與低分辨的實驗相比，在保持上樣量和色譜條件不變的前提下，僅僅改變質譜采集的分辨率，可以看到寡聚核苷酸的色譜保留時間不變，基本在 3.52 min 出峰，不過隨著質譜檢測器分辨率的提高，原始質譜圖發生了顯著的變化，如下所示，當使用線性離子阱 LTQ 作為質量檢測器時，只檢測到一個大包峰，無法分辨電荷；當使用 Orbitrap 作為質量檢測器，分辨率 R 設置為 15000 時，同樣也只檢測到一個大包峰，電荷仍然無法分辨；當使用 Orbitrap 作為質量檢測器，分辨率 R 設置為 30,000 時，可以觀察到一些同位素峰，電荷可以實現分辨；當使用 Orbitrap 作為質量檢測器，分辨率 R 設置為 60,000 時，可以觀察到稍微好一些的同位素峰，但無法完全分離，電荷同樣可以實現分辨；當使用 Orbitrap 作為質量檢測器，分辨率 R 設置為 120,000 時，同位素峰可以實現完全分離，電荷同樣也可以實現分辨；當使用 Orbitrap 作為質量檢測器，分辨率 R 設置為 240,000 時，同位素峰可以實現完全分離，并且峰形更加尖銳，電荷同樣也可以實現分辨，由此我們可以準確的計算得到寡聚核苷酸的單同位素質量和平均質量，最后的實驗結果與理論預測的分子質量保持完全一致。
同樣，我們對幾個不同分子質量的寡聚核苷酸進行了不同分辨率的質譜測試，結果如下所示：
從上面的質譜圖中，可以看到，隨著質譜分辨率的提高，寡聚核苷酸的同位素峰可以實現完全分離，并且峰寬更窄，電荷也可以實現完全分辨，并且無需軟件輔助，就可以直接計算得到寡聚核苷酸的單同位素質量和平均分子質量，使得寡聚核苷酸的分析測試更加快速和直接。
4. 結論
本文通過 LTQ-Orbitrap Elite 質譜建立了寡聚核酸藥物分子質量分析的色譜質譜在線方法，可以在核酸藥物的研發分析和實時生產檢測中，更加有效、靈敏、快速和精確的測定寡聚核苷酸的分子質量。實驗結果表明 LTQ-Orbitrap Elite 組合式質譜儀，憑借其超高的分辨率，超快的掃描速度，超高的質量精度、超低的靈敏度和超大的動態范圍，極大地完善和推動了基因藥物的鑒定分析。