Nature發布首張結核菌調控藍圖

　　結核分支桿菌(Mycobacterium tuberculosis)是肺結核TB的致病菌。人們已經對結核分支桿菌進行了多年研究，但至今還未能全面解析其適應性機制。現在，多家研究機構的一項大型研究，為人們展現了TB致病菌的基礎調控網絡，文章發表在本周的Nature雜志上。解析細菌的基因調控網絡，可以幫助人們理解細菌在宿主體內的生存機制，并在此基礎上開發有效的新治療方式。

　　據估計，世界上約三分之一的人體內潛伏著TB致病菌，這些致病菌大多在肺部處于休眠狀態。僅在2011年，全世界就有八百七十萬人患上肺結核，其中一百四十萬人死于這種疾病。人們認為，在TB的發病機制中，致病菌對低氧條件的適應非常關鍵。

　　“我們希望解析TB致病菌應對宿主環境條件改變的機制，包括對低氧條件的適應和對藥物干預的應答，”參與這項研究的David Sherman博士說。“我們需要分析致病菌基因和調控分子的關系，然后才能在此基礎上了解致病菌對環境改變的適應。”

　　ChIP-Seq技術可以用來分析蛋白與DNA的相互作用。研究人員在TB致病菌中，利用上述技術鑒定了50個調控性轉錄因子與DNA的結合，初步構建了TB基因的調控圖譜。這一調控網絡顯示，低氧應答和脂質代謝存在著直接關聯，該結論得到了后續實驗的驗證。

　　過去也有一些研究將轉錄因子與基因關聯起來，不過據Sherman介紹，這是首次構建綜合性的調控網絡。“在此之前，還沒有人對一個生物的所有轉錄因子進行ChIP-Seq，”他說。“這是迄今為止最全面的一份基因調控圖譜。”

　　這項研究可以使人們更加系統的看待，TB致病菌中的基因互作。研究人員強調，每一位肺結核研究者，都能從這份基因調控網絡中獲益。“肺結核研究者們可以在調控圖的幫助下，更好的理解目的基因與整體的關系，”他說。“解析不同基因組區域之間的聯系。”

　　研究人員正在對更多轉錄因子進行研究，不斷填充和完善TB的調控網絡。他們希望能夠在此基礎上，預測藥物對致病菌生存能力的影響，加速肺結核特效藥的研發。