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  • 保質期、污染

     

    通常情況下,被檢測的生物產品在室溫下不穩定,或可能在凍融循環出現劣化、降解。這就要求在運輸期間對儲存條件進行精確跟蹤和記錄。Mosaic在樣品通過工程流時對其凍融循環進行自動計數。生物產品面臨的另一風險是微生物污染,尤其是對培養物上清液而言,因為培養物上清液按其定義即是處于營養豐富的培養基中。這可能需要將液體處理器設置在無菌環境中,例如設置在層流凈化罩中,且其位置可能不同于其它自動化程序。而這些對Mosaic系統而言都不是問題,因為它的設計使其可與多個位置使用的自動化設備進行整合。

     

    分析結果

     

    在檢測實驗完成后,分析實驗結果時很可能會需要實驗板的布局信息,而利用Mosaic系統中的微孔板布局信息則能大大加快計算過程。依據不同的樣品類型,Mosaic系統可將微孔板布局信息(物質、濃度、體積、孔位置)導出至專業分析軟件(如IDBS公司的ActivityBase)。例如,生物樣品和小分子化合物可能需要導出不同標識、濃度單位等。

     

     

    2Mosaic命令工作流示例 - 導出至ActivityBase的自動板視圖

     

    一個客戶案例分享

     

    在最近一個客戶案例中,由于組織職能整合,其化合物管理小組被要求準備用于抗體篩選的assay-ready實驗板。他們發現,除了準備傳統小分子化合物實驗板外,他們還需要準備大分子化合物實驗板。在液體處理方面,該小組能夠完成生物樣品實驗板實驗所需的布局要求和濃度,但僅依靠人工加樣方式和復雜的Excel表格來進行,還需專人對液體工作站進行編程控制。由于該小組已是Mosaic系統用戶(用于小分子化合物管理),因此他們再次找到我們,準備將Mosaic系統擴展到協助制作、管理生物樣品(抗體、siRNA)篩選的實驗板。

     

    輸入和登記注冊

     

    抗體樣品板最初提供給化合物管理組時隨帶附有電子表格,其中包含抗體的相關信息,但抗體未在別處進行登記注冊。

     

    第一步是要解決在Mosaic系統的登記系統中導入抗體板信息的問題。這一步的完成主要靠配置Mosaic的實驗器具導入模塊(Labware Importer),以識別含有相關抗體信息的Excel表。之后,簡單導入所提供的Excel表,即可在Mosaic中同時登記注冊抗體和其所涉及的微孔板。與小分子化合物一樣,抗體樣本在共存于同一Mosaic系統中,而Mosaic和外部注冊系統可無縫整合。

     

    工作流

     

    該小組為此項任務建立了新的工作流,用以管理抗體的任意選取(cherry pick)和連續稀釋。這些流程是按照Mosaic系統內現有的標準工作流步驟所建立,能幫助用戶定義所需的各個加樣步驟及目標板布局。例如(下圖),有的板內布局是以4個孔為單位,按Z型濃度順序進行的梯度稀釋(圖3)。

     

     

    3384Z型稀釋微孔板布局


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