Science:梳理患兒腫瘤細胞的基因組尋求答案
組蛋白翻譯后修飾方式出現異常,以及組蛋白修飾位置出現異常都會導致腫瘤發生。 高通量DNA測序技術的快速擴張讓我們能夠以前所未有的速度和精細度對人體疾病展開遺傳學分析,尤其是對罕見的小兒疾病進行全基因組測序(whole-genome sequencing)更是有助于我們對兒童發育,以及多條生化反應信號通路有更基礎的認識和了解。實際上,已經有人用全基因組測序方法首次發現了與某種人類疾病相關的組蛋白(一種包裹在DNA外面的蛋白質)突變。彌漫性真性腦橋神經膠質瘤(diffuse intrinsic pontine glioma, DIPG)是一種好發于腦干部位、進展迅速、不可治愈的小兒腫瘤,大約有80%的DIPG患兒都會攜帶這種組蛋白突變。Lewis等人研究發現,在攜帶了組蛋白突變的DIPG患兒疾病的發病過程中,多梳蛋白抑制復合體2(polycomb repressive complex 2, PRC2)這種重......閱讀全文
Science:組蛋白單點突變可導致罕見兒童癌癥
近日,國際學術期刊Science發表了一項最新研究進展,他們發現一種組蛋白編碼基因發生缺陷與兒童惡性腫瘤的發生有關。來自美國威斯康星麥迪遜大學的Peter W. Lewis表示,大多數癌癥的發生需要多個突變的共同作用,而他們發現的這個基因突變本身就足以導致形成腫瘤。 組蛋白除了用于形成核小體,
張強峰博士Nature解析全基因組蛋白互作
來自美國哥倫比亞大學,同濟大學等處的研究人員發表了題為“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一種基于三維結構信息的全基因組蛋白質相互作用計算預測方
Genes-Dev解析致癌組蛋白突變引發癌癥的分子機制
來自清華大學醫學院李海濤教授課題組7月31日在《基因與發育》(Genes&Development)雜志上發表了題為《Molecular basis for oncohistone H3 recognition by SETD2 methyltransferase》(甲基轉移酶SETD2識別致癌組
《科學》雜志精選:人類基因組蛋白產物仍是謎
幾近完成的普通小麥基因組測序 研究人員已經展示了普通小麥基因組的序列草圖,從而在通往創制世界上種植最廣泛谷物作物之一的完整參考序列的道路上到達了一個主要的里程碑。他們的工作給了科學家們一個可在小麥個體染色體上快速定位特定基因的工具,這一資源可幫助他們改良小麥育種以滿足從未有過的對食物的更高需求
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生,因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊,在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
單細胞基因組突變檢測新突破
愛因斯坦研究人員已經開發并驗證了一種準確識別單細胞基因組中突變的方法。這種新方法可以幫助預測癌癥是否將在看似健康的組織中發展,在今天的自然方法的在線版本中發表的論文中被描述。相應的作者是Lola和Saul Kramer分子遺傳學主席Jan Vijg博士。 在科學家可以分析單個細胞的基因組之前,
AI揭示影響人腦發育基因組突變
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494310.shtm 科技日報北京2月21日電?(記者張夢然)美國研究人員使用人工智能(AI)模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法
AI揭示影響人腦發育基因組突變
科技日報北京2月21日電 美國研究人員使用人工智能(AI)模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法。該研究發表在新一期的《科學進展》上。 認知是人類進化的一個決定性特征,使人類有別于其他靈長類動物。盡管自人類與黑猩猩分道揚鑣以來發生
定義癌癥突變:破壞基因組3D相互作用的突變
在細胞中,DNA緊密地包裹在蛋白質周圍,并以一種復雜的3D結構包裝,我們稱它們為“染色質”。染色質不僅可以保護我們的遺傳物質不受損傷,而且通過調節基因組在3D空間的表達來組織整個基因組:展開呈現給細胞基因表達機器,然后再將它們卷回去。 在3D染色質結構中,一些區域被稱為“拓撲關聯域(TADs)
