FFPE樣本核酸（DNA／RNA）制備

QIAamp DNA FFPE Tissue Kit —— 從石蠟包埋組織中純化基因組 DNA

• 專門優化的裂解及逆轉交聯 Buffer 確保 DNA 的高效釋放

• 30 分鐘內快速從蠟塊中純化高品質，即用型 DNA

• 洗脫體積靈活：從 20 μl 到 100 μl

• 單次制備樣本量可高達 8 塊蠟塊樣本

• 可在 QIAcube 上面進行自動化純化

RNeasy FFPE Kit —— 從石蠟包埋組織中純化總 RNA

• 優化的裂解和逆轉交聯 buffer 確保 RNA 的高效釋放

• 操作快速，在 85 分鐘內即可獲得純化的 RNA

• 含有 DNase，確保無基因組 DNA 的污染

• 可在 QIAcube 上進行自動化純化
  
  

從樣本中去除石蠟后，在優化的裂解緩沖液中，采用蛋白酶K酶切，只需15分鐘即可完成樣本裂解，且不影響RNA的產量。裂解后，將樣本置于80oC孵化15分鐘，逆轉福爾馬林交聯。然后使用DNase和DNase Booster Buffer高效去除基因組DNA，包括FFPE樣本中的小DNA片段。最后，使用RNeasy MinElute離心柱純化濃縮的RNA。RNA的洗脫體積僅為14–30 μl，因此可以減少下游操作中的反應體積。

使用RNeasy FFPE Kit從大鼠腎臟中純化總RNA。在Rotor-Gene Q實時熒光定量PCR分析儀上，使用（+RT）或不使用（-RT）逆轉錄酶進行PGK1（磷酸甘油酸激酶1）的real-time RT-PCR分析。-RT曲線證明，使用RNeasy FFPE Kit純化的RNA中幾乎不含基因組DNA。

miRNeasy FFPE Kit —— 從石蠟包埋組織純化包含 miRNA 的總 RNA

• 有效純化 miRNA 和總 RNA（見圖 3）

• 優化的裂解和逆轉交聯 buffer 確保 RNA 的高效釋放

• 含有 DNase，確保無基因組 DNA 的污染

采用福爾馬林固定大鼠肝臟組織24小時或60小時，然后使用miRNeasy FFPE Kit純化包括miRNA在內的總RNA。使用miScript PCR System和純化的RNA作為模板進行定量real-time RT-PCR分析，檢測miRNA miR-16和miR-29a以及PGK1基因的較大mRNA。結果顯示，從同一洗脫液中可同時檢測到上述兩種miRNA和mRNA。