請你試想一下:將電極固定在活體動物的腦細胞上并記錄其電顫振,這得需要多大的技巧和耐心?神經生物學家Edward Boyden解答說,這項技術就是大名鼎鼎的“全細胞膜片鉗”(whole-cell patch-clamping),被奉為“神經科學中最精密的技術”,全球僅有幾十個實驗室專攻此術。
不過,研究者們正在試圖揭開這項技術神秘的面紗。他們的想法是:將它變為流水線式的自動化技術,使得任何實驗室只要利用機器人技術和可下載的源代碼,都可能嘗試完成。
弗吉尼亞州阿什本霍華德·休斯醫學研究所珍利亞研究園區(Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus)的神經科學家Karel Svoboda告訴我們,膜片鉗的啟用為進入神經回路提供了特殊的視角,可以說是一項非常激動人心的技術,只是的確未能得到充分的利用。這也就是將其自動化能夠成為確實令人激動萬分的研究方向的原因。
3月3日,美國麻省理工學院(劍橋)(Massachusetts Institute of Technology in Cambridge)的Boyden等人發表了文章,對如何組裝和操作全細胞膜片鉗自動化系統(此概念在2012年被首次提出)進行了詳細的指引。這份指南闡述了Boyden與Craig Forest實驗室(Craig Forest,亞特蘭大佐治亞理工學院(Georgia Institute of Technology)的一名機械工程師,專攻研究所需的機械自動化)合作所得的最新成果。
大多數神經記錄的過程是這樣的:將電極插入細胞間隙,收集神經元之間的電子齊射(electrical volleys)。這種“細胞外記錄”可檢測輸出信號,卻無法檢出細胞內部的電流活動(決定細胞是否產生興奮)。于是,能夠接入神經元細胞內部的全細胞膜片鉗技術就應運而生了。不過,Svoboda表示,雖然這項精細的技術并不難上手,但即便如此,還是有些人無法真正掌握它。
全細胞膜片鉗技術的程序包括:將一支纖細的玻璃吸管(內含帶金屬絲的電極)推入腦內。其中最常見的是盲法,即研究者在無法看見神經元的情況下完成操作。科學家必須持續地利用壓力,以避免大腦物質進入吸管。不過,當電極阻力升高時,意味著附近存在細胞,那么他們就必須在恰好的時機轉換成抽吸模式,封接一塊緊靠吸管極細尖端的微小神經元細胞膜。當再次迅速抽吸時,研究人員就能在細胞膜上穿出一個細微的小洞,用以記錄神經元的活動。若是以錯誤的角度碰擊神經元,那么就會產生錯誤的壓力調節和許多額外的變化,這往往會導致記錄脫靶。
對此,Boyden表示,操作的每個步驟都存在一定的失敗率,結果在整個過程中就會產生疊加。據有經驗的操作者報道,成功率大約為20%-60%。
因此,Boyden和Forest決定將這項復雜的技術自動化。他們的機器人目前還不能超越人類專家的技藝,但在小鼠試驗中的平均成功率約為33%。這個自動化裝置在商用編程平臺LabVIEW上運行,只需要研究人員將動物和吸液管定位即可。接著,會有一個計算機程序控制吸液管的內部壓力及其穿透腦部的推進。佐治亞州亞特蘭大一家名為Neuromatic Devices的公司提供基于Boyden和Forest技術的機器,但并未向《自然》(Nature)披露有關價格或銷售額的數據。
在德克薩斯大學奧斯汀分校(University of Texas at Austin),研究人員也研制了一個類似的自動修補的系統,該系統在MATLAB計算機環境下運行。這個系統在確定開始抽吸的節點時,沿用的程序與前面所述的稍有不同,它當時在小鼠膜片鉗細胞試驗中的成功率為17%。帶領該團隊的神經科學家Niraj Desai表示,他希望能夠整合更為完善的程序。不過,一些研究者質疑,機器的記錄到底能否超越技術最好的人類專家。倫敦大學學院(University College London)的神經科學家Michael Hausser表示,促使人類做出決定的因素可能會比機器能夠捕捉到的更為豐富。但他也補充說,這項技術對于新手來說仍然是一個重大利好。也有人提出,機器能夠協助各種技術水平的用戶完成冗長或復雜的試驗,畢竟人類會疲勞,這也是一個受限因素。