真核基因組的中度重復順序—組蛋白基因的基本介紹
組蛋白基因在各種生物體內重復的次數不一樣,但都在中度重復的范圍內。通常每種組蛋白的基因在同一種生物中拷貝數是相同的。雞的基因組中組蛋白基因有10個拷貝,在哺乳動物中為20拷貝,非洲爪蟾為40拷貝,而海膽的每種組蛋白的基因達300-600拷貝。不同生物中組蛋白基因在基因組中的排列不一樣,組蛋白基因
證實基因組測序成功鑒定癌癥相關突變
最近,UT西南醫學中心的癌癥研究人員表明,全基因組測序可以用來確定患者遺傳性癌癥的風險,這可能會促進癌癥的預防、診斷和護理。 這項研究首次采用全基因組測序來評估258名癌癥患者的基因組,以提高癌癥誘發突變的診斷能力。相關研究結果發表在12月份的國際期刊《EBioMedicine》。 UT西南
全基因組突變新技術原理簡介
人類遺傳圖譜中,基因只占了全部DNA的2.5%,基因與基因之間的“非編碼”大片段并不全是“垃圾”,有些能夠調節基因的開啟和關閉,有些負責DNA折疊和將DNA打包運往細胞核。不止基因突變,控制基因的DNA發生突變也可能導致疾病。小鼠是疾病研究的常用模型,想要弄清小鼠基因組中每個DNA片段的功能,需要依
Nature:全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日,一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中,來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析,結果發現了4種不同的亞型,這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式,該技術可以幫助
組蛋白突變體可增強誘導多能性干細胞的重編程作用
近日,刊登在國際雜志Cell Stem Cell上的一篇研究論文中,來自日本理化研究所的研究人員通過研究鑒別出了一組組蛋白,其可以明顯增強誘導多能干細胞(iPS)的產生,而且其也是誘導全能干細胞產生的關鍵。 這項研究中,研究者試圖在哺乳動物的卵母細胞中尋找誘導全能胚胎干細胞產生的分子,
高冠軍/戴俊彪合作果蠅組蛋白H3/H4系統解析組蛋白劑量
組蛋白(Histone)在真核生物染色體中扮演著重要的角色,是染色體結構單元核小體的重要組成部分。由核心組蛋白H3,H4,H2A,H2B形成的八聚體是DNA纏繞的主要承載體【1】。除了用以裝配染色體外,組蛋白的另外一個重要功能是參與基因組信息的表達調控。組蛋白氨基酸殘基上的翻譯后修飾如乙酰化、甲
全基因組測序揭示肝癌相關基因突變
由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細胞癌相關的基因突變研究成果于2013年6月20日在《基因組研究》(Genome Research)雜志上發表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學》上發表的乙肝病毒整合機制研究之后,該研究團隊在肝癌研究中所取得的又
為什么僅僅通過NGS來測基因組突變...
Illumina最近的一個大動作就是投入一億美金,分出一部分骨干,成立一個以“液態活檢”為中心的公司。所謂液態活檢,就是不用組織穿刺,通過 血液,尿液這類非侵犯性取才得來的標本對疾病進行診斷和評估。液態活檢是精準醫療的重要組成部分,試圖在血液里找到腫瘤細胞,或腫瘤DNA,通過高通量測 序
《基因組蛋白質組與生物信息學報》影響因子顯著提高
在日前舉行的第四屆中國英文版科技期刊研討會上,中國科學技術信息研究所發布了《2007年版中國英文版科技期刊引證報告》。根據這一報告提供的數據,中科院北京基因組研究所主辦的《基因組蛋白質組與生物信息學報》(Genomics,? Proteomics? &? Bioinformatics,簡稱GPB)的
組蛋白H3K36M突變促癌機制中的關鍵因素
PNAS | 路超團隊等揭示組蛋白H3K36M突變促癌機制中的關鍵因素 染色質異常調控導致癌癥發生的機制是當前的研究熱點之一。隨著近些年來TCGA等大規模腫瘤基因組測序計劃的開展,關鍵染色質調控基因在各類癌癥中均發現有頻繁突變。然而令研究者意外的是,在幾種兒童癌癥中發現了大量組蛋白突變的跡象【
