長鏈非編碼RNA與淋巴瘤
類基因組中僅有1.5%~2.0%編碼蛋白的基因得以穩定轉錄,而剩余的絕大多數RNA無編碼蛋白的功能。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類異質性的非編碼RNA,根據lncRNA的功能,可將其分為信號分子、誘餌分子、引導分子和骨架分子4類。人們以往僅將這些不具編碼功能的RNA視為進化過程中產生的廢料,而隨著研究的不斷深入,人們逐漸認識到編碼蛋白的基因數量對于有機體復雜程度的影響遠小于非編碼轉錄子。越來越多的研究顯示,lncRNA的近端啟動子序列、外顯子、內含子以及二級結構均高度保守,可以在表觀遺傳學、轉錄及轉錄后等多個層面調控基因的表達。圖片來源于網絡 淋巴瘤由于其復雜的發病機制、多樣的臨床表現以及患者的個體差異顯著,使得淋巴瘤的診治仍然是一項有待攻克的難題。近年來,越來越多的研究表明lncRNA的異常表達與多種人類疾病相關。本文我們就lncRNA在淋巴瘤中研究綜述如下。 一、lncRNA與淋巴瘤的發生 近期Petri等......閱讀全文
長鏈非編碼RNA與淋巴瘤
類基因組中僅有1.5%~2.0%編碼蛋白的基因得以穩定轉錄,而剩余的絕大多數RNA無編碼蛋白的功能。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類異質性的非編碼RNA,根據lncRNA的功能,可將其分為信號分子、誘餌分子、引導分子和骨架分子4類。人們以往僅將這些不具編碼功能的RNA視為進化過程中產生的廢
調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時,免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在,來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法,有可能會影響未來的藥物設計。相關論文 ? ?發布在12月16日的《自然》(Natur
lncRNA功能機制研究(一)
文章導讀LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA,在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合,并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達,而且lncRNA也可以作為誘餌,吸附miRNA,調節miRNA調控的靶基因表達。但是,目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能
lncRNA功能機制研究(二)
實驗路線(1)LINC00346調控胃癌發展的上游機制結果:轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合,并增強其表達a. 轉錄因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的轉錄因子
lncRNA研究策略與技術
研究背景:長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類不編碼蛋白的RNA分子,長度在200 bp以上,起初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二級結構,可以與蛋白、DNA和RNA相互作用,參與多種生物學過程的調控
eLife:lncRNA調控癌癥關鍵基因
Salk研究所的科學家們發現,一種長非編碼RNA(lncRNA)是癌癥發展過程中的一個關鍵基因開關。這項研究于四月二十九日發表在eLife雜志上,為相關癌癥的治療提供了一條新的途徑。 研究人員將這種lncRNA命名為PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA助力葉酸研究新成果
LncRNA研究發表的成果五花八門,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量數據,發表5分影響因子的文章,還是可行的。本研究是以葉酸處理肥胖模型為基礎,讓我們來看看到底怎么樣就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上發表。研究背
lncRNA表達與RNA的延伸
LncRNA的火熱研究已經有幾年的時間了,關于lncRNA總歸是有說不完的話題。目前對lncRNA的基礎分析都已形成了一定的模式。然后,今年來lncRNA的相關文章依然如雨后春筍。 長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RN
lncRNA的概念及形成過程
?lncRNA,即Long non-coding RNA,你可以把它理解為不表達蛋白的mRNA。它的很多特征與mRNA很類似。比如,它與mRNA一樣有啟動子、有polyA尾巴、有不同剪接、有動態表達水平。除了不表達蛋白這一點以外,僅從核苷酸水平上來看,可以說它與mRNA并無實質分別。所以對于設計PC
如何快速查找LncRNA序列?
