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  • 發布時間:2014-06-13 10:29 原文鏈接: Nature:深入第二套遺傳密碼

            基因的表達過程是將 DNA 上的遺傳信息傳遞給 mRNA, 然后再經過翻譯將其傳遞給蛋白質。在翻譯過程中 tRNA 負責與特定氨基酸結合,并將它們運送到核糖體,這些氨基酸在那里相互連接形成蛋白質。這一過程由 tRNA 合成酶介導,一旦出現問題就會生成錯誤的蛋白質,進而造成災難性的后果。值得慶幸的是, tRNA 分子與氨基酸的匹配非常精確,只不過迄今為止人們對這種機制還缺乏足夠的了解。

      日前,日本理化學研究所(RIKEN)、東京大學等機構的研究人員描述了一個確保 tRNA 合成酶、 tRNA 和氨基酸正確配對的巧妙機制。正是在這種機制的保駕護航之下,細胞才能夠將遺傳密碼精確翻譯成為細胞所需的功能性蛋白。相關研究論文刊登在了近期出版的《自然》雜志上。

      氨基酸與相應 tRNA 的結合是否準確,對于蛋白質能否正確合成非常重要。正因如此,人們也將氨基酸與 tRNA 的配對稱為第二套遺傳密碼。

      RIKEN 結構生物學實驗室的 Shigeyuki Yokoyama 領導團隊,利用晶體學技術對一種古生菌的 tRNA 配對進行了研究。他們發現,丙氨酰 -tRNA 合成酶通過幾何學特征精確識別 tRNA ,只允許丙氨酸的 tRNA 與酶的活性區域接觸。而這一過程依賴于一個擺動配對(wobble base pair)。 DNA 雙螺旋中的堿基配對原則很嚴格,即 A 配 T ,G 配 C。但 tRNA 反密碼子并不嚴格遵循這樣的原則,存在擺動配對或不穩定配對的現象。

      研究顯示,這種搖擺配對(G3?U70)位于 tRNA 的接納莖。研究人員對野生型 tRNA (G3?U70)和突變型 tRNA (A3?U70)進行了比較,發現突變 tRNA 雖然能與丙氨酰 -tRNA 合成酶結合,但無法接觸到活性區域,二者形成的復合物處于“無活性狀態”。

      研究人員指出, tRNA 合成酶只利用一個堿基對的差異,就實現了更準確地識別。與突變 tRNA 相比,野生 tRNA 的總體酶反應要快 100 倍。

      這項研究向人們展示,生物體可以利用微小的結構改變,實現遺傳密碼的精確翻譯。這種 tRNA 接納莖的識別機制,屬于第二套遺傳密碼的一部分,有助于人們進一步理解生物學機制的精密性。

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