1.遺傳因素
多數認為該病與遺傳基因有密切的關系。家族中常可見到先后發病的病例，且多為女性。約有15%的患者有明顯的遺傳因素。患者的親屬約有一半血中存在甲狀腺自身抗體。甲亢的發生與人白細胞抗原（HLAⅡ類抗原）顯著相關，其檢出率因人種的不同而不同。
2.精神創傷
各種原因導致的精神過度興奮，或過度抑郁，均可導致甲狀腺激素的過度分泌，其機制可能是高度應激時腎上腺皮質激素的分泌急劇升高從而改變抑制性T淋巴細胞（Ts）或輔助性T淋巴細胞（Th）的功能，增強了免疫反應。
3.免疫系統異常
T淋巴細胞對甲狀腺內的抗原發生致敏反應，刺激B淋巴細胞，合成針對這些抗原的抗體。T細胞在甲亢中起重要作用。