實驗概要
本實驗詳細介紹了GST-pull down 技術的操作流程,主要包括:GST蛋白的大量制備,谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂的處理,GST蛋白的結合,細胞裂解液的預清除及細胞裂解液的探測。
實驗步驟
1. 大量制備GST蛋白
1) 活化凍存菌種GST和GST-X:按1:50比例將表達蛋白的凍存菌液加入5mlLB(Amp+),37℃,140~150rpm培養過夜
2) 將過夜培養物按1:100比例接入200mlLB(Amp+),220rpm,30℃培養至OD600=0.4-0.6
3) 以預實驗確定的最佳IPTG濃度、時間和溫度誘導表達靶蛋白。(IPTG 0.5mM,20℃,150rpm培養10~16小時)
4) 誘導適當時間后,4℃,5000g離心10min后棄上清。(如需要該步沉淀能保存在-80℃)
5) 重懸沉淀:10ml菌液沉淀用1ml PBS重懸
6) 冰上超聲沉淀重懸液:2S 間隔1S 至懸液透明(一般可容性蛋白:10ml菌液沉淀用1ml PBS重懸液超聲6~9min可透明)
7) 10,000g,10min離心上清轉移至新的離心管,加DTT至終濃度1mmol/L
2. 谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂的處理
1) 輕輕顛倒樹脂盛裝容器,混成勻漿
2) 取適量勻漿放入離心管中,4℃,500g離心5min后棄上清(每10ml 細菌培養物可以用50ul勻漿)
3) 每1.33mL 初始勻漿加入10 mL 4℃預冷的PBS,顛倒混勻后,4℃,500g離心5min后棄上清(50ul初始勻漿用400ulPBS洗)
4) 每1.33mL 初始勻漿加入1 mL 冷的PBS,制成50%勻漿,顛倒混勻置冰上放置待用。(50ul初始勻漿加入40ulPBS)
3. 結合GST蛋白
1) 上清與適量50%谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂勻漿混合,4℃輕搖30min(可過夜讓其充分結合)。
2) 4℃,500g離心5min后棄上清
3) 沉淀加入10倍床柱體積PBS(1床柱體積=0.5*50%勻漿體積)(50ul初始勻漿用400ulPBS洗),顛倒混勻以洗去未與樹脂結合的雜蛋白(每次可在混旋儀上混勻5min)
4) 4℃,500g離心5min后棄上清
5) 重復步驟3和4兩次,共三次
4. 預清除細胞裂解液
1) 將細胞裂解液與50ul的和GST結合的50%谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂懸液在4℃翻轉混合孵育2h。(需要檢測相互作用的裂解液的量是高度可變的。開始用相當于1×106~1×107個細胞的裂解液。)
2) 離心,4℃,13,000rpm,2min
3) 將上清轉移到新的離心管中
5. 探測細胞裂解液
1) 設定兩個等量預清除的細胞裂解液分別加入到結合GST和GST-X蛋白的谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂中,4℃翻轉混合孵育2h(時間可適當延長,如過夜以讓其充分結合)
2) 離心,4℃,13,000rpm,2min
3) 用1ml冰冷的細胞裂解液洗滌,4℃,13,000rpm,2min,棄上清,重復洗三次
4) 加入50ul的2×Loading Buffer。輕彈混勻,沸水煮5~10min,離心后收集上清。