在華盛頓州西雅圖的艾倫腦科學研究所(Allen Institute for Brain Science),研究人員創制了一種自動化系統,能夠進行更具挑戰性的“畫面引導”試驗協助。在這個版本的系統中,人們不需要在盲目的情況下用吸液管插入神經元中,而是用雙光子顯微鏡來靶標大腦表面的特定神經元。整個過程比“盲”狀態下進行膜片鉗技術有更多的條件要求,這是因為科學家除了引導吸液管、調整其內部壓力之外,還必須不斷地進行顯微鏡對焦。對此,畫面引導膜片鉗修補技術的一位專家Hausser表示,這項技術之所以臻于完美,是因為能使人們同時擁有“三只手”,必能從中受益。
這項自動化技術可作出大腦目標區域的3D圖像,允許用戶用數字化選擇想要記錄的神經元。然后,裝置通過調控鎖定的目標,還能操控吸液管進入所需點。當然,目前為止,研究人員仍然還需通過手動來修補細胞,但艾倫研究所的神經科學家及聯合小組牽頭人Lu Li表示,他們希望,最終能夠完全自動化完成整個過程。
當然,這類自動化系統到底是否能夠為神經科學界廣泛利用,還需拭目以待。但每一個研制小組都已將代碼免費提供給人們下載,它們分別是:Boyden小組:autopatcher.org;Desai小組:clm.utexas.edu/robotpatch;Li小組:GitHub數據庫(go.nature. com/sgjpab)。正如Boyden所言,他們的希望,就是能盡可能地幫助更多的人解答關于神經元如何運行的問題。
此前已有研究發現,睡眠不足會對大腦造成嚴重破壞,導致學習能力下降、記憶混亂等。但其背后的機制仍存在許多不確定性。現在,一項針對小鼠的研究表明,上述睡眠不足導致的結果,部分可能源于腦細胞相互連接方式的改......
幾十年來,人們對癌癥和心臟病等常見疾病進行了大量研究,這些疾病的治療方法因此得到了極大的推進。然而,有許多疾病只影響少數人。這些疾病常常不受關注,相關研究也很少。其中包括很多罕見的遺傳性疾病,例如DO......
一項在老鼠身上進行的新研究可能解開了困擾部分人許久的謎團——暈動病。據最新一期《美國國家科學院院刊》報道,西班牙巴塞羅那自治大學的研究人員表示,他們已經弄清楚大腦中的哪些細胞會誤解內耳、眼睛和腿部的感......
當科學家第一次在顯微鏡下觀察大腦組織時,他們看到的是難以捉摸、雜亂無章的混沌狀態。19世紀,現代神經科學之父圣地亞哥·拉蒙·卡哈爾將這種體驗比作“走進了擁有千億棵樹的森林”。多年來,他試圖寫一本帶插圖......
12日,同時發表在《科學》《科學進展》和《科學·轉化醫學》雜志上的21項研究,公布并詳細解釋了迄今為止最全面的人類腦細胞圖譜。這些研究對3000多種人類腦細胞類型進行了特征分析,闡明了某些人類腦細胞與......
100多年來,科學家們一致認為,離散的腦細胞集合通過一系列相互連接的纖維向其他大腦區域發出信號。在一項新研究中,研究人員將數學模型應用于大腦活動,發現大腦功能可能更多地與形狀有關,而不是與連通性有關。......
盡管技術在不斷進步,但人腦在幾個方面仍然優于計算機。雖然計算機可以比人類更快地進行數學計算,但人腦能夠處理復雜的感官信息,并輕松地適應新的經驗。這種能力仍然是計算機無法企及的,而人腦在完成這一壯舉的同......
近日,約翰斯·霍普金斯大學隆伯格公共衛生學院教授ThomasHartung團隊在《科學前沿》雜志發布了一項“類器官智能”計劃。他表示,“計算機和人工智能一直在推動技術革命,但它們正在達到'天花......
澳大利亞昆士蘭大學研究人員表示,他們開展的一項臨床前試驗發現,猴頭菇中的一種活性化合物能促進神經生長,從而增強記憶力。相關研究刊發于最新一期《神經化學雜志》,有望為治療和預防阿爾茨海默病等神經退行性認......
培養皿中的人類和老鼠神經元學會了玩電子游戲Pong(乒乓)。這些實驗證明,即使是培養皿中的腦細胞也能表現出固有的智力,并隨著時間的推移而改變它們的行為。相關研究10月12日發表于《神經元》。“從蠕蟲到......