• <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 發布時間:2019-05-20 19:27 原文鏈接: CDNA文庫篩選

    CDNA文庫篩選

    (一)λgt11 cDNA文庫鋪平板

    宿主細菌制備

    1.用一個E.coli宿主菌株單菌落分別接種2×5ml LB培養基(Y1088用于噬菌斑雜交,Y1090用于免疫篩選),于37℃振蕩培養過夜。

    2.將過夜培養物以3000×g離心5min

    3.分別用2ml λ-dil10 mmol/L tris-Cl,pH7.5; 10 mmol/L MgSO4高壓滅菌)重懸細胞沉淀。

    4.細胞懸液可用于4℃貯存至一周。

     

    預制噬菌體懸液鋪平板

    以已知滴度(如,已知每ml噬菌體顆粒數)的cDNA文庫或其他噬菌體懸液開始,用λ-dil稀釋以達到所需每平板噬菌體數。每個90mm直徑平皿5×103個噬菌體/100μl開始篩選。

     

    鋪平板

    1.將所需數量的LB平板置42℃溫箱預熱。

    2.LB頂層瓊脂(每平板最少2.5ml)用微波爐熔化,然后置49℃水浴中。

    3.為溫箱內的每一個平板準備一個12ml帶螺旋蓋試管,于室溫,放在合適的架子上。

    4.用移液器每管加100μlλ-dil稀釋的宿主細胞懸液。

    5.每管加100μl稀釋的噬菌體懸液與細菌于漩渦器上簡短混合。

    6.含細菌和噬菌體(感染混合物)的試管于37℃溫育25min,然后室溫放置。

    7.用一支消毒的10ml玻璃移液管在本生燈火焰上稍稍預熱,取2.5ml保存在49℃的熔化頂層瓊脂加到一支含感染混合物的試管內。

    8.立即在手掌之間滾動混合管內混合物,然后均勻地倒入一個預熱的LB平板上。

    9.倒好的平板于室溫置水平面上直至頂層瓊脂凝固(至少5min)。

    10.  重復步驟79,直至所有的細菌和噬菌體混合物都鋪平板。

    11.  平板置42℃溫箱(對λgt11)直至噬菌斑長出。

     

    (二)雜交篩選——cDNA序列作為探針

    1.如上述將文庫鋪平板,噬菌斑雜交實驗用E.coli宿主菌株Y1088

    2.噬菌斑于42℃生長過夜。

    3.從溫箱取出平板,置4℃冷卻至少1h

    4.膜剝離:首先,用軟鉛筆在干的硝酸纖維素濾膜上給準備影印的平板編號。其次,從平板的中央開始向邊緣小心將濾膜鋪在菌臺上。當濾膜完全變濕后(顏色變灰),再等30s。同時,用針頭在平板上標出濾膜的3個不對稱位置。小心將濾膜從平板上剝離,接觸面向上放在一張干凈的Whatman 3MM濾紙上。在進行下一步驟之前,所有的平板重復步驟4

    5.將濾膜接觸面向上漂浮在變性液(0.5 mol/L NaOH; 1.5 mol/L NaCl)中5min

    6.中和5min

    7.2×SSC洗滌5min

    8.將濾膜放在一張新的Whatman 3MM濾紙上,用鉛箔將濾膜和濾紙一起包住。

    9.在真空爐中80℃烘烤2h

    10.  6×SSC預先短暫地濕潤濾膜,然后用預洗液(50 mmol/L Tris-Cl pH8.0; 1mol/L NaCl; 1mmol/L EDTA; 0.1% SDS)于68℃預洗滌至少1h。用一個盤子放在水浴搖床上。

    11.  25張濾膜轉移到一個裝有50ml雜交液(5×SSPE1×Denhardt’s液;100μg/ml cT-DNA0.1SDS)的貯存罐內(直徑至少90mm),68℃預雜交2h

