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    納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述

    RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大地輔助了病毒性病原體的表征和及時檢測。 毫無疑問,傳統的測序技術使全面轉錄組分析成為可能,并帶來了很多重要的科學發展。然而,這一領域仍有重要的局限性有待解決。 轉錄本的長度通常為幾千堿基對,這使得現有的短讀長序列僅能部分覆蓋轉錄本的長度,因此依賴計算重構準確的異構體組裝非常困難,短讀長也表現出高比率的多重定位。 基于測序的RNA分析均需要將 RNA轉化為互補DNA(cDNA)鏈,在這一過程中,逆轉錄或擴增可引入偏倚,產生GC偏好性。由于并非所有的轉錄物都以相同的效率擴增,會導致一些種類的RNA的中斷以及其它種類RNA的過度擴增。......閱讀全文

    納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述

      RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大

    關于三代基因測序,你所需要知道的都在這兒!

      一、導讀:  在大部分投資者對“二代測序”(NGS)還沒有搞清技術細節的情況下,“三代測序”(3GS)又火了。  6月17日,醫藥板塊中基因測序相關標的在“三代測序技術獲得重大突破”的新聞影響上出現明顯漲幅,我們也接到較多投資者對相關新聞的背景及觀點的詢問。為此,我們結合各方面資料歸納總結了三代

    三分鐘了解4代基因測序技術

      基因檢測技術是近年來伴隨“精準醫療”概念的提出而迅速發展起來的一門科學技術,它可以從基因組機制上闡釋遺傳學、發育生物學、進化生物學等學科的經典概念,在全基因組水平延伸了染色體高級構象、細胞異質性、功能模塊等新概念,為精準醫學開辟了應用性新領域。  近年來,隨著分子水平的基因檢測技術平臺不斷發展和

    1.39億美元!全球測序巨頭Oxford Nanopore獲知名機構投資

      牛津納米孔總部位于英國,公司研發、生產和銷售世界上唯一的便攜式、實時DNA/RNA測序儀。此次募得資金主要用于公司下一階段的業務擴張,其中,包括在牛津建設一個全新的、高產能的生產基地,以滿足市場對牛津納米孔測序儀產品日益增長的需求;以及擴大服務位于全球70多個國家客戶的市場和銷售團隊。  同時,

    基因測序“摩爾定律”初現,“三代測序”要革“二代”的命?

      在“二代測序”(NGS)尚未迎來投資熱潮的情況下,技術突破捷報連連的“三代測序”(3GS)又進入到了投資人的視野中。1986年,第一臺商用基因測序設備正式出現,到第二代測序設備出現,期間間隔了19年時間。而第二代設備問世,到第三代設備的誕生,僅僅用了5年,基因測序設備的更新換代速度正在不斷加快。

    中國首發納米孔RNA直接測序揭示其在全長轉錄本中的作用

      近日發表在RNA Biology上的研究中,來自中國科學院北京生命科學研究院、動物研究所及中國科學院大學等多家單位的科學家們首次通過5’-Cap捕獲法對蝗蟲的 RNA直接測序,揭示了Piwi 外顯子化模式的廣泛建立以及蝗蟲轉錄組中的轉座子(TEs)對RNA剪接的重要作用。  轉座子(TEs)在后

    于軍:從人類基因組計劃到精準醫學

      基因產業正受到前所未有的重視。今年,精準醫學不僅被納入“十三五”規劃,作為精準醫學的“排頭兵”,基因組學也被納入“十三五”百大項目名單,要“加速推動基因組學等生物技術大規模應用”。  對著名基因組學專家、中國基因組學奠基人于軍教授來說,基因組學引領的技術應用得到如此重視,既讓他感到欣慰———20

    Illumina收購PacBio恐受阻!曾提出向三方授權相關知識產權

      2018年11月,基因測序巨頭Illumina擬對PacBio的12億美元收購案一度引發全球基因測序行業的廣泛關注。通過將Illumina的短讀長測序技術和PacBio的長讀長測序技術相結合,這項交易勢必將進一步鞏固Illumina在基因測序領域的優勢地位。  但消息發布后,該交易迅速引起了英國

    納米孔測序技術用于快速的病毒病原體的鑒定及進化研究

      2014-2016年,西非暴發埃博拉疫情流行期間,進行了大量ELISA和基于RT-PCR的檢測,這些方法的檢測雖然簡易、便攜、快速,但由于病原體不斷進化,這些方法很快變得過時,并且還缺乏能在癥狀出現前檢測出病毒的方法。  使用傳統的測序技術雖然可以克服病原體不斷進化的問題,但這一技術只有在將樣品

    DNA測序技術的現狀和發展(七)

    3. 新一代測序技術的前景在2007年6月,James Watson的基因組序列登錄到了GenBank數據庫當中,這是第一次使用非Sanger測序法獲得了人類個體基因組序列,并且第一次將個人基因組序列公之于眾。整個測序過程在兩個月之內就完成了,花費不到100萬美元,這只占耗時10年之久的人類

