GenomeBiology發布基因組測序重要成果

Genome Biology雜志發布了遠東豹（Far Eastern Amur leopard）的首個全基因組序列，為人們揭示了肉食對基因多樣性和種群規模的影響。

“我們將遠東豹基因組與其它哺乳動物基因組進行比較，發現肉食似乎是很強的選擇壓力。這種現象在雜食動物和食草動物中并不明顯。舉例來說，牛吃肉對其健康并沒有什么重要影響，但豹子吃草就會很快死亡，”文章作者Yunsung Cho解釋道。

特別的飲食會使動物發生生理、生化和形態上的適應。研究人員認為，肉食在進化上是一種不穩定的飲食方式。貓科動物基因多樣性相對較低，種群規模相對較小。這可能就是因為它們的飲食要求過于嚴格。

“與食肉有關的遺傳適應（比如極端的靈活性和肌肉力量）使遠東豹成為了成功的捕食者，但這種生活方式也使它們在遺傳上相當脆弱，”Mr. Cho解釋道。

研究人員用一只韓國雌性遠東豹的肌肉樣本進行基因組測序。隨后他們分析了18種哺乳動物的基因組，包括8種食肉動物（家貓、老虎、獵豹、獅子、美洲豹、北極熊、虎鯨和袋獾）、五種雜食動物（人類、小鼠、狗、豬和負鼠）和五種食草動物（大熊貓、奶牛、馬、兔子和大象）。研究顯示，食肉動物共享兩個獨特的基因，這兩個基因在骨骼發育和修復中起到了重要作用。研究人員希望遠東豹參考基因組可以成為有用工具，幫助人們理解貓科動物的進化，實施更有效的動物保護措施。

前不久，浙江大學和Nebraska大學的科學家們在Nature Genetics雜志上發布了異源多倍體芥菜型油菜（Brassica juncea）的基因組序列。油菜在植物分類上屬于十字花科蕓薹屬（Brassica genus），是世界廣泛種植的油料作物。這類植物擁有三個二倍體基因組和三個異源多倍體基因組。

長頸鹿是身高接近六米的龐然大物，它們擁有異乎尋常的長脖子和大長腿，并且能夠高速奔跑。科學家們首次完成了長頸鹿及其近親（okapi）的基因組測序，揭示了推動長頸鹿進化的遺傳學改變。這項研究發表在五月十七日的Nature Communications雜志上。

去年九月，沖繩科學技術研究院大學(OIST)、名古屋大學和東京大學的科學家們首次破解了“活化石”海豆芽（Lingula anatina）的基因組。他們分析了海豆芽基因組的三萬四千多個基因，發現海豆芽的基因組一直在積極的進化，并不能稱為活化石。