    12.  對于每ml雜交液,2倍的1051×106cpm的雙鏈探針經沸水浴變性10min后,迅速放冰上冷卻。

    13.  變性探針立即加到預雜交混合液中。

    14.  在封口的貯存罐內于68℃雜交過夜,不斷地晃動以防濾膜粘在一起。

    15.  雜交結束后,濾膜用2×SSC0.01SDS于室溫洗滌3次約1h

    16.  將潮濕(防止干燥)的硝酸纖維素濾膜放在一張硬紙或X光片上,用放射性墨水在針頭標簽上作標記。

    17.  濾膜用塑料包裝袋(如Saran)包住,然后加上增感屏在X光片上于-70℃曝光過夜。

     

    (三)免疫篩選

    制備Sepharose偶聯細菌裂解液

    1.各用一個E.coli溫度敏感溶源菌株(BTA 282(λgt11amp3)或BNN 97)單菌落接種于2×7.5ml培養基并于32℃生長過夜。

    2.過夜培養物用LB培養基稀釋100倍,于32℃生長至OD600值為0.5

    3.45℃溫育15min誘導噬菌體表達。

    4.培養物于39℃進一步培養約2h

    5.測定噬菌體含量以便收集,氯仿測定操作步驟:3滴氯仿加到1ml培養物測試樣品中,混合物于37℃溫育。另一份不加氯仿的培養物作為平行對照。溫育5min后,測試樣品與對照比較。如果添加氯仿的測試細胞懸液清澈透明,細菌完全被吸附,剛好開始裂解,此時已可收集培養物。

    6.4℃以4000×g離心10min收獲細菌。

    7.從開始的兩份7.5ml培養物離心得到的細胞沉淀用冷的偶聯緩沖液重懸并再次離心。

    8.各用5ml冷的偶聯緩沖液重懸細胞沉淀。

    9.超聲波處理細胞懸液,直到粘度增加至不再釋放出核酸。

    10.  將細菌裂解物偶聯到預先制備好的溴化氰活化Sepharose 4B4℃過夜。

    11.  3000×g離心5min回收偶聯物。

    12.  用偶聯緩沖液重懸沉淀并再次離心。

    13.  為了飽和溴化氰活化Sepharose的未結合反應基團,沉淀物用冷(4℃)的飽和緩沖液重懸并在旋轉輪上于4℃溫育1h

    14.  通過三次連續的洗滌除去未吸附蛋白質,開始用洗滌緩沖液(pH4.0);然后轉換至pH8.0;最后一次洗滌pH4.0,在這個處理前后和每次洗滌之間,在4℃,2500×g離心5min,收集材料。

    15.  Sepharose偶聯細菌裂解液可以PBS懸液(+0.01%硫柳貢)于4℃貯存幾個星期。

     

    用于篩選的抗體預吸附

    1.濃度為0.51 mg/ml未稀釋的第一抗體和第二抗體(如過氧化物酶偶聯羊抗兔抗體,Calbiochem公司)分別用1.7倍體積的Sepharose偶聯細菌裂解液混合,并在旋轉輪子上于4℃溫育過夜。每次篩選循環約需要300μl已處理的第一抗體(最終工作稀釋度為1100)和15μl已處理的第二抗體(最終工作稀釋度為12000)。

    2.懸液加到少量玻璃棉填充的加樣器吸頭內。未封閉抗體用冷凍封閉液(至少5倍于柱體積)洗脫。

    3.用冷的封閉液調節洗脫出的抗體濃度至原先濃度的1/20。加入硫柳汞(終濃度0.01%)。

     

    鋪平板

    1.如上所述鋪制平板,作如下修改:

    a.       另外一支含2.5ml頂層瓊脂的12ml帶螺旋蓋試管置49℃水浴中以鋪制誘導對照平板。

    b.      在一份感染混合物中,用100μl噬菌體懸液含已知百分比的具有完整β-半乳糖苷酶基因的野生型噬菌體作為誘導對照。

    c.       在加相應感染混合物前,為鋪制誘導對照平板20μl X-gal立即加到2.5ml頂層瓊脂中。

  • <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 东京热 下载