DNA分析電泳儀分類有多種。
1、按分離裝置可分：毛細管DNA分析電泳儀和芯片DNA分析電泳儀等。
2、按進樣自動性可分：手動進樣DNA分析電泳儀和自動進樣DNA分析電泳儀。
3、按產地可分：國產DNA分析電泳儀和進口DNA分析電泳儀。
4、按分離裝置數量可分：一維DNA分析電泳儀和陣列DNA分析電泳儀等。
5、按分離原理可分：DNA分析色譜電泳儀、DNA分析區帶電泳儀、DNA分析凝膠電泳儀和DNA分析等電聚焦電泳儀等。
6、按分離特征可分：DNA分析電泳儀、高選擇性DNA分析電泳儀、高靈敏度DNA分析電泳儀和高分離度DNA分析電泳儀。