物中的北極碳

      高緯度土壤和永久凍土所含的碳是大氣中的兩倍,并會將它存儲數千年。曾有人提出,氣候變暖和永久凍土融化也許會刺激這一有機碳的降解,將其釋放到大氣中,造成進一步的全球變暖。

      在這項研究中,Robert Hilton等人分析了麥肯錫河(北美最大的極地河流)中顆粒有機碳的來源、流量和命運,發現大量侵蝕土壤碳并不是以二氧化碳形式被快速釋放的。相反,這種碳很多被轉移到了河流中,有些最終被埋藏在了離岸的海洋沉積物中,后者是“地質二氧化碳”的一個具有潛在重要性的碳匯。

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