一、原理
瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠是分離和純化DNA片段的標準方法。聚丙烯酰胺凝膠電泳適用于分離小分子的核酸；瓊脂糖凝膠孔徑較大，被應用于大分子核酸的分離和純化。在一定濃度的瓊脂糖凝膠介質中，DNA分子的電泳遷移率與其分子量的常用對數成反比。當用低濃度的熒光嵌入染料溴化乙啶（EB）染色，在紫外光下至少可以檢測出1~10ng的DNA條帶，從而可以確定DNA片段在凝膠中的位置。
二、實驗試劑
硼酸 Tris堿EDTAEB瓊脂糖溴芬蘭等
三、實驗步驟
(1)稀釋緩沖液的制備用5XTBE配置成0.5×TBE稀釋緩沖液,待用。
(2 ) 膠液的制備稱取0.4g瓊脂糖，置于200ml錐形瓶中，加入50ml 0.5×TBE
(3) 稀釋緩沖液，放入微波爐（或電爐）上加熱至瓊脂糖全部熔化，取出搖勻，此為0.8%瓊脂糖凝膠液。
(4) 膠板的制備將有機玻璃膠槽兩端分別用橡皮膏緊密封住。將封好的膠槽置于水平支持物上，插上樣品梳子。向冷卻至50～60℃的瓊脂糖膠液中加入溴化乙錠（EB）溶液，使其終濃度為0.5μg/ml。
(5) 加樣取5 μl提取的植物DNA溶液與2μl 6×上樣液混勻，用微量移液槍小心加入樣品槽中。
(6) 電泳加完樣后，合上電泳槽蓋，立即接通電源。控制電壓保持在60～80V，電流在40mA以上。
(7) 染色未加EB的膠板在電泳完畢后移入0.5μg/ml的EB溶液中,室溫下染色20～25分鐘。
(8) 觀察和拍照在波長為254nm的長波長紫外燈下觀察染色后的或以加有EB的電泳膠板，并繪區帶電泳圖制。
【注意】溴化乙錠是強誘變劑，具有高致癌性，要求在整個操作過程中必須帶一次性手套。
三、相關試劑配制
（1） 5xTBE緩沖液(100ml)：Tris-base5.4g
硼酸2.75g
0.5M的EDTA(pH8.0) 2ml
用滅菌水定容至100ml