這個項目在內部的代號被稱為“Jaynome”,它需要由Flatley的醫生開出處方,以備一旦科學家發現了與醫療相關的信息。實驗室花了幾個星期的時間和幾萬美元來檢測/演算基因組序列。“我們感受到壓力,但是在那時我們做了很多新的嘗試,”Illumina當時新來的生物信息學家Brad Sickler回憶道。Jay是世界上前十個進行這樣深度測序的人之一。
Jaynome實驗的結果提示了將基因測序引入臨床實踐的可能性,以及一些面臨的挑戰。Flatley得知,他患有一種名為惡性高熱(malignant hyperthermia)的疾病,在全身麻醉時可能導致猝死。“如果你了解這一點,它就是100%可預防的,”Flatley后來告訴我。“但只有很少人知道。”他還得知,能夠活著度過童年簡直是奇跡。就當時而言,篩選350-400萬的巨大變異庫并不是一件簡單的事,還沒有足夠多的數據可與之比較。
總之,Jaynome這個項目讓Flatley希望通過更便宜更易用的工具讓大眾了解他們的遺傳信息。而他的公司在這方面發揮了舉足輕重的作用。
如果您曾經使用過23andMe、Ancestry.com或其他任何遺傳學檢測服務,那么您的基因很有可能是在這個市值250億美元的生物技術巨頭所制造的儀器上測序的。如今,作為美國DNA測序領域公認的領導者,Illumina已經超越了其競爭對手,將測序硬件出售給世界各地的醫學研究人員。
它還是一個關鍵角色,推動基因測序的成本從2001年的1億美元降至今天的1千美元。正如《Nature》雜志曾經報道的,“這不僅僅是超過了摩爾定律 C 它使得當初這個一度很強大的有關“脫離控制的進展”的預言變得平淡無奇。”在過去,測序需要幾周的時間,而現在只要幾天就能完成 C 利用Illumina HiSeq X Ten測序儀中的一臺,16個人的基因組測序只需要三天。這臺儀器每年能夠測序18,000個人類基因組。
這項技術正迅速從實驗室轉移到醫院、診所,隨著消費者基因組學的到來,它甚至有可能出現在家庭。成立于1998年的Illumina,正在尋找新的途徑,通過新的應用來切入不斷增長的臨床和消費者市場,并成為在整個DNA生態系統的各個領域都很重要的公司。
與其他任何一家大公司一樣,Illumina的挑戰在于繼續創新,同時保持對其核心業務的控制。這家公司最近借鑒Alphabet的經驗,宣布了一系列“登月”級的企業Helix和Grail,這些公司將創建DNA信息學的App Store模型,將早期癌癥篩查檢測帶入每位醫生的辦公室。而經驗豐富的Apple高管Phil Schiller在今年夏天加入Illumina董事會,為這家生物技術公司注入了消費者營銷知識。
Schiller很久以前曾是麻省總醫院的系統分析師,后來他接管了Apple的App Store。他表示:“我們已經看到了計算機技術的這個周期。曾經是大型機,后來是辦公設備,如今則包括每臺手機、電視、汽車和音樂播放器。它們都屬于計算機。我認為整個基因測序將有可能經歷一場類似的演變,它將從僅在屈指可數的實驗室中擴展到自然的商業環境,到醫療機構和醫院,最終成為我們生活中都會使用的技術。”
另一個重大改變是, Flatley在這個夏天卸任了自己出任17年的職位。他的繼任者是MIT畢業的計算機科學家Francis deSouza,他曾在Symantec工作,加入Illumina是為了擴大公司在全球范圍的影響力,為公司出售的儀器及其他服務開發軟件產品。deSouza也在推行一些文化上的改變,包括為員工提供福利,如16個小時的帶薪志愿服務時間和免費獲得未確診疾病的篩查檢測。
不過批評者認為,對于Illumina來說,要界定出如何擴展到這些市場,而不侵犯其客戶的領地,這將是一個挑戰。許多創業公司已經進入臨床市場,其應用覆蓋方方面面,包括“液體活檢”檢測,晚期癌癥監控。根據商業咨詢公司Research and Markets的研究,到2020年后者的市場規模估計有10億美元。此外,它的應用還包括唐氏綜合征等遺傳病的無創產前篩查,到2022年這個市場的規模將達到24億美元。目前臨床和消費領域的大多數公司都依賴Illumina的儀器進行基本分析。
Illumina的聯合創始人和前首席運營官John Stuelpnagel表示:“我認為企業家、投資者和公司有時會對Illumina感到不安,擔心Illumina是否會選擇與他們競爭。”如果Illumina能夠挺過這一時期,許多人預測它將在未來五年挖掘到一座潛在的金礦。
“不到3%的人知道他們的基因組數據,”UBS的生物技術分析師Jonathan Groberg補充道。“這個機會就像20世紀70年代的互聯網。”
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