    PacBio測序有望掀起下一場遺傳診斷的革命

      從一代到二代再到三代,近年來測序技術的發展勢不可擋。單分子測序也逐漸表現出它的優勢,在測序舞臺上發揮著舉足輕重的作用。近日,比利時魯汶大學和瑞典烏普薩拉大學的研究人員在《Nucleic Acids Research》發表綜述文章,介紹了PacBio SMRT測序技術在臨床中的應用。  文章簡單回

    INC-Seq:提高納米孔測序準確性的新方法

      新加坡基因組研究院(GIS)的研究人員開發了一種方法,稱為INC-Seq,能夠提高牛津納米孔技術公司掌上測序儀MinIon的測序準確性。目前他們正努力改進該方法,將它應用到復雜樣本的16S測序、RNA測序以及基因組復雜區域測序等中。  研究人員在近日發表于《Giga Science》的文章中描述

    2018TOP10基因測序公司 Illumina雄踞榜首 華大基因位列第三

      在成功實現1000美元基因組測序的5年后,測序行業正在朝著新的目標前進:將基因組測序的成本進一步降低至100美元,甚至10美元。  在2018年,最接近100美元目標的是Veritas Genetics公司,該公司去年11月將其999美元的myGenome Standard全基因組測序服務(包括

    一文讀懂分子診斷技術、PCR技術、基因測序技術

      分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗

    一文讀懂分子診斷常用技術

      分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗

    《科學》公布2016十大進展

      每年12月,《科學》雜志都會公布年度突破及入圍成果。以下為今年的10大突破和贏家,排名不分先后。  1.時空漣漪撼動科學界  今年發現時空漣漪(即引力波)撼動了科學界。它完成了阿爾伯特·愛因斯坦在100年前完成的一項預測,為40年來尋找這種無窮小的漣漪畫上了句號。但這個故事并未結束,科學家將此次

    納米孔測序搞定超級難搞的基因

      Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一臺MinION測序儀的。他所在的康涅狄格大學實驗室是首批獲得Oxford Nanopore Technologies測序儀的客戶。盡管準確性不穩定,通量也不高,但Graveley和他的同事決定立刻就試試。  對于MinION,眾多討論

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    全球測序行業的10大巨頭,中國占2席

    近日,GEN網站推出“Top 10 Sequencing Companies”榜單,盤點了全球測序行業10大巨頭。其中,Illumina拔得頭籌,中國企業占得2個席位,分別是華大基因(排名第3)、金唯智(排名第8)。圖片來源:16sucaiwang近年來,隨著“精準醫療”的深入布局,基因測序行業市場

    全球測序行業10大巨頭:Illumina第一Thermo第二 中國占2席

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    中國精準醫療無人區,有人護!

    ——訪伯科創始人郭誠博士  日前一則“打破國外壟斷!伯科生物推出自主知識產權的生物液相芯片雜交捕獲與探針原位合成技術”引起了業界廣泛關注,細細閱讀后,我好奇地開始探究“伯科”了。伯科創始人是誰?這一探針合成技術優勢在哪里?能為中國精準醫療帶來什么變化?  ……全球有機化學殿堂—美國哥倫比亞大學Hav

    盤點:分子診斷常用技術50年的沿革與進步

      一、基于分子雜交的分子診斷技術  上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了

    臨床檢驗科常見設備和主要供應商大全

    臨床檢驗常見設備包括:一、臨檢設備:血細胞分析儀、流式細胞儀、血凝分析儀、尿液干化學分析儀、尿液有形成分分析儀、糞便分析儀二、生化免疫設備:生化分析儀、化學發光免疫分析儀、酶免疫分析儀、熒光免疫分析儀三、分子診斷設備:核酸提取儀、實時熒光PCR儀、基因測序儀、質譜儀四、微生物檢驗設備:微生物鑒定藥敏

    納米孔測序儀真機現身ASHG

      英國Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因組生物學技術進展年會(AGBT)上發布了一款便攜式的基因組測序儀MinION,性能強勁,價格給力,引發市場轟動。然而,大半年過去了,納米孔測序儀卻遲遲不見蹤影,連更早發布的GridION也未上市。于是,生物界開始議論

    干貨丨新冠病毒Nanopore測序標準操作流程

    2019新型冠狀病毒Nanopore測序標準操作流程-PCR擴增測序版簡介  新近在武漢出現的新型冠狀病毒引發的肺炎疫情引起了社會各界的極大關注。對新型冠狀病毒進行測序不僅能夠為病原鑒定、病毒溯源與變異、傳播力和傳播機理等研究提供切實可靠的基因組信息,還能夠為識別病毒傳播方式和確定暴發范圍提供重要的

    Science雜志最受關注的文章(2月)

      美國的《Science》雜志由愛迪生投資創辦,是國際上著名的自然科學綜合類學術期刊,與英國的《Nature》雜志被譽為世界上兩大自然科學頂級雜志。Science雜志主要發表原始性科學成果、新聞和評論,許多世界上重要的科學報道都是首先出現在Science雜志上的,比如艾滋病與人類免疫缺陷病毒之間的

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