查找LncRNA序列的網站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC數據庫等。今天,小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一.根據LncRNA來源數據庫,進入相應鏈接。?Genebank:https://www.ncbi.nlm.nih.gov
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能,這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能輕松的變廢為寶,竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章,你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作為最新的國自然熱點受到
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC數據庫等。今天,小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一.根據LncRNA來源數據庫,進入相應鏈接。 1. Genebank:https://www.ncb
Nature重要發現:調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時,免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過 程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在,來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法,有可能會影響未來 的藥物設計。相關論文發布在12月16日的《自然》(Nature)
LncRNA芯片應用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范圍內,每年因肝癌死亡的病例超過50萬人,是主要的致死惡性腫瘤之一。在過去的十年中,隨著影像學的進步以及健康體檢的普及,越來越多的肝癌病人在患病早期被發現。但由于肝臟捐贈者的短缺,外科肝臟切除術仍然是治療早期肝癌病人的最主要方法。目前對于術后患者缺乏準確
國際知名學者綜述:LncRNA分類
美國St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授,是基因組學與系統生物學領域具有重要國際影響的專家,長期從事系統生物學和基因組功能方面的研究,其發現人類基因組能夠產生大量的有功能作用的非編碼RNA,在概念層次上重新定義了“基因”,這一發現被Science選為最
LncRNA芯片應用于胃癌研究
上海交通大學附屬仁濟醫院房靜遠教授主要從事消化系統腫瘤發生的分子機制、早期診斷和分子治療等相關研究。近期,該課題組應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌組織的lncRNAs表達情況,篩選到可預測胃癌發生的分子標志物GClnc1,并且闡明了GClnc1在胃癌的發生和發展中是如何發揮
Cell重要發現:調控免疫的lncRNA
由麻省大學醫學院Katherine A. Fitzgerald領導的研究小組證實,一種長鏈非編碼RNA lincRNA-EPS發揮轉錄剎車作用限制了炎癥。這一重要的研究發現發布在6月16日的《細胞》(Cell)雜志上。 細胞類型特異性的調控回路以復雜、動態和短暫調節的方式控制著基因表達。了解這
Cell:“垃圾”基因也可致癌
在過去幾年里,科學家們在長非編碼RNA功能研究方面取得了顯著進展,lncRNA作為多種生物學過程的重要調控因子,目前已經發現其在多種疾病過程如癌癥的發展過程中具有重要作用。 近日,來自美國哈佛大學醫學院的研究人員在著名國際學術期刊cell在線發表了他們的最新研究進展,他們發現lncRNA的一個
上海交大LncRNA研究刊登國際期刊
長非編碼RNA(lncRNA)不編碼蛋白質,最初被認為是基因組“暗物質”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色質修飾復合物的招募過程中發揮作用,并能影響基因的表達。然而,是否lncRNAs以類似的方式在癌癥中發揮作用,尚不明確。延伸閱讀:中美學者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
親本lncRNA-MISSEN調控水稻胚乳的發育
胚乳是水稻的重要組成成分,是水稻種子的主要食用部分。因此,胚乳的發育情況直接影響稻米的產量和品質。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類長度超過200nt的非編碼RNA,其數量眾多,在植物生長的各個環節發揮重要功能;然而其在胚乳發育調控過程中的作用機制未見報道。 近日,中山大學生命科學學院陳
lncRNA逆轉錄的引物如何設計
目前發現的大多數lncRNA都帶有poly(A),可以通過Oligo(dT)、隨機引物進行反轉錄擴增合成cDNA
華裔學者Cell發表lncRNA研究的利器
長非編碼RNA(lncRNA)是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,絕大多數位于細胞核內。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下,人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然
長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略
長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
新機制:lncRNA可調控小麥開花
冬小麥開花需要長時間低溫環境的誘導,該過程稱之為春化作用。這一過程受到外部環境因子和植物內在發育狀態的雙重復雜精準的調控。冬小麥不同品種的春化特性與其產量直接相關。在六倍體小麥中,TaVRN1是受低溫誘導、可加速開花轉換的關鍵調控因子。然而,目前對于在春化過程中TaVRN1逐步激活的分子機制尚不
lncRNA在農業領域的研究成果
miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar --沒想到在農業上大展身手啦 你沒看錯!不是標題黨。說到miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar,想必聰明博學的你就已經猜到了是lncRNA。今天大閱哥要給大家挖一挖lncRNA在農業上的研究進展。為了寫這篇主題
套細胞淋巴瘤-or-彌漫大B細胞淋巴瘤?
? ? 2016年8月24日蘇州大學附屬第二醫院的張宏老師在全國形態學診斷學術交流群分享了一例少見的淋巴瘤病例,引起群內專家老師熱烈討論。現將病例精華整理成章,方便大家學習和收藏。? ? 張宏-蘇州大學附屬第二醫院:在不參考病史和細胞形態的情況下,僅憑流式圖,各位老師考慮什么疾病??? ? 石淙-寧
Cell子刊:挑戰傳統理論的lncRNA
一度被認為在線蟲和果蠅中即便不是不存在但也不會多見的DNA甲基化表觀遺傳標記,實際上普遍存在于這些生物體和藻類的整個基因組,且其并非發生于在哺乳動物中已知被修飾的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。來自中外的華人科學家將這一重大發現發布在4月30日《細胞》(Cell)雜志上的3篇研究論文中。 西班牙塞維利亞
Cell子刊:挑戰傳統理論的lncRNA
幾乎整個人類基因組都會轉錄成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白質生產。大多數RNA(非編碼轉錄組)的功能還是未知的,長非編碼RNA(lncRNA)就是其中之一。 德國亥姆霍茲慕尼黑中心(Helmholtz Zentrum München)的研究人員發現,一種lncRNA(稱為PARTICLE
華人學者Nature-Genetics發布lncRNA重要發現
研究人員通過研究遺傳變異準確地找到了45個與前列腺癌疾病發生發展有關的基因。 項目負責人、大學健康網絡瑪格麗特公主癌癥中心科學家、多倫多大學醫學生物物理學系助理教授Hansen He說,發布在《自然遺傳學》(Nature Genetics)上的研究結果,闡明了這些稱作為“長鏈非編碼RNA”(l
lncRNA在農業領域的研究成果(二)
【思路及相應結果】內容與圖片源:(王立方,2015)【結論】通過全轉錄組測序、lncRNA測序和實時熒光定量的方法發現和鑒定了與家蠶產絲相關的lncRNA和其在不同產絲階段的表達量變化,挑出了與家蠶產絲調控緊密相關的非編碼RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互補鏈的lncR2034,與P25