Nat-Commun:揭示引發食管癌的基因組突變
近日,來自澳大利亞昆士蘭大學的研究人員通過研究發現,意外的染色體突變或許會誘發食道癌的發生,相關研究發表于國際雜志Nature Communications上。研究者Nic Waddell表示,本文中我們對來自三所布里斯班醫院的22名患食管腺癌(OAC)的進行了全基因組測序研究分析,結果顯示,在
比較組蛋白與非組蛋白的特點及其作用
組蛋白:特點:進化上的極端保守性;無組織特異性;肽鏈上氨基酸分布的不對稱性;組蛋白的修飾作用。作用:1,核小體組蛋白,幫助DNA卷曲形成核小體的穩定結構2,H1組蛋白,在構成核小體時期連接作用,賦予染色體極性3,對染色體DNA的包裝起著重要作用非組蛋白:特點:非組蛋白是一類酸性蛋白質,富含天冬氨酸和
比較組蛋白與非組蛋白的特點及其作用
組蛋白:特點:進化上的極端保守性;無組織特異性;肽鏈上氨基酸分布的不對稱性;組蛋白的修飾作用。作用:1,核小體組蛋白,幫助DNA卷曲形成核小體的穩定結構2,H1組蛋白,在構成核小體時期連接作用,賦予染色體極性3,對染色體DNA的包裝起著重要作用非組蛋白:特點:非組蛋白是一類酸性蛋白質,富含天冬氨酸和
表觀遺傳之組蛋白修飾—組蛋白乙酰化
大家好,我又來啦~~今天給大家放送的是表觀遺傳之組蛋白修飾相關的內容噢,組蛋白修飾也是一個比較復雜的過程,今天呢,我們就給大家講講組蛋白乙酰化及相關的產品。?一 組蛋白修飾?真核生物染色質的基本結構單位是核小體,它由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成,其中組蛋白八聚體包含 2 (H2
Nature新研究揭示先天心臟病病因
每年,有成千上萬的嬰兒出生即患有統稱為先天性心臟病的嚴重心臟畸形疾病。盡管許多這樣的缺陷可以通過手術修復,但直到現在研究人員也不了解疾病的病因,以及如何能夠防止疾病發生。一項新研究表明,10%這樣的缺陷是由并非來自患兒父母的遺傳突變所引起。研究結果發表在5月12日的《自然》(Nature)雜志上
Nature新研究揭示先天心臟病病因
每年,有成千上萬的嬰兒出生即患有統稱為先天性心臟病的嚴重心臟畸形疾病。盡管許多這樣的缺陷可以通過手術修復,但直到現在研究人員也不了解疾病的病因,以及如何能夠防止疾病發生。一項新研究表明,10%這樣的缺陷是由并非來自患兒父母的遺傳突變所引起。研究結果發表在5月12日的《自然》(Nature)雜志上
男性不育重大突破!精子缺陷的表觀基因組或是關鍵原因
每8對夫婦中就有1對存在生育困難的問題,其中近四分之一的原因都是由不明原因的男性不育所引起的,在過去10年里,研究人員發現,男性不育與缺陷的精子在發育過程中無法從DNA中“驅逐”組蛋白有關,而其背后的機制以及在精子DNA中所發生的未知,目前研究人員并不清楚。圖片來源:Bobjgalindo/Wiki
組蛋白的簡介
重組蛋白的產生是應用了重組DNA或重組RNA的技術從而獲得的蛋白質。目前,體外重組蛋白的生產主要包括四大系統:原核蛋白表達,哺乳動物細胞蛋白表達,酵母蛋白表達及昆蟲細胞蛋白表達。生產的蛋白在活性和應用方法方面均有所不同。根據自身的下游運用選擇合適的蛋白表達系統,提高表達成功率。
組蛋白的特點
染色體(chromosome)是基因的載體,染色體包括DNA和蛋白質兩部分。真核細胞染色體上的蛋白質主要包括組蛋白和非組蛋白。組蛋白是一類較小而帶有正電荷的核蛋白,與DNA有很高的親和力。組蛋白是染色體的結構蛋白,它與DNA組成核小體。由DNA和組蛋白組成的染色質(chromatin)纖維細絲是許多
組蛋白的簡介
組蛋白(histone)是指所有真核生物的細胞核中,與DNA結合存在的堿性蛋白質的總稱。其分子量約10000~20000。 真核生物體細胞染色質中的堿性蛋白質,含精氨酸和賴氨酸等堿性氨基酸特別多,二者加起來約為所有氨基酸殘基的1/4。組蛋白與帶負電荷的雙螺旋DNA結合成DNA-組蛋白復合物。因
深大特聘教授陳雪梅院士PNAS發表植物表觀遺傳學成果
生物通報道:在植物中,組蛋白去乙酰化酶(HDACs)屬于一個大的蛋白質家族,但是很少有人知道每個HDAC的靶標特異性是如何實現的。12月5日在《PNAS》發表的一項研究中,來自深圳大學、加州大學河濱分校、韓國基礎科學研究院和湖南農業大學等處的研究人員指出,一對含有SANT (SWI3/DAD2/