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  • 發布時間:2014-01-27 10:34 原文鏈接: Nature里程碑成果:解析21種癌癥基因組

      針對21種癌癥類型開展大規模分析,一項里程碑式的研究揭示癌癥突變的世界遠比以前認為的要大得多。通過分析數以千計的患者腫瘤基因組,由Broad研究所領導的一個研究小組發現了許多的新癌癥基因,將與這些癌癥相關聯的已知基因目錄擴增了25%。此外,這項研究表明還有許多重要的癌基因有待發現。這項研究工作為未來的癌癥藥物研發奠定了重要的基礎,也證明了利用10萬個患者樣本來構建大量癌癥類型的綜合癌基因目錄是可行的。研究論文發表在《自然》(Nature)雜志上。

      論文的共同資深作者、Broad研究所所長Eric Lander說:“第一次,我們知道了怎樣做才能繪制出人類癌癥的完整基因組圖像。這極其令人感到興奮,因為掌握一些基因和它們的信號通路的知識,將闡明一些新的有潛力的藥物靶點,幫助開發出有效的聯合療法。”

      在過去的30年里,科學家們找到了一些證據證實,大約有135個基因是本研究分析的21種腫瘤類型中一種或多種癌癥的病因。這一新研究報告不僅證實了這些基因,還一下子將癌癥基因目錄擴增了四分之一。它揭示了33種在細胞死亡、細胞生長、基因組穩定性、免疫逃逸以及其他過程中發揮生物作用的基因。

      “我們需要捫心自問的一個基本問題是:我們有完整的圖像嗎?檢測癌癥基因組告訴了我們答案是否定的:還有更多的癌基因有待發現,”論文第一作者、Broad研究所計算生物學家Mike Lawrence說。

      共同資深作者、Broad研究所癌癥基因組計算分析研究組Gad Getz說:“我們可以說,我們當前的知識是不完整的,因為我們發現了許多新的癌基因。此外,隨著我們增加分析的樣本數基因發現物的數量也不斷地增長,我們可以說還有許多的基因有待發現。這一曲線仍然在上升!”

      研究人員估計,每種癌癥類型他們還將需要分析平均大約2000個樣本,或是跨越約50種腫瘤類型大約10萬個樣本,從而將絕大多數的這些突變編入目錄。“鑒于全球有大約3200萬癌癥人群,這是一個非常合理的研究數量,”Getz說。

      在分析的這些腫瘤類型中,一些存在大量突變的癌癥類型,例如黑色素瘤和肺癌;一些只則具有低頻突變,如橫紋肌樣瘤和髓母細胞瘤這兩種兒童腫瘤。

      研究人員總共分析了近5000個癌癥樣本基因組,將它們與來自正常組織的匹配樣本進行了比較。采用過去的幾年里該研究小組開拓的一些方法,他們重新發現了這些癌癥類型過去已知的幾乎所有癌癥驅動基因,驗證了他們的方法。

      研究小組指出了一些需要追蹤研究的改變基因,以確定哪些可作為藥物研發的重要靶點。此外,新研究工作還開拓了癌癥基因組學領域的視野,提供了一些誘人的線索即如果分析更多的樣本還有什么仍有待發現。

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